MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 62516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011899	TA	3	6	7	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011899	A	7	7	20	26	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011899	TTTA	2	8	87	94	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011899	T	6	6	117	122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011899	TAA	2	6	136	141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011899	TTA	2	6	146	151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011899	T	6	6	163	168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011899	ACAT	2	8	202	209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011899	AAT	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011899	ATTT	2	8	226	233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011899	TATT	2	8	279	286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011899	T	6	6	308	313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011899	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011899	TA	3	6	435	440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011899	ACT	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011899	AGG	2	6	579	584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011899	AT	3	6	621	626	50 %	50 %	0 %	0 %	220930851
18	NC_011899	TAA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930851
19	NC_011899	CTGG	2	8	760	767	0 %	25 %	50 %	25 %	220930851
20	NC_011899	TTA	2	6	798	803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930851
21	NC_011899	GAA	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930851
22	NC_011899	TGC	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930851
23	NC_011899	CCCGG	2	10	1042	1051	0 %	0 %	40 %	60 %	220930851
24	NC_011899	TA	3	6	1069	1074	50 %	50 %	0 %	0 %	220930851
25	NC_011899	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
26	NC_011899	GAT	2	6	1208	1213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930851
27	NC_011899	AAAT	2	8	1231	1238	75 %	25 %	0 %	0 %	220930851
28	NC_011899	TCC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220930851
29	NC_011899	AAAG	2	8	1289	1296	75 %	0 %	25 %	0 %	220930851
30	NC_011899	GAA	2	6	1304	1309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930851
31	NC_011899	T	6	6	1310	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	220930851
32	NC_011899	ATA	2	6	1355	1360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930851
33	NC_011899	GAAA	2	8	1378	1385	75 %	0 %	25 %	0 %	220930851
34	NC_011899	AG	3	6	1399	1404	50 %	0 %	50 %	0 %	220930851
35	NC_011899	A	7	7	1483	1489	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
36	NC_011899	ATTA	2	8	1579	1586	50 %	50 %	0 %	0 %	220930851
37	NC_011899	ATAGAT	2	12	1622	1633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220930851
38	NC_011899	AGG	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930851
39	NC_011899	TGG	2	6	1659	1664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930851
40	NC_011899	ATA	2	6	1671	1676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930851
41	NC_011899	A	6	6	1708	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
42	NC_011899	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930851
43	NC_011899	AGA	2	6	1744	1749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930851
44	NC_011899	AAAGA	2	10	1759	1768	80 %	0 %	20 %	0 %	220930851
45	NC_011899	TTC	2	6	1828	1833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220930851
46	NC_011899	GGA	2	6	1859	1864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930851
47	NC_011899	TAC	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930851
48	NC_011899	A	6	6	1907	1912	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
49	NC_011899	GAT	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930851
50	NC_011899	GATA	2	8	1942	1949	50 %	25 %	25 %	0 %	220930851
51	NC_011899	A	6	6	1959	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
52	NC_011899	TAAATT	2	12	2001	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011899	TAA	2	6	2068	2073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011899	TAA	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011899	T	7	7	2127	2133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011899	CTT	2	6	2163	2168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011899	TA	3	6	2178	2183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011899	AAC	2	6	2203	2208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011899	TAC	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011899	TAAA	3	12	2262	2273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011899	T	7	7	2293	2299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011899	GC	3	6	2385	2390	0 %	0 %	50 %	50 %	220930852
63	NC_011899	TCT	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220930852
64	NC_011899	CCAG	2	8	2542	2549	25 %	0 %	25 %	50 %	220930852
65	NC_011899	TAT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930852
66	NC_011899	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
67	NC_011899	TGA	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
68	NC_011899	TTCAAC	2	12	2766	2777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930852
69	NC_011899	ATAC	2	8	2852	2859	50 %	25 %	0 %	25 %	220930852
70	NC_011899	GAAA	2	8	2903	2910	75 %	0 %	25 %	0 %	220930852
71	NC_011899	TGA	3	9	2958	2966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
72	NC_011899	TTTAAT	2	12	3007	3018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930852
73	NC_011899	CAG	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930852
74	NC_011899	TAA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930852
75	NC_011899	TTA	2	6	3121	3126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930852
76	NC_011899	AAG	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930852
77	NC_011899	ATT	2	6	3205	3210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930852
78	NC_011899	AGA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930852
79	NC_011899	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930852
80	NC_011899	ATG	3	9	3329	3337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
81	NC_011899	CTTTAA	2	12	3371	3382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	220930852
82	NC_011899	AGAA	2	8	3383	3390	75 %	0 %	25 %	0 %	220930852
83	NC_011899	TGA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
84	NC_011899	TTTA	2	8	3403	3410	25 %	75 %	0 %	0 %	220930852
85	NC_011899	CCG	2	6	3426	3431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220930852
86	NC_011899	A	6	6	3476	3481	100 %	0 %	0 %	0 %	220930853
87	NC_011899	GGA	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930853
88	NC_011899	CAGG	2	8	3550	3557	25 %	0 %	50 %	25 %	220930853
89	NC_011899	GAA	2	6	3577	3582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930853
90	NC_011899	TATT	2	8	3684	3691	25 %	75 %	0 %	0 %	220930854
91	NC_011899	TAA	2	6	3722	3727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
92	NC_011899	ATA	2	6	3734	3739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
93	NC_011899	TTG	2	6	3752	3757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930854
94	NC_011899	CTT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220930854
95	NC_011899	AG	3	6	3841	3846	50 %	0 %	50 %	0 %	220930854
96	NC_011899	TGT	2	6	3873	3878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930854
97	NC_011899	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
98	NC_011899	A	7	7	3942	3948	100 %	0 %	0 %	0 %	220930854
99	NC_011899	ATG	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930854
100	NC_011899	AGA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930854
101	NC_011899	GGA	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930854
102	NC_011899	ATTACC	2	12	4103	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930854
103	NC_011899	A	7	7	4119	4125	100 %	0 %	0 %	0 %	220930854
104	NC_011899	TAA	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
105	NC_011899	TAC	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930854
106	NC_011899	CCT	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220930854
107	NC_011899	AGC	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930854
108	NC_011899	ATA	2	6	4243	4248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
109	NC_011899	GAA	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930854
110	NC_011899	TAA	2	6	4419	4424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
111	NC_011899	GAT	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930854
112	NC_011899	CAG	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930854
113	NC_011899	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930854
114	NC_011899	T	6	6	4625	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	220930854
115	NC_011899	ATA	2	6	4640	4645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
116	NC_011899	AAG	2	6	4647	4652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930854
117	NC_011899	TTA	2	6	4694	4699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930854
118	NC_011899	T	7	7	4710	4716	0 %	100 %	0 %	0 %	220930854
119	NC_011899	TAA	2	6	4772	4777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
120	NC_011899	GGT	2	6	4809	4814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011899	AT	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	220930855
122	NC_011899	CCA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220930855
123	NC_011899	GAA	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930855
124	NC_011899	ATT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930855
125	NC_011899	TTTTG	2	10	4982	4991	0 %	80 %	20 %	0 %	220930855
126	NC_011899	CA	3	6	5028	5033	50 %	0 %	0 %	50 %	220930855
127	NC_011899	GAA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930855
128	NC_011899	T	6	6	5097	5102	0 %	100 %	0 %	0 %	220930856
129	NC_011899	ATGG	2	8	5200	5207	25 %	25 %	50 %	0 %	220930856
130	NC_011899	CCA	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220930856
131	NC_011899	ATA	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930856
132	NC_011899	TGA	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930856
133	NC_011899	TTA	2	6	5285	5290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930856
134	NC_011899	A	6	6	5362	5367	100 %	0 %	0 %	0 %	220930856
135	NC_011899	GGT	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930856
136	NC_011899	GGT	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930856
137	NC_011899	TGT	2	6	5466	5471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930856
138	NC_011899	CTG	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930856
139	NC_011899	ATT	2	6	5710	5715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930856
140	NC_011899	AGG	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930856
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171	NC_011899	TA	3	6	7103	7108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011899	ATT	2	6	7127	7132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_011899	TTA	2	6	10987	10992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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