MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012028	TTC	2	6	277162	277167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475931
6002	NC_012028	CGG	2	6	277221	277226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_012028	CCG	3	9	277231	277239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_012028	CCG	2	6	277254	277259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_012028	CCGT	2	8	277267	277274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_012028	GAACG	2	10	277388	277397	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6007	NC_012028	GAC	2	6	277454	277459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_012028	TACGAC	2	12	277533	277544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222475932
6009	NC_012028	CGA	2	6	277550	277555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6010	NC_012028	GAT	2	6	277611	277616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475932
6011	NC_012028	TAA	2	6	277625	277630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222475932
6012	NC_012028	CGATC	2	10	277661	277670	20 %	20 %	20 %	40 %	222475932
6013	NC_012028	TCG	2	6	277741	277746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6014	NC_012028	GGA	2	6	277793	277798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475932
6015	NC_012028	CAGCG	2	10	277825	277834	20 %	0 %	40 %	40 %	222475932
6016	NC_012028	GTG	2	6	277942	277947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475932
6017	NC_012028	CCG	2	6	277978	277983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475932
6018	NC_012028	AAG	2	6	277990	277995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475932
6019	NC_012028	CCT	2	6	278024	278029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475932
6020	NC_012028	GCA	2	6	278050	278055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6021	NC_012028	GGC	2	6	278066	278071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475932
6022	NC_012028	AGG	3	9	278122	278130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475932
6023	NC_012028	CGC	2	6	278210	278215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475932
6024	NC_012028	TGC	2	6	278226	278231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6025	NC_012028	CGA	2	6	278270	278275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6026	NC_012028	TCG	2	6	278290	278295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6027	NC_012028	CTG	2	6	278362	278367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6028	NC_012028	AG	3	6	278387	278392	50 %	0 %	50 %	0 %	222475932
6029	NC_012028	CCT	2	6	278438	278443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475932
6030	NC_012028	ACGAT	2	10	278447	278456	40 %	20 %	20 %	20 %	222475932
6031	NC_012028	ACG	2	6	278491	278496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6032	NC_012028	CAC	2	6	278502	278507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475932
6033	NC_012028	GCC	2	6	278532	278537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475932
6034	NC_012028	CGA	2	6	278578	278583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6035	NC_012028	CGA	2	6	278588	278593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6036	NC_012028	AGC	2	6	278611	278616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6037	NC_012028	CGT	2	6	278636	278641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6038	NC_012028	TCG	2	6	278666	278671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6039	NC_012028	CGC	2	6	278713	278718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475932
6040	NC_012028	GAA	2	6	278736	278741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475932
6041	NC_012028	CGG	2	6	278787	278792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475932
6042	NC_012028	GCA	2	6	278796	278801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6043	NC_012028	GGC	2	6	278879	278884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475932
6044	NC_012028	GAC	2	6	278898	278903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6045	NC_012028	GAG	2	6	278904	278909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475932
6046	NC_012028	CGA	2	6	278938	278943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6047	NC_012028	CA	3	6	279127	279132	50 %	0 %	0 %	50 %	222475932
6048	NC_012028	CCT	2	6	279145	279150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475932
6049	NC_012028	AAG	2	6	279153	279158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475932
6050	NC_012028	AAC	2	6	279159	279164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475932
6051	NC_012028	CAA	2	6	279185	279190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475932
6052	NC_012028	TC	3	6	279220	279225	0 %	50 %	0 %	50 %	222475932
6053	NC_012028	TCC	2	6	279328	279333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475932
6054	NC_012028	CCA	2	6	279362	279367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475932
6055	NC_012028	CGA	2	6	279383	279388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6056	NC_012028	GTAC	2	8	279419	279426	25 %	25 %	25 %	25 %	222475932
6057	NC_012028	ATC	2	6	279477	279482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475932
6058	NC_012028	GAG	2	6	279483	279488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475932
6059	NC_012028	CTG	2	6	279507	279512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6060	NC_012028	GC	3	6	279515	279520	0 %	0 %	50 %	50 %	222475932
6061	NC_012028	CTT	2	6	279609	279614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475932
6062	NC_012028	CTG	2	6	279645	279650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6063	NC_012028	TGG	2	6	279759	279764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475932
6064	NC_012028	CGAC	2	8	279786	279793	25 %	0 %	25 %	50 %	222475932
6065	NC_012028	CGT	2	6	279817	279822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6066	NC_012028	CT	3	6	279831	279836	0 %	50 %	0 %	50 %	222475932
6067	NC_012028	CGACA	2	10	279850	279859	40 %	0 %	20 %	40 %	222475932
6068	NC_012028	GA	3	6	279868	279873	50 %	0 %	50 %	0 %	222475932
6069	NC_012028	CCA	2	6	279877	279882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475932
6070	NC_012028	TGA	2	6	279917	279922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475932
6071	NC_012028	GA	3	6	279934	279939	50 %	0 %	50 %	0 %	222475932
6072	NC_012028	AC	3	6	279945	279950	50 %	0 %	0 %	50 %	222475932
6073	NC_012028	TCG	2	6	279966	279971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6074	NC_012028	GAC	2	6	279981	279986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6075	NC_012028	C	6	6	280035	280040	0 %	0 %	0 %	100 %	222475932
6076	NC_012028	AGA	2	6	280055	280060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475932
6077	NC_012028	GT	3	6	280129	280134	0 %	50 %	50 %	0 %	222475932
6078	NC_012028	GCC	2	6	280157	280162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475932
6079	NC_012028	CGA	2	6	280214	280219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6080	NC_012028	CCT	2	6	280223	280228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475932
6081	NC_012028	GGC	2	6	280245	280250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475932
6082	NC_012028	CTG	2	6	280296	280301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6083	NC_012028	CTG	2	6	280323	280328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6084	NC_012028	CAG	2	6	280362	280367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6085	NC_012028	CGT	2	6	280427	280432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6086	NC_012028	CAG	2	6	280497	280502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6087	NC_012028	CTC	2	6	280512	280517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475932
6088	NC_012028	CAT	2	6	280524	280529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475932
6089	NC_012028	ACGA	2	8	280545	280552	50 %	0 %	25 %	25 %	222475932
6090	NC_012028	GCT	2	6	280596	280601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6091	NC_012028	CTC	2	6	280656	280661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475932
6092	NC_012028	TGC	2	6	280665	280670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6093	NC_012028	CGT	2	6	280673	280678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6094	NC_012028	GA	3	6	280824	280829	50 %	0 %	50 %	0 %	222475932
6095	NC_012028	CAG	3	9	280929	280937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6096	NC_012028	GGT	2	6	281003	281008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475932
6097	NC_012028	GAG	2	6	281037	281042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475932
6098	NC_012028	GAA	2	6	281078	281083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475932
6099	NC_012028	TCA	2	6	281161	281166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475932
6100	NC_012028	TAT	2	6	281253	281258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222475932
6101	NC_012028	CTC	2	6	281319	281324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475932
6102	NC_012028	CTGAA	2	10	281326	281335	40 %	20 %	20 %	20 %	222475932
6103	NC_012028	TGC	2	6	281342	281347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6104	NC_012028	GA	3	6	281356	281361	50 %	0 %	50 %	0 %	222475932
6105	NC_012028	CGA	2	6	281381	281386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6106	NC_012028	CGA	2	6	281417	281422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6107	NC_012028	GCA	2	6	281439	281444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6108	NC_012028	GCC	2	6	281451	281456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475932
6109	NC_012028	CGAC	2	8	281506	281513	25 %	0 %	25 %	50 %	222475932
6110	NC_012028	GAC	2	6	281532	281537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6111	NC_012028	GGCA	2	8	281575	281582	25 %	0 %	50 %	25 %	222475932
6112	NC_012028	TCA	2	6	281584	281589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475932
6113	NC_012028	TGA	2	6	281606	281611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475932
6114	NC_012028	ACG	2	6	281793	281798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6115	NC_012028	CTT	2	6	281843	281848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475932
6116	NC_012028	TGAT	2	8	281875	281882	25 %	50 %	25 %	0 %	222475932
6117	NC_012028	GA	3	6	281885	281890	50 %	0 %	50 %	0 %	222475932
6118	NC_012028	CGA	2	6	281896	281901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
6119	NC_012028	GAC	2	6	281906	281911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475932
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6121	NC_012028	AGA	2	6	282052	282057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475932
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6240	NC_012028	CGAC	2	8	288302	288309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6241	NC_012028	TG	3	6	288311	288316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_012028	AGT	3	9	288323	288331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6245	NC_012028	GT	3	6	288441	288446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_012028	GCT	2	6	288451	288456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6368	NC_012028	TCC	2	6	293402	293407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475944
6369	NC_012028	CGA	2	6	293439	293444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475944
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6371	NC_012028	GAG	2	6	293492	293497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475944
6372	NC_012028	TCC	2	6	293516	293521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475944
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6380	NC_012028	CTCG	2	8	293841	293848	0 %	25 %	25 %	50 %	222475944
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6388	NC_012028	GGC	2	6	294127	294132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475944
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6398	NC_012028	GTC	2	6	294409	294414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475944
6399	NC_012028	CGG	2	6	294441	294446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475944
6400	NC_012028	AGT	2	6	294456	294461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475944
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6402	NC_012028	GGT	2	6	294538	294543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475944
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6415	NC_012028	AGA	2	6	294937	294942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6416	NC_012028	CT	3	6	295093	295098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6417	NC_012028	ATT	2	6	295119	295124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6418	NC_012028	TA	3	6	295125	295130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6419	NC_012028	ATATA	2	10	295135	295144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6420	NC_012028	CGAT	2	8	295241	295248	25 %	25 %	25 %	25 %	222475945
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6434	NC_012028	GCT	2	6	295678	295683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475945
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6442	NC_012028	CGG	2	6	296054	296059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6443	NC_012028	A	6	6	296092	296097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6444	NC_012028	TCA	2	6	296149	296154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475946
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6465	NC_012028	G	7	7	297452	297458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6466	NC_012028	GAAC	2	8	297495	297502	50 %	0 %	25 %	25 %	222475949
6467	NC_012028	AGG	2	6	297581	297586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475949
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6469	NC_012028	GTC	2	6	297781	297786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
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6471	NC_012028	TCG	2	6	297839	297844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6472	NC_012028	ACT	2	6	297893	297898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475949
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6474	NC_012028	GCGA	2	8	297953	297960	25 %	0 %	50 %	25 %	222475949
6475	NC_012028	CGA	2	6	297993	297998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
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6483	NC_012028	CGT	2	6	298158	298163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6484	NC_012028	G	6	6	298169	298174	0 %	0 %	100 %	0 %	222475949
6485	NC_012028	GTC	2	6	298237	298242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6486	NC_012028	CGT	2	6	298329	298334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6487	NC_012028	TTC	2	6	298351	298356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475949
6488	NC_012028	CGA	2	6	298488	298493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6489	NC_012028	CGA	2	6	298589	298594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6490	NC_012028	GAA	2	6	298617	298622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475949
6491	NC_012028	TCGCG	2	10	298632	298641	0 %	20 %	40 %	40 %	222475949
6492	NC_012028	GAG	2	6	298690	298695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475949
6493	NC_012028	CGA	2	6	298701	298706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6494	NC_012028	CGA	2	6	298710	298715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6495	NC_012028	AGC	2	6	298744	298749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6496	NC_012028	CGA	2	6	298755	298760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6497	NC_012028	CGG	2	6	298859	298864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475949
6498	NC_012028	CGGCGA	2	12	298869	298880	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222475949
6499	NC_012028	GTC	3	9	298906	298914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475949
6500	NC_012028	TCCG	2	8	298947	298954	0 %	25 %	25 %	50 %	222475949

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