MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 62516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011899	AGA	2	6	40772	40777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011899	TTA	2	6	40789	40794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011899	TA	3	6	40804	40809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011899	AATT	2	8	40867	40874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011899	GAA	2	6	40882	40887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011899	GCA	2	6	40924	40929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011899	A	7	7	40961	40967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011899	GCT	2	6	40971	40976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011899	AT	3	6	41099	41104	50 %	50 %	0 %	0 %	220930884
1010	NC_011899	TAA	2	6	41148	41153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930884
1011	NC_011899	TAAA	2	8	41171	41178	75 %	25 %	0 %	0 %	220930884
1012	NC_011899	AAG	2	6	41224	41229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930884
1013	NC_011899	ATA	2	6	41237	41242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930884
1014	NC_011899	T	6	6	41245	41250	0 %	100 %	0 %	0 %	220930884
1015	NC_011899	TTTA	2	8	41342	41349	25 %	75 %	0 %	0 %	220930884
1016	NC_011899	TGTT	2	8	41355	41362	0 %	75 %	25 %	0 %	220930884
1017	NC_011899	AGA	2	6	41370	41375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930884
1018	NC_011899	A	6	6	41375	41380	100 %	0 %	0 %	0 %	220930884
1019	NC_011899	TA	3	6	41381	41386	50 %	50 %	0 %	0 %	220930884
1020	NC_011899	AGA	2	6	41400	41405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930884
1021	NC_011899	TAG	2	6	41411	41416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930884
1022	NC_011899	ATT	2	6	41426	41431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930884
1023	NC_011899	ATG	2	6	41465	41470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930884
1024	NC_011899	GTGCT	2	10	41506	41515	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_011899	CCA	2	6	41594	41599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_011899	ATG	2	6	41625	41630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011899	AT	3	6	41646	41651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011899	TTA	2	6	41668	41673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011899	A	7	7	41744	41750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011899	ATT	2	6	41754	41759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011899	AGA	2	6	41801	41806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930885
1032	NC_011899	GGT	2	6	41852	41857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930885
1033	NC_011899	ATG	2	6	41922	41927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930885
1034	NC_011899	CTG	2	6	41980	41985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930885
1035	NC_011899	TCAGG	2	10	41987	41996	20 %	20 %	40 %	20 %	220930885
1036	NC_011899	TAA	2	6	42050	42055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011899	AAC	2	6	42060	42065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_011899	GTT	2	6	42077	42082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011899	T	7	7	42081	42087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011899	T	7	7	42094	42100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011899	CAA	2	6	42167	42172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_011899	TAA	2	6	42189	42194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011899	A	7	7	42193	42199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011899	A	6	6	42221	42226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011899	AT	4	8	42243	42250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011899	A	6	6	42256	42261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011899	T	6	6	42273	42278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011899	GAG	2	6	42292	42297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011899	AGT	2	6	42349	42354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011899	TAA	2	6	42373	42378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011899	G	6	6	42396	42401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011899	AAAT	2	8	42413	42420	75 %	25 %	0 %	0 %	220930886
1053	NC_011899	GTA	2	6	42438	42443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930886
1054	NC_011899	G	6	6	42507	42512	0 %	0 %	100 %	0 %	220930886
1055	NC_011899	TTG	2	6	42526	42531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930886
1056	NC_011899	TAA	2	6	42542	42547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930886
1057	NC_011899	ATT	2	6	42585	42590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930886
1058	NC_011899	TGA	2	6	42605	42610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930886
1059	NC_011899	CTG	2	6	42649	42654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930886
1060	NC_011899	AAG	2	6	42700	42705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930886
1061	NC_011899	AGA	2	6	42758	42763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930886
1062	NC_011899	CT	3	6	42833	42838	0 %	50 %	0 %	50 %	220930886
1063	NC_011899	T	6	6	42945	42950	0 %	100 %	0 %	0 %	220930886
1064	NC_011899	GAA	2	6	42963	42968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930886
1065	NC_011899	TGC	2	6	43022	43027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930886
1066	NC_011899	TAT	2	6	43127	43132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930886
1067	NC_011899	TGC	2	6	43187	43192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930886
1068	NC_011899	ATT	2	6	43212	43217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930886
1069	NC_011899	AAG	2	6	43348	43353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930886
1070	NC_011899	TGG	2	6	43553	43558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930886
1071	NC_011899	ATGG	2	8	43562	43569	25 %	25 %	50 %	0 %	220930886
1072	NC_011899	CAAT	2	8	43573	43580	50 %	25 %	0 %	25 %	220930886
1073	NC_011899	AGA	2	6	43619	43624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930886
1074	NC_011899	AATA	2	8	43668	43675	75 %	25 %	0 %	0 %	220930886
1075	NC_011899	T	6	6	43720	43725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011899	AGG	2	6	43732	43737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011899	T	6	6	43805	43810	0 %	100 %	0 %	0 %	220930887
1078	NC_011899	TAT	2	6	43820	43825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930887
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1080	NC_011899	ATT	2	6	43915	43920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930887
1081	NC_011899	TATT	2	8	43938	43945	25 %	75 %	0 %	0 %	220930887
1082	NC_011899	TAT	2	6	43979	43984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930887
1083	NC_011899	CAC	2	6	43988	43993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220930887
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1086	NC_011899	TAT	2	6	44073	44078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930887
1087	NC_011899	GTT	2	6	44100	44105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930887
1088	NC_011899	TTAA	2	8	44145	44152	50 %	50 %	0 %	0 %	220930887
1089	NC_011899	T	6	6	44199	44204	0 %	100 %	0 %	0 %	220930887
1090	NC_011899	TTG	2	6	44208	44213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930887
1091	NC_011899	A	6	6	44245	44250	100 %	0 %	0 %	0 %	220930887
1092	NC_011899	GCA	2	6	44310	44315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930887
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1094	NC_011899	AAT	2	6	44336	44341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930887
1095	NC_011899	AT	3	6	44345	44350	50 %	50 %	0 %	0 %	220930887
1096	NC_011899	TA	3	6	44498	44503	50 %	50 %	0 %	0 %	220930887
1097	NC_011899	GCT	2	6	44544	44549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930887
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1101	NC_011899	TAT	2	6	44721	44726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930887
1102	NC_011899	CTC	2	6	44758	44763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220930887
1103	NC_011899	A	8	8	44832	44839	100 %	0 %	0 %	0 %	220930887
1104	NC_011899	GA	3	6	44853	44858	50 %	0 %	50 %	0 %	220930887
1105	NC_011899	GAAA	2	8	44881	44888	75 %	0 %	25 %	0 %	220930887
1106	NC_011899	AATC	2	8	44899	44906	50 %	25 %	0 %	25 %	220930888
1107	NC_011899	TGC	2	6	44938	44943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930888
1108	NC_011899	ATC	2	6	45007	45012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930888
1109	NC_011899	CCT	2	6	45038	45043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220930888
1110	NC_011899	GAG	2	6	45114	45119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930888
1111	NC_011899	T	7	7	45121	45127	0 %	100 %	0 %	0 %	220930888
1112	NC_011899	CTAC	2	8	45165	45172	25 %	25 %	0 %	50 %	220930888
1113	NC_011899	ACCCC	2	10	45197	45206	20 %	0 %	0 %	80 %	220930888
1114	NC_011899	TA	3	6	45281	45286	50 %	50 %	0 %	0 %	220930888
1115	NC_011899	A	6	6	45318	45323	100 %	0 %	0 %	0 %	220930888
1116	NC_011899	CAGT	2	8	45370	45377	25 %	25 %	25 %	25 %	220930888
1117	NC_011899	ACT	2	6	45632	45637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930888
1118	NC_011899	ATT	2	6	45638	45643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930888
1119	NC_011899	T	6	6	45717	45722	0 %	100 %	0 %	0 %	220930888
1120	NC_011899	ATG	2	6	45725	45730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930888
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1122	NC_011899	T	6	6	45890	45895	0 %	100 %	0 %	0 %	220930888
1123	NC_011899	GAA	2	6	45917	45922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930888
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1129	NC_011899	GGA	2	6	46130	46135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930888
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