MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 62516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011899	ATA	2	6	61395	61400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011899	T	6	6	61405	61410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011899	TC	3	6	61450	61455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_011899	ATTT	2	8	61481	61488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011899	A	6	6	61510	61515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011899	AGG	2	6	61517	61522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011899	A	6	6	61556	61561	100 %	0 %	0 %	0 %	220930903
1508	NC_011899	T	6	6	61568	61573	0 %	100 %	0 %	0 %	220930903
1509	NC_011899	ATA	2	6	61579	61584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930903
1510	NC_011899	T	8	8	61610	61617	0 %	100 %	0 %	0 %	220930903
1511	NC_011899	GGCAG	2	10	61653	61662	20 %	0 %	60 %	20 %	220930903
1512	NC_011899	GTA	2	6	61749	61754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930903
1513	NC_011899	ATT	2	6	61783	61788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930903
1514	NC_011899	TTAT	2	8	61795	61802	25 %	75 %	0 %	0 %	220930903
1515	NC_011899	CTG	2	6	61803	61808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930903
1516	NC_011899	AGT	2	6	61833	61838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930903
1517	NC_011899	T	7	7	61838	61844	0 %	100 %	0 %	0 %	220930903
1518	NC_011899	A	6	6	61845	61850	100 %	0 %	0 %	0 %	220930903
1519	NC_011899	TTTC	2	8	61865	61872	0 %	75 %	0 %	25 %	220930903
1520	NC_011899	TAA	2	6	61951	61956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930903
1521	NC_011899	TAT	2	6	61976	61981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930903
1522	NC_011899	T	7	7	61987	61993	0 %	100 %	0 %	0 %	220930903
1523	NC_011899	ATT	2	6	61994	61999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930903
1524	NC_011899	GTG	2	6	62055	62060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930903
1525	NC_011899	TGG	2	6	62086	62091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930903
1526	NC_011899	T	6	6	62118	62123	0 %	100 %	0 %	0 %	220930903
1527	NC_011899	TACA	2	8	62128	62135	50 %	25 %	0 %	25 %	220930903
1528	NC_011899	TTTG	2	8	62144	62151	0 %	75 %	25 %	0 %	220930903
1529	NC_011899	GTG	2	6	62155	62160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930903
1530	NC_011899	AT	3	6	62309	62314	50 %	50 %	0 %	0 %	220930903
1531	NC_011899	TAG	2	6	62320	62325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930903
1532	NC_011899	T	6	6	62330	62335	0 %	100 %	0 %	0 %	220930903
1533	NC_011899	ACT	2	6	62453	62458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930903
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1536	NC_011899	CTG	2	6	62538	62543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930903
1537	NC_011899	TGA	2	6	62597	62602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930903
1538	NC_011899	GAA	3	9	62604	62612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930903
1539	NC_011899	A	6	6	62642	62647	100 %	0 %	0 %	0 %	220930903
1540	NC_011899	CAG	2	6	62720	62725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930903
1541	NC_011899	TAA	2	6	62774	62779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930903
1542	NC_011899	CAA	2	6	62807	62812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220930903
1543	NC_011899	AGT	2	6	62832	62837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930903
1544	NC_011899	TAAA	2	8	62854	62861	75 %	25 %	0 %	0 %	220930903
1545	NC_011899	GAT	2	6	62880	62885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930903
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1547	NC_011899	AAT	2	6	62927	62932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930903
1548	NC_011899	AT	3	6	62991	62996	50 %	50 %	0 %	0 %	220930903
1549	NC_011899	GAA	2	6	63114	63119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930903
1550	NC_011899	TTA	2	6	63133	63138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930903
1551	NC_011899	TAA	2	6	63166	63171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930903
1552	NC_011899	TAA	2	6	63185	63190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930903
1553	NC_011899	ATT	2	6	63212	63217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930903
1554	NC_011899	C	6	6	63223	63228	0 %	0 %	0 %	100 %	220930903
1555	NC_011899	GATGG	2	10	63345	63354	20 %	20 %	60 %	0 %	220930903
1556	NC_011899	GCT	2	6	63387	63392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930903
1557	NC_011899	ATT	2	6	63411	63416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930903
1558	NC_011899	GAA	2	6	63483	63488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930903
1559	NC_011899	T	6	6	63513	63518	0 %	100 %	0 %	0 %	220930903
1560	NC_011899	CTT	2	6	63607	63612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220930903
1561	NC_011899	TTA	2	6	63685	63690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930903
1562	NC_011899	GGTT	2	8	63741	63748	0 %	50 %	50 %	0 %	220930903
1563	NC_011899	CAT	2	6	63796	63801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930903
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1566	NC_011899	TAT	2	6	63854	63859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930903
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1568	NC_011899	A	7	7	63886	63892	100 %	0 %	0 %	0 %	220930903
1569	NC_011899	GAA	2	6	63988	63993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930904
1570	NC_011899	AT	3	6	64003	64008	50 %	50 %	0 %	0 %	220930904
1571	NC_011899	CAT	2	6	64013	64018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930904
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1578	NC_011899	TAT	2	6	64222	64227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930904
1579	NC_011899	TGA	2	6	64251	64256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930904
1580	NC_011899	ATG	2	6	64257	64262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930904
1581	NC_011899	AGC	2	6	64282	64287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930904
1582	NC_011899	TTTAA	2	10	64301	64310	40 %	60 %	0 %	0 %	220930904
1583	NC_011899	ATA	2	6	64359	64364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930904
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1590	NC_011899	AT	3	6	64603	64608	50 %	50 %	0 %	0 %	220930904
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1594	NC_011899	A	7	7	64701	64707	100 %	0 %	0 %	0 %	220930904
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1597	NC_011899	A	6	6	64935	64940	100 %	0 %	0 %	0 %	220930904
1598	NC_011899	ATA	2	6	64952	64957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930904
1599	NC_011899	A	7	7	64970	64976	100 %	0 %	0 %	0 %	220930904
1600	NC_011899	CAG	2	6	65007	65012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930904
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1602	NC_011899	GGC	2	6	65073	65078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220930904
1603	NC_011899	A	6	6	65118	65123	100 %	0 %	0 %	0 %	220930904
1604	NC_011899	ATTC	2	8	65167	65174	25 %	50 %	0 %	25 %	220930904
1605	NC_011899	T	7	7	65209	65215	0 %	100 %	0 %	0 %	220930904
1606	NC_011899	TGA	2	6	65218	65223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930904
1607	NC_011899	A	6	6	65223	65228	100 %	0 %	0 %	0 %	220930904
1608	NC_011899	AG	3	6	65243	65248	50 %	0 %	50 %	0 %	220930904
1609	NC_011899	ACA	2	6	65268	65273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220930904
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1611	NC_011899	GGAT	2	8	65304	65311	25 %	25 %	50 %	0 %	220930904
1612	NC_011899	GAT	2	6	65330	65335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930904
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1617	NC_011899	ATG	2	6	65405	65410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930905
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1627	NC_011899	AATT	2	8	65977	65984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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