MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 62516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011899	GAC	2	6	19918	19923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011899	GA	3	6	20067	20072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011899	CGA	2	6	20121	20126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_011899	GCA	2	6	20195	20200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011899	CGC	2	6	20242	20247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_011899	GAA	2	6	20291	20296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011899	AGG	2	6	20304	20309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011899	GAG	2	6	20335	20340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011899	CAG	2	6	20363	20368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011899	GAA	2	6	20555	20560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011899	GGC	2	6	20574	20579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011899	GAA	2	6	20817	20822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011899	GGT	2	6	20894	20899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011899	GTC	2	6	20908	20913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011899	TCGTG	2	10	20917	20926	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
516	NC_011899	GGA	2	6	21021	21026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011899	AC	3	6	21072	21077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_011899	GCG	2	6	21102	21107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011899	A	6	6	21132	21137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011899	AC	3	6	21241	21246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_011899	CAC	2	6	21256	21261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_011899	GT	3	6	21302	21307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011899	G	6	6	21315	21320	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011899	CCT	2	6	21366	21371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_011899	TGT	2	6	21410	21415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011899	TA	6	12	21440	21451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011899	AT	4	8	21499	21506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011899	GGTA	2	8	21538	21545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011899	GCT	2	6	21635	21640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011899	GAG	2	6	21686	21691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011899	AAG	2	6	21711	21716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011899	GAG	2	6	21763	21768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011899	GCG	2	6	21796	21801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011899	GAG	2	6	21812	21817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011899	AC	3	6	21823	21828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_011899	TGG	2	6	21830	21835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011899	CCA	2	6	21939	21944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_011899	ACC	2	6	22002	22007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_011899	GAA	2	6	22028	22033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011899	G	6	6	22034	22039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011899	TCC	2	6	22044	22049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_011899	GGGAG	2	10	22114	22123	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011899	GGA	2	6	22161	22166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011899	GGT	2	6	22369	22374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011899	A	6	6	22477	22482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011899	CCA	2	6	22518	22523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_011899	AGC	2	6	22703	22708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011899	CATT	2	8	22709	22716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_011899	CCG	2	6	22929	22934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_011899	GGA	2	6	23096	23101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011899	AGG	2	6	23118	23123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011899	AGG	2	6	23128	23133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011899	GCC	2	6	23199	23204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_011899	GA	3	6	23265	23270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011899	GC	3	6	23279	23284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_011899	GA	3	6	23285	23290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011899	CGG	2	6	23522	23527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011899	CAA	2	6	23616	23621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011899	GTGA	2	8	23643	23650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011899	GCC	2	6	23779	23784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_011899	ACC	2	6	23793	23798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_011899	CCT	2	6	23880	23885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_011899	CGG	2	6	24015	24020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_011899	TCG	2	6	24131	24136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011899	CGT	2	6	24211	24216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011899	CGCAGG	2	12	24240	24251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_011899	AC	3	6	24295	24300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_011899	GTT	2	6	24314	24319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011899	TG	3	6	24346	24351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011899	AGG	2	6	24418	24423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011899	GA	3	6	24434	24439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011899	ATCTC	2	10	24515	24524	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
573	NC_011899	A	6	6	24583	24588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011899	A	6	6	24614	24619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011899	GA	3	6	24644	24649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011899	TCC	2	6	24721	24726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_011899	GCC	2	6	24854	24859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_011899	CCAG	2	8	24860	24867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_011899	TCC	2	6	24946	24951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_011899	CGG	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011899	CGG	2	6	25051	25056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_011899	GAT	2	6	25152	25157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011899	TAA	2	6	25161	25166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011899	CAC	2	6	25245	25250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_011899	TCCC	2	8	25329	25336	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
586	NC_011899	T	6	6	25356	25361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011899	GGC	2	6	25406	25411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011899	CCA	2	6	25512	25517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_011899	GTAGC	2	10	25531	25540	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
590	NC_011899	AAGG	2	8	25646	25653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011899	CCA	2	6	25758	25763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_011899	T	7	7	25764	25770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011899	ATA	2	6	25778	25783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011899	CCA	2	6	25865	25870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_011899	T	7	7	25966	25972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011899	T	6	6	25985	25990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011899	TA	3	6	26013	26018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011899	TA	3	6	26024	26029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011899	AAC	2	6	26037	26042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011899	TTTA	2	8	26063	26070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011899	TTTA	2	8	26115	26122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011899	ACA	2	6	26143	26148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011899	ATT	2	6	26151	26156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011899	A	6	6	26167	26172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011899	ACTA	2	8	26184	26191	50 %	25 %	0 %	25 %	220930868
606	NC_011899	ATT	2	6	26201	26206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930868
607	NC_011899	AAT	2	6	26214	26219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930868
608	NC_011899	TAT	2	6	26237	26242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930868
609	NC_011899	TAG	2	6	26246	26251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930868
610	NC_011899	TAT	2	6	26258	26263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930868
611	NC_011899	GTCGG	2	10	26272	26281	0 %	20 %	60 %	20 %	220930868
612	NC_011899	TCA	2	6	26295	26300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930868
613	NC_011899	AAT	2	6	26349	26354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930868
614	NC_011899	ATT	2	6	26380	26385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930868
615	NC_011899	TGGT	2	8	26396	26403	0 %	50 %	50 %	0 %	220930868
616	NC_011899	TA	3	6	26467	26472	50 %	50 %	0 %	0 %	220930868
617	NC_011899	TATTT	2	10	26514	26523	20 %	80 %	0 %	0 %	220930868
618	NC_011899	A	7	7	26626	26632	100 %	0 %	0 %	0 %	220930868
619	NC_011899	ACT	2	6	26641	26646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930868
620	NC_011899	T	6	6	26646	26651	0 %	100 %	0 %	0 %	220930868
621	NC_011899	CTGG	2	8	26653	26660	0 %	25 %	50 %	25 %	220930868
622	NC_011899	T	6	6	26697	26702	0 %	100 %	0 %	0 %	220930868
623	NC_011899	GTT	2	6	26734	26739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930868
624	NC_011899	AAG	2	6	26777	26782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930868
625	NC_011899	ATA	2	6	26788	26793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930868
626	NC_011899	TAT	2	6	26800	26805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930868
627	NC_011899	T	6	6	26828	26833	0 %	100 %	0 %	0 %	220930868
628	NC_011899	AG	3	6	26868	26873	50 %	0 %	50 %	0 %	220930868
629	NC_011899	T	6	6	26921	26926	0 %	100 %	0 %	0 %	220930868
630	NC_011899	TTA	2	6	26935	26940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930868
631	NC_011899	GCA	2	6	26944	26949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930868
632	NC_011899	AAT	2	6	26967	26972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930868
633	NC_011899	TTA	2	6	27011	27016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930868
634	NC_011899	ACC	2	6	27026	27031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220930868
635	NC_011899	TGC	2	6	27038	27043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930868
636	NC_011899	TGA	2	6	27084	27089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930868
637	NC_011899	ATTA	2	8	27102	27109	50 %	50 %	0 %	0 %	220930868
638	NC_011899	CGGT	2	8	27125	27132	0 %	25 %	50 %	25 %	220930868
639	NC_011899	ATT	2	6	27133	27138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930868
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