MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012028	CAA	2	6	342982	342987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475993
7502	NC_012028	GAC	2	6	343052	343057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475993
7503	NC_012028	ACA	2	6	343173	343178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475993
7504	NC_012028	CAC	2	6	343180	343185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475993
7505	NC_012028	TGA	2	6	343195	343200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475993
7506	NC_012028	GAGTAC	2	12	343229	343240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222475993
7507	NC_012028	GAC	2	6	343256	343261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475993
7508	NC_012028	CTG	2	6	343290	343295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475993
7509	NC_012028	GAC	2	6	343298	343303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475993
7510	NC_012028	GTT	2	6	343307	343312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475993
7511	NC_012028	ACGGG	2	10	343375	343384	20 %	0 %	60 %	20 %	222475993
7512	NC_012028	TCG	2	6	343437	343442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475993
7513	NC_012028	TGA	2	6	343569	343574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475994
7514	NC_012028	AGC	3	9	343630	343638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475994
7515	NC_012028	AAC	2	6	343640	343645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475994
7516	NC_012028	ATC	2	6	343766	343771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_012028	GTAT	2	8	343853	343860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_012028	CAAC	2	8	344004	344011	50 %	0 %	0 %	50 %	222475995
7519	NC_012028	TCT	2	6	344211	344216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475996
7520	NC_012028	GTAA	2	8	344243	344250	50 %	25 %	25 %	0 %	222475996
7521	NC_012028	TCCA	2	8	344268	344275	25 %	25 %	0 %	50 %	222475996
7522	NC_012028	CGC	2	6	344300	344305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475996
7523	NC_012028	CCG	2	6	344427	344432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475996
7524	NC_012028	ATA	2	6	344457	344462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222475996
7525	NC_012028	TGA	2	6	344479	344484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475996
7526	NC_012028	TCG	2	6	344511	344516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475996
7527	NC_012028	CT	3	6	344614	344619	0 %	50 %	0 %	50 %	222475996
7528	NC_012028	ATG	2	6	344667	344672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475996
7529	NC_012028	TTG	2	6	344678	344683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475996
7530	NC_012028	TCT	2	6	344707	344712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475996
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7532	NC_012028	TCA	2	6	344823	344828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475996
7533	NC_012028	TTC	2	6	344882	344887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475996
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7535	NC_012028	TCT	2	6	345036	345041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475996
7536	NC_012028	ACT	2	6	345056	345061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475996
7537	NC_012028	CGG	2	6	345085	345090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_012028	ACG	2	6	345099	345104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_012028	AGTAT	2	10	345145	345154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_012028	AAT	2	6	345157	345162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_012028	ATT	2	6	345204	345209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_012028	TCT	2	6	345225	345230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_012028	ATAA	2	8	345231	345238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_012028	TGG	2	6	345242	345247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_012028	GT	3	6	345281	345286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_012028	GCT	2	6	345302	345307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475997
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7552	NC_012028	TCCA	2	8	345663	345670	25 %	25 %	0 %	50 %	222475997
7553	NC_012028	ACCGGA	2	12	345780	345791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475998
7554	NC_012028	GTT	2	6	345836	345841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475998
7555	NC_012028	CGGCA	2	10	345848	345857	20 %	0 %	40 %	40 %	222475998
7556	NC_012028	GAT	2	6	345969	345974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475998
7557	NC_012028	TCG	2	6	345991	345996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475998
7558	NC_012028	CCAGTC	2	12	346035	346046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222475998
7559	NC_012028	CTCG	2	8	346133	346140	0 %	25 %	25 %	50 %	222475999
7560	NC_012028	CGAA	2	8	346206	346213	50 %	0 %	25 %	25 %	222475999
7561	NC_012028	TGT	2	6	346225	346230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475999
7562	NC_012028	GA	3	6	346263	346268	50 %	0 %	50 %	0 %	222475999
7563	NC_012028	CGA	2	6	346310	346315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475999
7564	NC_012028	GCG	2	6	346423	346428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_012028	TATT	2	8	346520	346527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_012028	GT	3	6	346554	346559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_012028	TC	3	6	346676	346681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7568	NC_012028	AAC	2	6	346721	346726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_012028	ACC	2	6	346739	346744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7570	NC_012028	ATCT	2	8	346800	346807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7571	NC_012028	GAA	2	6	346808	346813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_012028	GCA	2	6	346902	346907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476000
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7574	NC_012028	GAGAT	2	10	346980	346989	40 %	20 %	40 %	0 %	222476000
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7577	NC_012028	CGG	2	6	347076	347081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476000
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7588	NC_012028	GTCA	2	8	347606	347613	25 %	25 %	25 %	25 %	222476001
7589	NC_012028	CCG	2	6	347670	347675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222476001
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7592	NC_012028	CG	3	6	347720	347725	0 %	0 %	50 %	50 %	222476001
7593	NC_012028	TCG	2	6	347739	347744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476001
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7595	NC_012028	TTGC	2	8	347829	347836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7596	NC_012028	GCC	2	6	347852	347857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7597	NC_012028	GTT	2	6	347861	347866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_012028	ATT	2	6	347894	347899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_012028	CTGG	2	8	347989	347996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7600	NC_012028	TTGTT	2	10	348015	348024	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_012028	AAG	2	6	348044	348049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_012028	TCGT	2	8	348066	348073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7603	NC_012028	TAG	2	6	348181	348186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7605	NC_012028	CT	3	6	348353	348358	0 %	50 %	0 %	50 %	222476002
7606	NC_012028	TGA	2	6	348404	348409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476002
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7608	NC_012028	TCA	2	6	348471	348476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476002
7609	NC_012028	TCC	2	6	348513	348518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476002
7610	NC_012028	AGT	2	6	348563	348568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476002
7611	NC_012028	TCA	2	6	348591	348596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476002
7612	NC_012028	TCG	2	6	348612	348617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476002
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7614	NC_012028	GTTT	2	8	348642	348649	0 %	75 %	25 %	0 %	222476002
7615	NC_012028	GTT	2	6	348652	348657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222476002
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7619	NC_012028	CTTG	2	8	348779	348786	0 %	50 %	25 %	25 %	222476003
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7622	NC_012028	TTG	2	6	349054	349059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222476003
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7734	NC_012028	GAC	2	6	355489	355494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476010
7735	NC_012028	GGA	2	6	355495	355500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476010
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7737	NC_012028	GAG	2	6	355652	355657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476010
7738	NC_012028	AAC	2	6	355774	355779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222476010
7739	NC_012028	CATC	2	8	355873	355880	25 %	25 %	0 %	50 %	222476010
7740	NC_012028	GTG	2	6	355881	355886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476010
7741	NC_012028	GCG	2	6	355900	355905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476010
7742	NC_012028	TAC	3	9	355919	355927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476010
7743	NC_012028	CA	3	6	355939	355944	50 %	0 %	0 %	50 %	222476010
7744	NC_012028	GTC	2	6	355962	355967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476010
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7746	NC_012028	GA	3	6	356120	356125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7991	NC_012028	CGT	2	6	366114	366119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476022
7992	NC_012028	ACG	2	6	366172	366177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476022
7993	NC_012028	GTG	2	6	366210	366215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476022
7994	NC_012028	GC	3	6	366221	366226	0 %	0 %	50 %	50 %	222476022
7995	NC_012028	GTA	2	6	366228	366233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476022
7996	NC_012028	GCG	2	6	366262	366267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476022
7997	NC_012028	GCCG	2	8	366303	366310	0 %	0 %	50 %	50 %	222476022
7998	NC_012028	GTCG	2	8	366344	366351	0 %	25 %	50 %	25 %	222476022
7999	NC_012028	GCG	2	6	366391	366396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222476022
8000	NC_012028	GTC	2	6	366415	366420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476022

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