MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_012028	CACG	2	8	431322	431329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9502	NC_012028	ACG	2	6	431380	431385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9503	NC_012028	TCA	2	6	431413	431418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9504	NC_012028	TCTTT	2	10	431494	431503	0 %	80 %	0 %	20 %	222476090
9505	NC_012028	TTC	2	6	431517	431522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476090
9506	NC_012028	GAC	2	6	431536	431541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9507	NC_012028	TGT	2	6	431579	431584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222476090
9508	NC_012028	CGT	2	6	431639	431644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9509	NC_012028	TTC	2	6	431659	431664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476090
9510	NC_012028	CGA	2	6	431678	431683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9511	NC_012028	GTA	2	6	431694	431699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476090
9512	NC_012028	ACCC	2	8	431707	431714	25 %	0 %	0 %	75 %	222476090
9513	NC_012028	CGT	2	6	431720	431725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9514	NC_012028	GTC	3	9	431784	431792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9515	NC_012028	CCA	2	6	431798	431803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222476090
9516	NC_012028	ACG	2	6	431810	431815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9517	NC_012028	GATCTC	2	12	431832	431843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222476090
9518	NC_012028	TCA	2	6	431854	431859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476090
9519	NC_012028	CTC	2	6	431907	431912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476090
9520	NC_012028	CGGC	2	8	431930	431937	0 %	0 %	50 %	50 %	222476090
9521	NC_012028	TCG	2	6	431971	431976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9522	NC_012028	GCG	2	6	432007	432012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476090
9523	NC_012028	GCT	2	6	432113	432118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9524	NC_012028	TCG	2	6	432154	432159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9525	NC_012028	CGA	2	6	432221	432226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476090
9526	NC_012028	GA	3	6	432275	432280	50 %	0 %	50 %	0 %	222476090
9527	NC_012028	GTCA	2	8	432288	432295	25 %	25 %	25 %	25 %	222476090
9528	NC_012028	GGA	2	6	432371	432376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_012028	ACAGC	2	10	432445	432454	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9530	NC_012028	GGC	2	6	432462	432467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9531	NC_012028	CGGT	2	8	432483	432490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9532	NC_012028	AGC	2	6	432509	432514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476091
9533	NC_012028	CCCG	2	8	432563	432570	0 %	0 %	25 %	75 %	222476091
9534	NC_012028	CGG	2	6	432575	432580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476091
9535	NC_012028	CGA	2	6	432592	432597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476091
9536	NC_012028	GAC	2	6	432626	432631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476091
9537	NC_012028	GAG	2	6	432701	432706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476091
9538	NC_012028	ACG	2	6	432729	432734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476091
9539	NC_012028	CGTCGA	2	12	432742	432753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222476091
9540	NC_012028	ACG	2	6	432779	432784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476092
9541	NC_012028	ACG	2	6	432822	432827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476092
9542	NC_012028	CGA	2	6	432853	432858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476092
9543	NC_012028	ACG	2	6	432936	432941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476092
9544	NC_012028	TCGA	2	8	432957	432964	25 %	25 %	25 %	25 %	222476092
9545	NC_012028	GAA	2	6	432968	432973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476092
9546	NC_012028	ACTC	2	8	432993	433000	25 %	25 %	0 %	50 %	222476092
9547	NC_012028	TCG	2	6	433059	433064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476092
9548	NC_012028	CGA	2	6	433120	433125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476092
9549	NC_012028	CGA	2	6	433167	433172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476092
9550	NC_012028	GAC	2	6	433201	433206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9551	NC_012028	CACTC	2	10	433296	433305	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9552	NC_012028	CTC	2	6	433316	433321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476093
9553	NC_012028	CGT	2	6	433348	433353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9554	NC_012028	CAG	2	6	433385	433390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9555	NC_012028	AAG	2	6	433406	433411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476093
9556	NC_012028	TCGC	2	8	433417	433424	0 %	25 %	25 %	50 %	222476093
9557	NC_012028	TCG	2	6	433425	433430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9558	NC_012028	GTC	2	6	433439	433444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9559	NC_012028	GCC	2	6	433455	433460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222476093
9560	NC_012028	CGT	3	9	433537	433545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9561	NC_012028	TTC	2	6	433566	433571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476093
9562	NC_012028	CGA	2	6	433616	433621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9563	NC_012028	CGT	2	6	433646	433651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9564	NC_012028	CGT	2	6	433681	433686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
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9567	NC_012028	CGG	3	9	433771	433779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476093
9568	NC_012028	CGT	2	6	433807	433812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9569	NC_012028	ATC	2	6	433841	433846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476093
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9571	NC_012028	ACC	2	6	433896	433901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222476093
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9574	NC_012028	TCG	2	6	434004	434009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
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9579	NC_012028	TGG	2	6	434257	434262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476093
9580	NC_012028	CCG	2	6	434268	434273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222476093
9581	NC_012028	TGT	2	6	434365	434370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222476093
9582	NC_012028	CCAC	2	8	434395	434402	25 %	0 %	0 %	75 %	222476093
9583	NC_012028	CCGAA	2	10	434487	434496	40 %	0 %	20 %	40 %	222476093
9584	NC_012028	CCGA	2	8	434534	434541	25 %	0 %	25 %	50 %	222476093
9585	NC_012028	GTCGG	2	10	434547	434556	0 %	20 %	60 %	20 %	222476093
9586	NC_012028	TGA	2	6	434611	434616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476093
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9588	NC_012028	CTG	2	6	434675	434680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9589	NC_012028	AGC	2	6	434682	434687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476093
9590	NC_012028	ACC	2	6	434740	434745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222476093
9591	NC_012028	CAC	2	6	434818	434823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222476093
9592	NC_012028	GAA	2	6	434831	434836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476093
9593	NC_012028	CGT	2	6	434854	434859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
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9599	NC_012028	CT	3	6	435066	435071	0 %	50 %	0 %	50 %	222476093
9600	NC_012028	CGT	2	6	435125	435130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
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9603	NC_012028	AGCGG	2	10	435310	435319	20 %	0 %	60 %	20 %	222476093
9604	NC_012028	TCG	2	6	435330	435335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
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9606	NC_012028	GAA	2	6	435371	435376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476093
9607	NC_012028	GTC	2	6	435377	435382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
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9609	NC_012028	CT	3	6	435468	435473	0 %	50 %	0 %	50 %	222476093
9610	NC_012028	TCG	2	6	435501	435506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476093
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9615	NC_012028	CGA	2	6	435784	435789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476093
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9618	NC_012028	TGTA	2	8	435894	435901	25 %	50 %	25 %	0 %	222476093
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9981	NC_012028	CTT	2	6	450521	450526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476104
9982	NC_012028	GAA	2	6	450539	450544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476104
9983	NC_012028	CTGA	2	8	450593	450600	25 %	25 %	25 %	25 %	222476104
9984	NC_012028	TGT	2	6	450602	450607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222476104
9985	NC_012028	AAC	2	6	450632	450637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9986	NC_012028	CTC	2	6	450745	450750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9987	NC_012028	CAG	2	6	450767	450772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9989	NC_012028	CAG	2	6	450916	450921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9993	NC_012028	CTCGAC	2	12	451136	451147	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222476105
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9995	NC_012028	TCT	2	6	451331	451336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476106
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