MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012028	TCG	2	6	522679	522684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476154
11502	NC_012028	GAA	2	6	522704	522709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476154
11503	NC_012028	CGG	2	6	522716	522721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476154
11504	NC_012028	TCG	2	6	522850	522855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476154
11505	NC_012028	ATCA	2	8	522879	522886	50 %	25 %	0 %	25 %	222476154
11506	NC_012028	GTCAA	2	10	522931	522940	40 %	20 %	20 %	20 %	222476154
11507	NC_012028	GGC	2	6	522948	522953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476154
11508	NC_012028	CGA	2	6	523001	523006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476154
11509	NC_012028	GAGC	2	8	523037	523044	25 %	0 %	50 %	25 %	222476154
11510	NC_012028	ATC	2	6	523050	523055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476154
11511	NC_012028	GCCTT	2	10	523075	523084	0 %	40 %	20 %	40 %	222476154
11512	NC_012028	CAGC	2	8	523284	523291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11513	NC_012028	GA	3	6	523351	523356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_012028	TGA	3	9	523360	523368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_012028	TTG	2	6	523404	523409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_012028	GATCA	2	10	523420	523429	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11517	NC_012028	GC	3	6	523473	523478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11518	NC_012028	GATA	2	8	523585	523592	50 %	25 %	25 %	0 %	222476155
11519	NC_012028	GAT	2	6	523598	523603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476155
11520	NC_012028	ACG	2	6	523656	523661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11521	NC_012028	GGA	2	6	523728	523733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476155
11522	NC_012028	ATC	2	6	523743	523748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476155
11523	NC_012028	GTC	2	6	523754	523759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11524	NC_012028	CGG	2	6	523778	523783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476155
11525	NC_012028	GAG	2	6	523805	523810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476155
11526	NC_012028	CTT	2	6	523918	523923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476155
11527	NC_012028	GAC	2	6	524014	524019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11528	NC_012028	AGA	2	6	524074	524079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476155
11529	NC_012028	CGA	2	6	524107	524112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11530	NC_012028	CACG	2	8	524176	524183	25 %	0 %	25 %	50 %	222476155
11531	NC_012028	CAG	2	6	524231	524236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11532	NC_012028	AGTC	2	8	524243	524250	25 %	25 %	25 %	25 %	222476155
11533	NC_012028	ATC	2	6	524315	524320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476155
11534	NC_012028	TTC	2	6	524336	524341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476155
11535	NC_012028	GA	3	6	524346	524351	50 %	0 %	50 %	0 %	222476155
11536	NC_012028	ATCG	2	8	524419	524426	25 %	25 %	25 %	25 %	222476155
11537	NC_012028	ACG	2	6	524532	524537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11538	NC_012028	GTG	2	6	524544	524549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476155
11539	NC_012028	CAT	2	6	524623	524628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476155
11540	NC_012028	CGTGAT	2	12	524675	524686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222476155
11541	NC_012028	CGA	2	6	524716	524721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11542	NC_012028	ATC	2	6	524753	524758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476155
11543	NC_012028	TGA	2	6	524767	524772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476155
11544	NC_012028	CGT	2	6	524789	524794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11545	NC_012028	CAG	2	6	524798	524803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11546	NC_012028	TCGG	2	8	524913	524920	0 %	25 %	50 %	25 %	222476155
11547	NC_012028	CAAT	2	8	524937	524944	50 %	25 %	0 %	25 %	222476155
11548	NC_012028	CAG	2	6	524978	524983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11549	NC_012028	GTC	2	6	525005	525010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11550	NC_012028	CCCGAC	2	12	525041	525052	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222476155
11551	NC_012028	CGA	2	6	525055	525060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11552	NC_012028	GGA	2	6	525070	525075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476155
11553	NC_012028	GAG	2	6	525278	525283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476155
11554	NC_012028	CGA	2	6	525310	525315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11555	NC_012028	TCG	2	6	525399	525404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11556	NC_012028	GT	3	6	525414	525419	0 %	50 %	50 %	0 %	222476155
11557	NC_012028	GGC	2	6	525460	525465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476155
11558	NC_012028	CGA	3	9	525532	525540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11559	NC_012028	CGT	2	6	525597	525602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476155
11560	NC_012028	TGGG	2	8	525652	525659	0 %	25 %	75 %	0 %	222476155
11561	NC_012028	GAT	2	6	525703	525708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476155
11562	NC_012028	ATG	2	6	525730	525735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_012028	CA	3	6	525750	525755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11564	NC_012028	TA	3	6	525821	525826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_012028	TAC	2	6	525859	525864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_012028	GAAG	2	8	525880	525887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_012028	TTCAA	2	10	525895	525904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11568	NC_012028	CAA	7	21	525914	525934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.