MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012028	TGA	2	6	298955	298960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475949
6502	NC_012028	CGG	2	6	298964	298969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475949
6503	NC_012028	CCT	2	6	298971	298976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475949
6504	NC_012028	CGT	2	6	299049	299054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6505	NC_012028	CGT	2	6	299112	299117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6506	NC_012028	CGC	2	6	299282	299287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475949
6507	NC_012028	TCG	3	9	299288	299296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6508	NC_012028	CGA	2	6	299400	299405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6509	NC_012028	CGG	2	6	299414	299419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475949
6510	NC_012028	GAC	2	6	299530	299535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6511	NC_012028	GCC	2	6	299556	299561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475949
6512	NC_012028	CTT	2	6	299562	299567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475949
6513	NC_012028	CGA	2	6	299607	299612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6514	NC_012028	TGC	2	6	299627	299632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6515	NC_012028	CGAC	2	8	299648	299655	25 %	0 %	25 %	50 %	222475949
6516	NC_012028	CGGC	2	8	299666	299673	0 %	0 %	50 %	50 %	222475949
6517	NC_012028	CCG	2	6	299693	299698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475949
6518	NC_012028	TGA	2	6	299774	299779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475949
6519	NC_012028	GGC	2	6	299836	299841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475949
6520	NC_012028	CGA	2	6	299862	299867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6521	NC_012028	GAC	2	6	299871	299876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6522	NC_012028	AGCC	2	8	299886	299893	25 %	0 %	25 %	50 %	222475949
6523	NC_012028	CGC	2	6	299915	299920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475949
6524	NC_012028	GAA	2	6	299938	299943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475949
6525	NC_012028	GGC	2	6	299970	299975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475949
6526	NC_012028	CTG	2	6	299989	299994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
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6528	NC_012028	TCG	2	6	300047	300052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6529	NC_012028	CGA	2	6	300078	300083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
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6533	NC_012028	TCC	2	6	300275	300280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475949
6534	NC_012028	ACT	2	6	300297	300302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475949
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6536	NC_012028	GAA	2	6	300352	300357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_012028	TGG	2	6	300361	300366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_012028	AGGG	2	8	300437	300444	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_012028	CGAA	2	8	300481	300488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6540	NC_012028	TCA	2	6	300513	300518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_012028	CAC	2	6	300540	300545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_012028	CCATC	2	10	300550	300559	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6543	NC_012028	GAG	2	6	300691	300696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475950
6544	NC_012028	CGA	2	6	300728	300733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475950
6545	NC_012028	TGA	2	6	300779	300784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475951
6546	NC_012028	TCG	2	6	300811	300816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475951
6547	NC_012028	CGTG	2	8	300868	300875	0 %	25 %	50 %	25 %	222475951
6548	NC_012028	CGT	2	6	300923	300928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475951
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6550	NC_012028	ACTCC	2	10	300940	300949	20 %	20 %	0 %	60 %	222475951
6551	NC_012028	CGTCT	2	10	300960	300969	0 %	40 %	20 %	40 %	222475951
6552	NC_012028	TCG	2	6	301006	301011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475951
6553	NC_012028	TCG	2	6	301048	301053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475951
6554	NC_012028	CAG	2	6	301098	301103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475951
6555	NC_012028	GCTT	2	8	301210	301217	0 %	50 %	25 %	25 %	222475951
6556	NC_012028	AGCCGT	2	12	301274	301285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222475951
6557	NC_012028	GTA	2	6	301287	301292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475951
6558	NC_012028	CGG	2	6	301298	301303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475951
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6560	NC_012028	GGC	2	6	301398	301403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475951
6561	NC_012028	CGA	2	6	301409	301414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475951
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6565	NC_012028	CGG	2	6	301482	301487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475951
6566	NC_012028	TCGA	2	8	301488	301495	25 %	25 %	25 %	25 %	222475951
6567	NC_012028	GAC	2	6	301512	301517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475951
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6569	NC_012028	TGG	2	6	301599	301604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475951
6570	NC_012028	TGA	2	6	301606	301611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475951
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6574	NC_012028	TCG	2	6	301723	301728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475951
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6576	NC_012028	CT	3	6	301816	301821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6577	NC_012028	CTAT	2	8	301828	301835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6579	NC_012028	AGA	2	6	301884	301889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_012028	ACGAG	2	10	301908	301917	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6581	NC_012028	CGA	2	6	301986	301991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_012028	CCATCG	2	12	302003	302014	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6583	NC_012028	GAACC	2	10	302088	302097	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6584	NC_012028	CGA	2	6	302127	302132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6586	NC_012028	GGC	2	6	302212	302217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_012028	GCG	2	6	302243	302248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_012028	GGC	2	6	302274	302279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_012028	TGG	2	6	302285	302290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_012028	GCT	2	6	302295	302300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_012028	TCGT	2	8	302314	302321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6592	NC_012028	GCA	2	6	302341	302346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_012028	CT	3	6	302416	302421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6594	NC_012028	TGG	2	6	302456	302461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_012028	CGG	2	6	302469	302474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_012028	CGT	2	6	302496	302501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_012028	CGC	2	6	302544	302549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6598	NC_012028	TCGG	2	8	302570	302577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6599	NC_012028	GGA	2	6	302583	302588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_012028	GTC	2	6	302596	302601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_012028	TCC	2	6	302702	302707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_012028	CGAC	2	8	302746	302753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6603	NC_012028	CTGT	2	8	302865	302872	0 %	50 %	25 %	25 %	222475952
6604	NC_012028	CAC	2	6	302939	302944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475952
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6607	NC_012028	GTC	2	6	303030	303035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475952
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6618	NC_012028	CGT	2	6	303349	303354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475952
6619	NC_012028	AC	4	8	303364	303371	50 %	0 %	0 %	50 %	222475952
6620	NC_012028	CGG	2	6	303401	303406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475952
6621	NC_012028	CGA	2	6	303409	303414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475952
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6623	NC_012028	CGA	2	6	303607	303612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475952
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6986	NC_012028	GTG	2	6	318859	318864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6998	NC_012028	CGTT	2	8	319392	319399	0 %	50 %	25 %	25 %	222475966
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