MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_011852	ATT	2	6	2256557	2256562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872289
44503	NC_011852	ACA	2	6	2256563	2256568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872289
44504	NC_011852	ATT	2	6	2256599	2256604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872289
44505	NC_011852	CAA	2	6	2256618	2256623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872289
44506	NC_011852	GAA	2	6	2256681	2256686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872289
44507	NC_011852	TATT	2	8	2256696	2256703	25 %	75 %	0 %	0 %	219872289
44508	NC_011852	AAC	2	6	2256758	2256763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872289
44509	NC_011852	A	7	7	2256792	2256798	100 %	0 %	0 %	0 %	219872289
44510	NC_011852	AT	3	6	2256809	2256814	50 %	50 %	0 %	0 %	219872289
44511	NC_011852	ACTTT	2	10	2256828	2256837	20 %	60 %	0 %	20 %	219872289
44512	NC_011852	CAAAA	2	10	2256968	2256977	80 %	0 %	0 %	20 %	219872290
44513	NC_011852	TCACC	2	10	2257015	2257024	20 %	20 %	0 %	60 %	219872290
44514	NC_011852	ATT	2	6	2257055	2257060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872290
44515	NC_011852	CGA	2	6	2257066	2257071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872290
44516	NC_011852	GAT	2	6	2257094	2257099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872290
44517	NC_011852	A	6	6	2257100	2257105	100 %	0 %	0 %	0 %	219872290
44518	NC_011852	GATT	2	8	2257165	2257172	25 %	50 %	25 %	0 %	219872290
44519	NC_011852	GTTA	2	8	2257181	2257188	25 %	50 %	25 %	0 %	219872290
44520	NC_011852	ATTG	2	8	2257190	2257197	25 %	50 %	25 %	0 %	219872290
44521	NC_011852	A	6	6	2257200	2257205	100 %	0 %	0 %	0 %	219872290
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44523	NC_011852	TTAT	2	8	2257264	2257271	25 %	75 %	0 %	0 %	219872291
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44540	NC_011852	TCCG	2	8	2257948	2257955	0 %	25 %	25 %	50 %	219872291
44541	NC_011852	AG	3	6	2258020	2258025	50 %	0 %	50 %	0 %	219872291
44542	NC_011852	A	6	6	2258075	2258080	100 %	0 %	0 %	0 %	219872291
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44545	NC_011852	CGT	3	9	2258615	2258623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872292
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44547	NC_011852	CGGTA	2	10	2258758	2258767	20 %	20 %	40 %	20 %	219872292
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44554	NC_011852	CTG	2	6	2259200	2259205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872293
44555	NC_011852	ATC	2	6	2259305	2259310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872293
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44592	NC_011852	G	6	6	2261044	2261049	0 %	0 %	100 %	0 %	219872295
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44601	NC_011852	GTA	2	6	2261608	2261613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872296
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44605	NC_011852	TAAT	2	8	2261837	2261844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44606	NC_011852	TTG	2	6	2261910	2261915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44607	NC_011852	A	6	6	2261976	2261981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44608	NC_011852	AATG	2	8	2262052	2262059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44609	NC_011852	AAAC	2	8	2262127	2262134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44610	NC_011852	CAA	2	6	2262139	2262144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44611	NC_011852	TCAG	2	8	2262166	2262173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44612	NC_011852	AT	3	6	2262186	2262191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44613	NC_011852	CAT	2	6	2262243	2262248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44614	NC_011852	AAT	2	6	2262310	2262315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44615	NC_011852	ATT	2	6	2262326	2262331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44616	NC_011852	AT	3	6	2262348	2262353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44617	NC_011852	TAC	2	6	2262355	2262360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44618	NC_011852	TA	3	6	2262394	2262399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44741	NC_011852	TAT	2	6	2268503	2268508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44742	NC_011852	TTC	2	6	2268545	2268550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872300
44743	NC_011852	ATC	2	6	2268698	2268703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872300
44744	NC_011852	GCCA	2	8	2268748	2268755	25 %	0 %	25 %	50 %	219872300
44745	NC_011852	TTC	2	6	2268896	2268901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872300
44746	NC_011852	ATT	2	6	2268962	2268967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44747	NC_011852	T	7	7	2268973	2268979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44748	NC_011852	AG	3	6	2268991	2268996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44749	NC_011852	A	6	6	2269003	2269008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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