MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012028	TGG	2	6	499629	499634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476133
11002	NC_012028	ACG	2	6	499655	499660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11003	NC_012028	GTC	2	6	499702	499707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11004	NC_012028	GAAC	2	8	499779	499786	50 %	0 %	25 %	25 %	222476133
11005	NC_012028	GTG	2	6	499799	499804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476133
11006	NC_012028	CGA	2	6	499908	499913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11007	NC_012028	CGA	2	6	499983	499988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11008	NC_012028	A	6	6	499999	500004	100 %	0 %	0 %	0 %	222476133
11009	NC_012028	GAAACG	2	12	500017	500028	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222476133
11010	NC_012028	TGA	2	6	500046	500051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476133
11011	NC_012028	GGA	2	6	500130	500135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
11012	NC_012028	GAA	2	6	500256	500261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
11013	NC_012028	ACT	2	6	500331	500336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476133
11014	NC_012028	GGA	2	6	500337	500342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
11015	NC_012028	CG	3	6	500380	500385	0 %	0 %	50 %	50 %	222476133
11016	NC_012028	AGTC	2	8	500386	500393	25 %	25 %	25 %	25 %	222476133
11017	NC_012028	GGA	2	6	500397	500402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
11018	NC_012028	TGGC	2	8	500404	500411	0 %	25 %	50 %	25 %	222476133
11019	NC_012028	ACG	2	6	500435	500440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11020	NC_012028	TC	3	6	500479	500484	0 %	50 %	0 %	50 %	222476133
11021	NC_012028	TCG	2	6	500543	500548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11022	NC_012028	CTG	2	6	500549	500554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11023	NC_012028	TCT	2	6	500558	500563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476133
11024	NC_012028	GC	3	6	500574	500579	0 %	0 %	50 %	50 %	222476133
11025	NC_012028	TCGCA	2	10	500617	500626	20 %	20 %	20 %	40 %	222476133
11026	NC_012028	CCG	2	6	500653	500658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222476133
11027	NC_012028	ACG	2	6	500705	500710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11028	NC_012028	GGA	2	6	500805	500810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
11029	NC_012028	GCGCC	2	10	500840	500849	0 %	0 %	40 %	60 %	222476133
11030	NC_012028	ACG	2	6	500912	500917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11031	NC_012028	AG	3	6	500934	500939	50 %	0 %	50 %	0 %	222476133
11032	NC_012028	CGA	2	6	500952	500957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11033	NC_012028	CCGC	2	8	500969	500976	0 %	0 %	25 %	75 %	222476133
11034	NC_012028	GAA	2	6	500977	500982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
11035	NC_012028	ACG	2	6	501011	501016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11036	NC_012028	CAG	2	6	501073	501078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11037	NC_012028	CGA	2	6	501165	501170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11038	NC_012028	GGATCT	2	12	501180	501191	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222476133
11039	NC_012028	GGA	2	6	501258	501263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
11040	NC_012028	GAA	2	6	501301	501306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
11041	NC_012028	AAG	2	6	501340	501345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
11042	NC_012028	AGA	2	6	501366	501371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
11043	NC_012028	CGA	2	6	501405	501410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11044	NC_012028	CAGG	2	8	501447	501454	25 %	0 %	50 %	25 %	222476133
11045	NC_012028	CGA	2	6	501462	501467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11046	NC_012028	GAT	2	6	501508	501513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476133
11047	NC_012028	GAC	2	6	501532	501537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11048	NC_012028	TGC	2	6	501540	501545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11049	NC_012028	TGG	2	6	501563	501568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476133
11050	NC_012028	AGG	2	6	501578	501583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
11051	NC_012028	CGA	2	6	501584	501589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11052	NC_012028	GAC	2	6	501636	501641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11053	NC_012028	GCCGAA	2	12	501679	501690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11054	NC_012028	GT	3	6	501695	501700	0 %	50 %	50 %	0 %	222476133
11055	NC_012028	CGA	2	6	501702	501707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11056	NC_012028	AAG	2	6	501715	501720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
11057	NC_012028	TCG	2	6	501788	501793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11058	NC_012028	CAG	2	6	501796	501801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11059	NC_012028	CGA	2	6	501831	501836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11060	NC_012028	CGA	2	6	501852	501857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11061	NC_012028	CTCG	2	8	501895	501902	0 %	25 %	25 %	50 %	222476133
11062	NC_012028	CGA	2	6	501939	501944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11063	NC_012028	CTG	2	6	501959	501964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11064	NC_012028	TCG	2	6	501998	502003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11065	NC_012028	GAC	2	6	502027	502032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11066	NC_012028	CA	3	6	502067	502072	50 %	0 %	0 %	50 %	222476133
11067	NC_012028	CGA	2	6	502188	502193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11068	NC_012028	CTC	2	6	502281	502286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476133
11069	NC_012028	TCG	2	6	502343	502348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11070	NC_012028	GTG	2	6	502367	502372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476133
11071	NC_012028	AGT	2	6	502414	502419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476133
11072	NC_012028	CGA	2	6	502428	502433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
11073	NC_012028	GAAT	2	8	502530	502537	50 %	25 %	25 %	0 %	222476133
11074	NC_012028	ATC	2	6	502612	502617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476133
11075	NC_012028	TGA	2	6	502629	502634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476133
11076	NC_012028	TC	3	6	502640	502645	0 %	50 %	0 %	50 %	222476133
11077	NC_012028	GAA	2	6	502648	502653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
11078	NC_012028	GAAA	2	8	502763	502770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_012028	ATA	2	6	502805	502810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_012028	AACA	2	8	502851	502858	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11081	NC_012028	GTG	2	6	502938	502943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_012028	ACC	2	6	503047	503052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11083	NC_012028	CGA	2	6	503078	503083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_012028	AGG	2	6	503104	503109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_012028	CGT	2	6	503144	503149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_012028	GAA	2	6	503182	503187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_012028	GAG	2	6	503252	503257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_012028	GAC	2	6	503284	503289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_012028	CTT	2	6	503372	503377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476134
11090	NC_012028	TTCG	2	8	503378	503385	0 %	50 %	25 %	25 %	222476134
11091	NC_012028	CTG	2	6	503388	503393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11092	NC_012028	ACA	2	6	503404	503409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222476134
11093	NC_012028	CAT	2	6	503429	503434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476134
11094	NC_012028	CTG	2	6	503514	503519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11095	NC_012028	CCT	2	6	503573	503578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476134
11096	NC_012028	CTCG	2	8	503585	503592	0 %	25 %	25 %	50 %	222476134
11097	NC_012028	GTC	2	6	503595	503600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11098	NC_012028	TAT	2	6	503604	503609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222476134
11099	NC_012028	GCT	2	6	503969	503974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11100	NC_012028	CTA	2	6	503977	503982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476134
11101	NC_012028	TC	3	6	503993	503998	0 %	50 %	0 %	50 %	222476134
11102	NC_012028	TGC	2	6	504004	504009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11103	NC_012028	TC	4	8	504035	504042	0 %	50 %	0 %	50 %	222476134
11104	NC_012028	CG	4	8	504043	504050	0 %	0 %	50 %	50 %	222476134
11105	NC_012028	GGT	2	6	504092	504097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476134
11106	NC_012028	TCT	2	6	504100	504105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476134
11107	NC_012028	ACT	2	6	504106	504111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476134
11108	NC_012028	AG	3	6	504127	504132	50 %	0 %	50 %	0 %	222476134
11109	NC_012028	CTC	2	6	504193	504198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476134
11110	NC_012028	GGAT	2	8	504237	504244	25 %	25 %	50 %	0 %	222476134
11111	NC_012028	CTCC	2	8	504310	504317	0 %	25 %	0 %	75 %	222476134
11112	NC_012028	CTT	2	6	504413	504418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476134
11113	NC_012028	GAC	2	6	504444	504449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11114	NC_012028	TC	3	6	504464	504469	0 %	50 %	0 %	50 %	222476134
11115	NC_012028	CTG	2	6	504477	504482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11116	NC_012028	CTC	2	6	504483	504488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476134
11117	NC_012028	GTC	2	6	504498	504503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11118	NC_012028	TC	3	6	504502	504507	0 %	50 %	0 %	50 %	222476134
11119	NC_012028	CTG	2	6	504522	504527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
11120	NC_012028	CTT	2	6	504560	504565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476134
11121	NC_012028	TGG	2	6	504628	504633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476134
11122	NC_012028	GAC	2	6	504752	504757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_012028	TA	3	6	504834	504839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_012028	AC	3	6	504967	504972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11125	NC_012028	CGC	2	6	504988	504993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11126	NC_012028	AAGA	2	8	505006	505013	75 %	0 %	25 %	0 %	222476135
11127	NC_012028	CGA	2	6	505069	505074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
11128	NC_012028	TCC	2	6	505077	505082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476135
11129	NC_012028	CGA	2	6	505180	505185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
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11132	NC_012028	ACC	2	6	505253	505258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222476135
11133	NC_012028	ACT	2	6	505329	505334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476135
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11138	NC_012028	CGA	2	6	505603	505608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
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11144	NC_012028	ACG	2	6	505839	505844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
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11149	NC_012028	GAC	2	6	506074	506079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
11150	NC_012028	CA	3	6	506094	506099	50 %	0 %	0 %	50 %	222476135
11151	NC_012028	GTGA	2	8	506126	506133	25 %	25 %	50 %	0 %	222476135
11152	NC_012028	ACA	2	6	506155	506160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222476135
11153	NC_012028	ACA	2	6	506167	506172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222476136
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11156	NC_012028	CA	3	6	506334	506339	50 %	0 %	0 %	50 %	222476136
11157	NC_012028	GAT	2	6	506363	506368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476136
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11160	NC_012028	TGCG	2	8	506543	506550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11161	NC_012028	AAG	2	6	506657	506662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11162	NC_012028	TCG	2	6	506708	506713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11165	NC_012028	GTC	2	6	506808	506813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11167	NC_012028	ACC	2	6	506852	506857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11168	NC_012028	GAC	2	6	506864	506869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11170	NC_012028	ATC	2	6	506904	506909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11202	NC_012028	ATTCT	2	10	508479	508488	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11203	NC_012028	TTA	2	6	508526	508531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11207	NC_012028	TTCT	2	8	508605	508612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11208	NC_012028	CTTT	2	8	508625	508632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11209	NC_012028	CA	3	6	508695	508700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11210	NC_012028	TC	3	6	508864	508869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11211	NC_012028	CAA	2	6	508922	508927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11215	NC_012028	TC	3	6	509042	509047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11216	NC_012028	CG	3	6	509143	509148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11217	NC_012028	AATG	2	8	509163	509170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11218	NC_012028	GTG	2	6	509196	509201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11222	NC_012028	GTTC	2	8	509678	509685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11223	NC_012028	GA	3	6	509710	509715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11224	NC_012028	TTCG	2	8	509806	509813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11225	NC_012028	CTG	2	6	509841	509846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11229	NC_012028	ATG	2	6	510141	510146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_012028	TCG	2	6	510169	510174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11231	NC_012028	CGC	2	6	510186	510191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11232	NC_012028	GCGAT	2	10	510194	510203	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11233	NC_012028	TTGA	2	8	510219	510226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11234	NC_012028	GAT	2	6	510227	510232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11235	NC_012028	CGT	2	6	510420	510425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11237	NC_012028	CCG	2	6	510535	510540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11238	NC_012028	AGT	2	6	510553	510558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11239	NC_012028	GTC	2	6	510651	510656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476139
11240	NC_012028	AGCG	2	8	510729	510736	25 %	0 %	50 %	25 %	222476139
11241	NC_012028	TTC	2	6	510816	510821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476139
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11243	NC_012028	CGAC	2	8	510833	510840	25 %	0 %	25 %	50 %	222476139
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11365	NC_012028	GCT	2	6	516637	516642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476145
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11467	NC_012028	GAC	2	6	521139	521144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11483	NC_012028	CGT	2	6	521970	521975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11484	NC_012028	AT	3	6	522013	522018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11485	NC_012028	CAA	2	6	522035	522040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11486	NC_012028	ACA	2	6	522061	522066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11487	NC_012028	GTC	2	6	522067	522072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11488	NC_012028	GTC	2	6	522112	522117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476153
11489	NC_012028	TAA	2	6	522150	522155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222476153
11490	NC_012028	GCA	2	6	522212	522217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476153
11491	NC_012028	AC	3	6	522237	522242	50 %	0 %	0 %	50 %	222476153
11492	NC_012028	GCT	2	6	522272	522277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476153
11493	NC_012028	GCA	2	6	522281	522286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476153
11494	NC_012028	GGC	2	6	522289	522294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476153
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11497	NC_012028	CTC	2	6	522421	522426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476153
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