MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012028	CCG	2	6	47997	48002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475723
1002	NC_012028	CGA	2	6	48048	48053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1003	NC_012028	TCG	2	6	48086	48091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1004	NC_012028	ATC	2	6	48140	48145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475723
1005	NC_012028	GTC	2	6	48182	48187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1006	NC_012028	TCG	2	6	48191	48196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1007	NC_012028	CGCC	2	8	48258	48265	0 %	0 %	25 %	75 %	222475723
1008	NC_012028	CCA	2	6	48296	48301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475723
1009	NC_012028	TGT	2	6	48351	48356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475723
1010	NC_012028	CGC	2	6	48375	48380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475723
1011	NC_012028	CTG	2	6	48448	48453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1012	NC_012028	CCT	2	6	48471	48476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475723
1013	NC_012028	CTT	2	6	48481	48486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1014	NC_012028	CTT	2	6	48580	48585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1015	NC_012028	CTC	3	9	48616	48624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475723
1016	NC_012028	TCCA	2	8	48637	48644	25 %	25 %	0 %	50 %	222475723
1017	NC_012028	CTC	2	6	48736	48741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475723
1018	NC_012028	TCT	2	6	48746	48751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1019	NC_012028	CCGT	2	8	48777	48784	0 %	25 %	25 %	50 %	222475723
1020	NC_012028	TTC	2	6	48883	48888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1021	NC_012028	CGT	2	6	48942	48947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1022	NC_012028	TCG	2	6	48953	48958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1023	NC_012028	CTT	2	6	48970	48975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1024	NC_012028	CAC	2	6	48996	49001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475723
1025	NC_012028	TCA	2	6	49028	49033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475723
1026	NC_012028	CG	3	6	49035	49040	0 %	0 %	50 %	50 %	222475723
1027	NC_012028	TCGCG	2	10	49116	49125	0 %	20 %	40 %	40 %	222475723
1028	NC_012028	ATC	2	6	49141	49146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475723
1029	NC_012028	TCG	2	6	49163	49168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1030	NC_012028	CTC	2	6	49183	49188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475723
1031	NC_012028	GCA	2	6	49217	49222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1032	NC_012028	CGT	2	6	49248	49253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1033	NC_012028	CAC	2	6	49260	49265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475723
1034	NC_012028	T	7	7	49331	49337	0 %	100 %	0 %	0 %	222475723
1035	NC_012028	CGA	2	6	49338	49343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1036	NC_012028	TG	3	6	49386	49391	0 %	50 %	50 %	0 %	222475723
1037	NC_012028	TCA	2	6	49394	49399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475723
1038	NC_012028	GTC	2	6	49402	49407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1039	NC_012028	CGT	2	6	49456	49461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1040	NC_012028	TC	3	6	49489	49494	0 %	50 %	0 %	50 %	222475723
1041	NC_012028	CGT	2	6	49551	49556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1042	NC_012028	CT	3	6	49565	49570	0 %	50 %	0 %	50 %	222475723
1043	NC_012028	TTC	2	6	49594	49599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1044	NC_012028	GATT	2	8	49657	49664	25 %	50 %	25 %	0 %	222475723
1045	NC_012028	GAGC	2	8	49673	49680	25 %	0 %	50 %	25 %	222475723
1046	NC_012028	CTT	2	6	49689	49694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1047	NC_012028	CGG	2	6	49719	49724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475723
1048	NC_012028	CGT	2	6	49740	49745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1049	NC_012028	TCC	2	6	49784	49789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475723
1050	NC_012028	TTC	2	6	49846	49851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1051	NC_012028	GTC	2	6	49921	49926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1052	NC_012028	TCG	2	6	49994	49999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1053	NC_012028	TCT	2	6	50022	50027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1054	NC_012028	TCC	2	6	50060	50065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475723
1055	NC_012028	GCAG	2	8	50066	50073	25 %	0 %	50 %	25 %	222475723
1056	NC_012028	CTT	2	6	50086	50091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1057	NC_012028	CTT	2	6	50128	50133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475723
1058	NC_012028	AGG	2	6	50192	50197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475723
1059	NC_012028	ACGA	2	8	50279	50286	50 %	0 %	25 %	25 %	222475723
1060	NC_012028	GAG	2	6	50366	50371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475723
1061	NC_012028	CTTG	2	8	50385	50392	0 %	50 %	25 %	25 %	222475723
1062	NC_012028	TCG	5	15	50411	50425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475723
1063	NC_012028	GCCT	2	8	50467	50474	0 %	25 %	25 %	50 %	222475723
1064	NC_012028	TGCG	2	8	50507	50514	0 %	25 %	50 %	25 %	222475723
1065	NC_012028	TGG	2	6	50598	50603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475723
1066	NC_012028	CTA	2	6	50730	50735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_012028	TTC	2	6	50746	50751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475724
1068	NC_012028	TTCT	2	8	50773	50780	0 %	75 %	0 %	25 %	222475724
1069	NC_012028	TG	4	8	50793	50800	0 %	50 %	50 %	0 %	222475724
1070	NC_012028	GTCATC	2	12	50818	50829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222475724
1071	NC_012028	GTC	2	6	50836	50841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475724
1072	NC_012028	TGG	2	6	50871	50876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475724
1073	NC_012028	CAT	2	6	50898	50903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475724
1074	NC_012028	TCA	2	6	50984	50989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475724
1075	NC_012028	GGCG	2	8	51069	51076	0 %	0 %	75 %	25 %	222475724
1076	NC_012028	ACG	2	6	51077	51082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475724
1077	NC_012028	GTC	2	6	51097	51102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475724
1078	NC_012028	CCG	2	6	51110	51115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475724
1079	NC_012028	ACGG	2	8	51189	51196	25 %	0 %	50 %	25 %	222475724
1080	NC_012028	CGC	2	6	51444	51449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475724
1081	NC_012028	TGA	2	6	51660	51665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475724
1082	NC_012028	ATCC	2	8	51667	51674	25 %	25 %	0 %	50 %	222475724
1083	NC_012028	AGGAA	2	10	51716	51725	60 %	0 %	40 %	0 %	222475724
1084	NC_012028	CCGA	2	8	51742	51749	25 %	0 %	25 %	50 %	222475724
1085	NC_012028	ATGA	2	8	51814	51821	50 %	25 %	25 %	0 %	222475724
1086	NC_012028	CGG	2	6	51887	51892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475724
1087	NC_012028	GAG	2	6	52322	52327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012028	CCG	2	6	52357	52362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475725
1089	NC_012028	TGCT	2	8	52391	52398	0 %	50 %	25 %	25 %	222475725
1090	NC_012028	GAT	2	6	52507	52512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475725
1091	NC_012028	TCGTAG	2	12	52546	52557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222475725
1092	NC_012028	TCG	2	6	52567	52572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1093	NC_012028	CGG	2	6	52583	52588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475725
1094	NC_012028	GCC	2	6	52623	52628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475725
1095	NC_012028	TCT	2	6	52670	52675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475725
1096	NC_012028	TCG	2	6	52723	52728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1097	NC_012028	CGG	2	6	52747	52752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475725
1098	NC_012028	TCCCGT	2	12	52766	52777	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222475725
1099	NC_012028	GTT	2	6	52787	52792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475725
1100	NC_012028	CGG	2	6	52804	52809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475725
1101	NC_012028	CGT	2	6	52961	52966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1102	NC_012028	TGG	2	6	53000	53005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475725
1103	NC_012028	AGT	2	6	53021	53026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475725
1104	NC_012028	TCT	2	6	53051	53056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475725
1105	NC_012028	GAT	2	6	53070	53075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475725
1106	NC_012028	CGC	2	6	53108	53113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475725
1107	NC_012028	CGT	2	6	53132	53137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1108	NC_012028	TGC	2	6	53239	53244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1109	NC_012028	TGA	2	6	53271	53276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475725
1110	NC_012028	TGG	2	6	53450	53455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475725
1111	NC_012028	CGA	2	6	53456	53461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1112	NC_012028	ATC	2	6	53464	53469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475725
1113	NC_012028	TCG	2	6	53470	53475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1114	NC_012028	GGAC	2	8	53510	53517	25 %	0 %	50 %	25 %	222475725
1115	NC_012028	GTT	2	6	53550	53555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475725
1116	NC_012028	GCG	2	6	53567	53572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475725
1117	NC_012028	CGC	2	6	53600	53605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475725
1118	NC_012028	TCG	2	6	53629	53634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1119	NC_012028	TCT	2	6	53672	53677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475725
1120	NC_012028	CGTC	2	8	53711	53718	0 %	25 %	25 %	50 %	222475725
1121	NC_012028	CGA	2	6	53741	53746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1122	NC_012028	TCG	3	9	53764	53772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1123	NC_012028	TTC	2	6	53847	53852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475725
1124	NC_012028	TCG	2	6	53869	53874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1125	NC_012028	GTC	2	6	53886	53891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1126	NC_012028	AGC	2	6	53952	53957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475725
1127	NC_012028	TTC	2	6	54015	54020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475725
1128	NC_012028	TCC	2	6	54034	54039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475725
1129	NC_012028	GAG	2	6	54060	54065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475725
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1133	NC_012028	TTC	2	6	54274	54279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475725
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1137	NC_012028	CCGTG	2	10	54633	54642	0 %	20 %	40 %	40 %	222475725
1138	NC_012028	CGACGC	2	12	54675	54686	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_012028	C	6	6	54904	54909	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1140	NC_012028	TCG	2	6	54936	54941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1153	NC_012028	AGGT	2	8	55694	55701	25 %	25 %	50 %	0 %	222475726
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1156	NC_012028	GGGCG	2	10	55946	55955	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1157	NC_012028	TCT	2	6	56017	56022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1158	NC_012028	GT	3	6	56052	56057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_012028	CCT	2	6	56074	56079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1162	NC_012028	ACTC	2	8	56160	56167	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1163	NC_012028	TCG	2	6	56242	56247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475727
1164	NC_012028	CGT	2	6	56253	56258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475727
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1223	NC_012028	TCG	2	6	59523	59528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475730
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1235	NC_012028	GGCAT	2	10	59941	59950	20 %	20 %	40 %	20 %	222475731
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1245	NC_012028	TGG	3	9	60624	60632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475732
1246	NC_012028	GGC	2	6	60683	60688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475732
1247	NC_012028	CTCG	2	8	60715	60722	0 %	25 %	25 %	50 %	222475732
1248	NC_012028	GAAA	2	8	60773	60780	75 %	0 %	25 %	0 %	222475732
1249	NC_012028	GTCA	2	8	60809	60816	25 %	25 %	25 %	25 %	222475732
1250	NC_012028	TCCGT	2	10	60828	60837	0 %	40 %	20 %	40 %	222475732
1251	NC_012028	GAT	2	6	60873	60878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475732
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1253	NC_012028	GAA	2	6	60989	60994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475732
1254	NC_012028	TCC	2	6	61029	61034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475732
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1256	NC_012028	CGG	2	6	61170	61175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_012028	CGG	3	9	61190	61198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1373	NC_012028	GTATA	2	10	66929	66938	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1374	NC_012028	TCTG	2	8	67001	67008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1500	NC_012028	AC	3	6	74080	74085	50 %	0 %	0 %	50 %	222475745

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