MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2127	NC_012028	CGT	2	6	101026	101031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475768
2128	NC_012028	AGC	2	6	101046	101051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475768
2129	NC_012028	CGGG	2	8	101099	101106	0 %	0 %	75 %	25 %	222475768
2130	NC_012028	CGA	2	6	101116	101121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475768
2131	NC_012028	CGA	2	6	101194	101199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475768
2132	NC_012028	CCG	2	6	101224	101229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475768
2133	NC_012028	GAG	2	6	101234	101239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475768
2134	NC_012028	TCG	2	6	101364	101369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475768
2135	NC_012028	GGC	2	6	101370	101375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475768
2136	NC_012028	TCG	2	6	101379	101384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475768
2137	NC_012028	TGA	2	6	101446	101451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475768
2138	NC_012028	CCAGAT	2	12	101459	101470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222475768
2139	NC_012028	AGT	2	6	101584	101589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475768
2140	NC_012028	CTC	2	6	101627	101632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475768
2141	NC_012028	TCG	2	6	101646	101651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475768
2142	NC_012028	CAA	2	6	101659	101664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475768
2143	NC_012028	GTC	2	6	101666	101671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475768
2144	NC_012028	GT	3	6	101710	101715	0 %	50 %	50 %	0 %	222475768
2145	NC_012028	AGG	2	6	101728	101733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475768
2146	NC_012028	CGC	2	6	101805	101810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2147	NC_012028	ACG	2	6	101833	101838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2150	NC_012028	CGG	2	6	102010	102015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475769
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2152	NC_012028	TTG	2	6	102096	102101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_012028	TCT	2	6	102177	102182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475770
2154	NC_012028	GTC	2	6	102220	102225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475770
2155	NC_012028	GC	3	6	102265	102270	0 %	0 %	50 %	50 %	222475770
2156	NC_012028	ACC	3	9	102324	102332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475770
2157	NC_012028	ACG	2	6	102347	102352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475770
2158	NC_012028	TCG	2	6	102360	102365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475770
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2160	NC_012028	TCG	2	6	102407	102412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475770
2161	NC_012028	TCG	2	6	102419	102424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475770
2162	NC_012028	ATCG	2	8	102457	102464	25 %	25 %	25 %	25 %	222475770
2163	NC_012028	ATC	2	6	102469	102474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475770
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2166	NC_012028	GCT	2	6	102579	102584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475771
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2177	NC_012028	TGGG	2	8	103068	103075	0 %	25 %	75 %	0 %	222475771
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2194	NC_012028	TCG	2	6	103828	103833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475772
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2196	NC_012028	CT	3	6	103901	103906	0 %	50 %	0 %	50 %	222475772
2197	NC_012028	CTT	2	6	103940	103945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2198	NC_012028	CGATA	2	10	104005	104014	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2199	NC_012028	GTGA	2	8	104037	104044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2200	NC_012028	GTC	2	6	104189	104194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475773
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2215	NC_012028	CGT	2	6	104640	104645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475774
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2228	NC_012028	TCG	2	6	105068	105073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475774
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2230	NC_012028	CGC	2	6	105141	105146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475774
2231	NC_012028	GTC	2	6	105148	105153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475774
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2233	NC_012028	CACC	2	8	105240	105247	25 %	0 %	0 %	75 %	222475774
2234	NC_012028	CGA	2	6	105249	105254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475774
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2239	NC_012028	CGAGGA	2	12	105435	105446	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222475774
2240	NC_012028	TGC	2	6	105454	105459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475774
2241	NC_012028	CGCGC	2	10	105463	105472	0 %	0 %	40 %	60 %	222475774
2242	NC_012028	CAC	2	6	105486	105491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475774
2243	NC_012028	CCAG	2	8	105510	105517	25 %	0 %	25 %	50 %	222475774
2244	NC_012028	GAT	2	6	105589	105594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475774
2245	NC_012028	CGT	2	6	105651	105656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475774
2246	NC_012028	CGA	2	6	105675	105680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475774
2247	NC_012028	CCG	2	6	105707	105712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475774
2248	NC_012028	TCG	2	6	105719	105724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475774
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2349	NC_012028	TGA	2	6	110200	110205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2352	NC_012028	GAG	2	6	110516	110521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2353	NC_012028	TGC	2	6	110522	110527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2354	NC_012028	TCG	2	6	110543	110548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2357	NC_012028	CAA	2	6	110746	110751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2358	NC_012028	CCA	2	6	110803	110808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2360	NC_012028	ACTG	2	8	110882	110889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2363	NC_012028	CTC	2	6	111076	111081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475778
2364	NC_012028	CGG	3	9	111170	111178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475778
2365	NC_012028	CGA	2	6	111194	111199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475778
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2489	NC_012028	CGG	2	6	116816	116821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2490	NC_012028	GCT	2	6	116828	116833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2491	NC_012028	AAGCG	2	10	116932	116941	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2492	NC_012028	C	6	6	117123	117128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2493	NC_012028	AGC	2	6	117195	117200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2494	NC_012028	TGAAT	2	10	117210	117219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_012028	TCTGGA	2	12	117244	117255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2496	NC_012028	TCG	2	6	117387	117392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475783
2497	NC_012028	GAC	2	6	117461	117466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475783
2498	NC_012028	CA	3	6	117485	117490	50 %	0 %	0 %	50 %	222475783
2499	NC_012028	CGT	2	6	117697	117702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475783
2500	NC_012028	GATC	2	8	117811	117818	25 %	25 %	25 %	25 %	222475783

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