MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012028	GTTA	2	8	210712	210719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_012028	CAC	2	6	210742	210747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_012028	GCT	3	9	210749	210757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_012028	TG	3	6	210778	210783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_012028	GAG	2	6	210812	210817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_012028	GTG	2	6	210884	210889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_012028	TG	3	6	210888	210893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_012028	CCA	2	6	210984	210989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_012028	AGACG	2	10	211026	211035	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4510	NC_012028	CGG	2	6	211188	211193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_012028	TAC	2	6	211198	211203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_012028	CGCC	2	8	211318	211325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4513	NC_012028	CGG	2	6	211331	211336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_012028	AGGC	2	8	211564	211571	25 %	0 %	50 %	25 %	222475874
4515	NC_012028	TC	3	6	211572	211577	0 %	50 %	0 %	50 %	222475874
4516	NC_012028	CGC	2	6	211606	211611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475874
4517	NC_012028	GA	3	6	211797	211802	50 %	0 %	50 %	0 %	222475874
4518	NC_012028	GTT	2	6	212004	212009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475874
4519	NC_012028	ACC	2	6	212059	212064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475874
4520	NC_012028	AAC	2	6	212072	212077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475874
4521	NC_012028	GT	3	6	212088	212093	0 %	50 %	50 %	0 %	222475874
4522	NC_012028	CCA	2	6	212112	212117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475874
4523	NC_012028	GA	3	6	212249	212254	50 %	0 %	50 %	0 %	222475874
4524	NC_012028	CCG	2	6	212258	212263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475874
4525	NC_012028	CGG	2	6	212268	212273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475874
4526	NC_012028	CCG	2	6	212301	212306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475874
4527	NC_012028	CGT	2	6	212481	212486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475874
4528	NC_012028	ACCGA	2	10	212528	212537	40 %	0 %	20 %	40 %	222475874
4529	NC_012028	CCGTG	2	10	212538	212547	0 %	20 %	40 %	40 %	222475874
4530	NC_012028	GA	5	10	212562	212571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_012028	CTCG	2	8	212598	212605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_012028	CGAG	2	8	212644	212651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4533	NC_012028	GA	3	6	212679	212684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_012028	GAG	2	6	212752	212757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_012028	GTTCAC	2	12	212833	212844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_012028	GGA	2	6	212882	212887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012028	GTC	2	6	213065	213070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475875
4538	NC_012028	GAG	2	6	213128	213133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475875
4539	NC_012028	GGT	2	6	213227	213232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475875
4540	NC_012028	ACT	2	6	213250	213255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475875
4541	NC_012028	CA	3	6	213284	213289	50 %	0 %	0 %	50 %	222475875
4542	NC_012028	ATC	2	6	213365	213370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475875
4543	NC_012028	CT	3	6	213445	213450	0 %	50 %	0 %	50 %	222475875
4544	NC_012028	GATGC	2	10	213455	213464	20 %	20 %	40 %	20 %	222475875
4545	NC_012028	CTT	2	6	213469	213474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475875
4546	NC_012028	GGA	2	6	213524	213529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475875
4547	NC_012028	CTA	2	6	213556	213561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475875
4548	NC_012028	CTG	2	6	213575	213580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475875
4549	NC_012028	CGG	2	6	213898	213903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475875
4550	NC_012028	CGG	2	6	213925	213930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475875
4551	NC_012028	CGA	2	6	213942	213947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475875
4552	NC_012028	GCC	2	6	213950	213955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475875
4553	NC_012028	GCC	2	6	213971	213976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475875
4554	NC_012028	CG	4	8	214006	214013	0 %	0 %	50 %	50 %	222475875
4555	NC_012028	CGA	2	6	214024	214029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475875
4556	NC_012028	AC	3	6	214035	214040	50 %	0 %	0 %	50 %	222475875
4557	NC_012028	CGT	2	6	214041	214046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475875
4558	NC_012028	TCC	2	6	214076	214081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475875
4559	NC_012028	TC	3	6	214148	214153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_012028	CA	3	6	214204	214209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_012028	TCT	2	6	214248	214253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_012028	CGCC	2	8	214358	214365	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4563	NC_012028	CGG	2	6	214371	214376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_012028	TC	3	6	214380	214385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_012028	CAT	2	6	214497	214502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475876
4566	NC_012028	GAG	2	6	214516	214521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
4567	NC_012028	GAG	2	6	214546	214551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
4568	NC_012028	TCG	2	6	214583	214588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475876
4569	NC_012028	TCG	2	6	214595	214600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475876
4570	NC_012028	CGG	2	6	214644	214649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475876
4571	NC_012028	GCTCGG	2	12	214650	214661	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222475876
4572	NC_012028	CGTGGA	2	12	214700	214711	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222475876
4573	NC_012028	GGC	2	6	214807	214812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475876
4574	NC_012028	G	6	6	214912	214917	0 %	0 %	100 %	0 %	222475876
4575	NC_012028	ACA	2	6	214946	214951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475876
4576	NC_012028	TCGT	2	8	215052	215059	0 %	50 %	25 %	25 %	222475876
4577	NC_012028	ACG	2	6	215102	215107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475876
4578	NC_012028	GAG	2	6	215146	215151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
4579	NC_012028	GA	3	6	215156	215161	50 %	0 %	50 %	0 %	222475876
4580	NC_012028	CAG	2	6	215194	215199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475876
4581	NC_012028	CTA	2	6	215205	215210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475876
4582	NC_012028	GAG	2	6	215260	215265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
4583	NC_012028	CGCC	2	8	215267	215274	0 %	0 %	25 %	75 %	222475876
4584	NC_012028	CCG	2	6	215345	215350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475876
4585	NC_012028	GCGCC	2	10	215355	215364	0 %	0 %	40 %	60 %	222475876
4586	NC_012028	GGT	2	6	215432	215437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475876
4587	NC_012028	CCG	2	6	215442	215447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475876
4588	NC_012028	GAC	2	6	215512	215517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475876
4589	NC_012028	GGA	2	6	215565	215570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475876
4590	NC_012028	TCC	2	6	215592	215597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475877
4591	NC_012028	AGTGG	2	10	215626	215635	20 %	20 %	60 %	0 %	222475877
4592	NC_012028	GCC	2	6	215663	215668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475877
4593	NC_012028	GTT	2	6	215687	215692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475877
4594	NC_012028	GAC	2	6	215738	215743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4595	NC_012028	CGA	2	6	215770	215775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4596	NC_012028	CGA	2	6	215815	215820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4597	NC_012028	CA	3	6	215832	215837	50 %	0 %	0 %	50 %	222475877
4598	NC_012028	CACCG	2	10	215845	215854	20 %	0 %	20 %	60 %	222475877
4599	NC_012028	GCC	2	6	215855	215860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475877
4600	NC_012028	AC	3	6	215871	215876	50 %	0 %	0 %	50 %	222475877
4601	NC_012028	GAC	3	9	215902	215910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4602	NC_012028	ACG	2	6	215943	215948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4603	NC_012028	A	6	6	216013	216018	100 %	0 %	0 %	0 %	222475877
4604	NC_012028	GAAC	2	8	216034	216041	50 %	0 %	25 %	25 %	222475877
4605	NC_012028	TGA	2	6	216055	216060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475877
4606	NC_012028	TACC	2	8	216100	216107	25 %	25 %	0 %	50 %	222475877
4607	NC_012028	GC	3	6	216115	216120	0 %	0 %	50 %	50 %	222475877
4608	NC_012028	GCC	2	6	216128	216133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475877
4609	NC_012028	GC	3	6	216159	216164	0 %	0 %	50 %	50 %	222475877
4610	NC_012028	CGA	2	6	216202	216207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4611	NC_012028	GAC	2	6	216212	216217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4612	NC_012028	TGA	2	6	216256	216261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475877
4613	NC_012028	ATCG	2	8	216355	216362	25 %	25 %	25 %	25 %	222475877
4614	NC_012028	CAC	2	6	216396	216401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475877
4615	NC_012028	CGA	2	6	216408	216413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4616	NC_012028	GTC	2	6	216467	216472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475877
4617	NC_012028	TCGA	2	8	216569	216576	25 %	25 %	25 %	25 %	222475877
4618	NC_012028	ATC	2	6	216599	216604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475877
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4620	NC_012028	CGG	2	6	216667	216672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475877
4621	NC_012028	CTT	2	6	216793	216798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475877
4622	NC_012028	GACG	2	8	216828	216835	25 %	0 %	50 %	25 %	222475877
4623	NC_012028	GAC	2	6	216884	216889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475877
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4625	NC_012028	GAG	2	6	216989	216994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475877
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4749	NC_012028	T	6	6	222717	222722	0 %	100 %	0 %	0 %	222475879
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4872	NC_012028	GCG	2	6	228424	228429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4873	NC_012028	GCC	2	6	228441	228446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4874	NC_012028	ATCGA	2	10	228475	228484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4875	NC_012028	CA	3	6	228485	228490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4876	NC_012028	CTG	2	6	228529	228534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4877	NC_012028	GAC	2	6	228646	228651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4880	NC_012028	TCGC	2	8	228756	228763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4881	NC_012028	CGT	2	6	229020	229025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475884
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4883	NC_012028	CG	3	6	229163	229168	0 %	0 %	50 %	50 %	222475884
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4888	NC_012028	CTC	2	6	229424	229429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4889	NC_012028	TCC	2	6	229442	229447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4893	NC_012028	TCT	2	6	229613	229618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4894	NC_012028	CAA	2	6	229705	229710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4895	NC_012028	CGCC	2	8	229723	229730	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4896	NC_012028	CGG	2	6	229736	229741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4897	NC_012028	TC	3	6	229745	229750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4898	NC_012028	GCAC	2	8	229776	229783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4899	NC_012028	CGC	2	6	229788	229793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4901	NC_012028	TCGCT	2	10	229867	229876	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4902	NC_012028	CGAC	2	8	229879	229886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4903	NC_012028	CGGG	2	8	229892	229899	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4905	NC_012028	CGCT	2	8	230046	230053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4906	NC_012028	CGGG	2	8	230055	230062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4907	NC_012028	GC	3	6	230066	230071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4908	NC_012028	ATC	2	6	230085	230090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4910	NC_012028	TCGC	2	8	230107	230114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4911	NC_012028	GCGA	2	8	230137	230144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4912	NC_012028	ACGTCG	2	12	230168	230179	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4998	NC_012028	CGA	2	6	233349	233354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475886
4999	NC_012028	GAC	2	6	233379	233384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475886
5000	NC_012028	CCG	2	6	233411	233416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475886

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