MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_011852	ACC	2	6	2204423	2204428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872242
43503	NC_011852	AAG	2	6	2204448	2204453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872242
43504	NC_011852	A	6	6	2204583	2204588	100 %	0 %	0 %	0 %	219872242
43505	NC_011852	TAA	2	6	2204641	2204646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872242
43506	NC_011852	ATCCAA	2	12	2204841	2204852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219872242
43507	NC_011852	AAT	2	6	2204957	2204962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872242
43508	NC_011852	TAC	2	6	2204978	2204983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872242
43509	NC_011852	ATT	2	6	2205000	2205005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872242
43510	NC_011852	GAATAT	2	12	2205023	2205034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219872242
43511	NC_011852	TTG	2	6	2205051	2205056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872242
43512	NC_011852	GGC	2	6	2205164	2205169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872242
43513	NC_011852	AC	3	6	2205170	2205175	50 %	0 %	0 %	50 %	219872242
43514	NC_011852	TTTA	2	8	2205196	2205203	25 %	75 %	0 %	0 %	219872242
43515	NC_011852	CGA	2	6	2205265	2205270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872242
43516	NC_011852	GTT	2	6	2205282	2205287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872242
43517	NC_011852	ATC	2	6	2205349	2205354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872242
43518	NC_011852	GCG	2	6	2205362	2205367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872242
43519	NC_011852	AAC	2	6	2205435	2205440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872242
43520	NC_011852	A	8	8	2205486	2205493	100 %	0 %	0 %	0 %	219872242
43521	NC_011852	A	7	7	2205502	2205508	100 %	0 %	0 %	0 %	219872242
43522	NC_011852	GCGG	2	8	2205602	2205609	0 %	0 %	75 %	25 %	219872242
43523	NC_011852	GA	3	6	2205625	2205630	50 %	0 %	50 %	0 %	219872242
43524	NC_011852	ATT	2	6	2205838	2205843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872242
43525	NC_011852	TCC	2	6	2205855	2205860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219872242
43526	NC_011852	A	6	6	2205880	2205885	100 %	0 %	0 %	0 %	219872242
43527	NC_011852	GCC	2	6	2205907	2205912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219872242
43528	NC_011852	A	6	6	2206001	2206006	100 %	0 %	0 %	0 %	219872242
43529	NC_011852	ACG	2	6	2206090	2206095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872242
43530	NC_011852	AGA	2	6	2206114	2206119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872242
43531	NC_011852	GAT	2	6	2206127	2206132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872242
43532	NC_011852	TTGC	2	8	2206166	2206173	0 %	50 %	25 %	25 %	219872242
43533	NC_011852	A	6	6	2206175	2206180	100 %	0 %	0 %	0 %	219872242
43534	NC_011852	GTG	2	6	2206215	2206220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872242
43535	NC_011852	TAAA	2	8	2206235	2206242	75 %	25 %	0 %	0 %	219872242
43536	NC_011852	T	7	7	2206276	2206282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43537	NC_011852	ATA	2	6	2206321	2206326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43538	NC_011852	TAA	2	6	2206339	2206344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43539	NC_011852	GGA	2	6	2206354	2206359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43540	NC_011852	AAC	2	6	2206406	2206411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872243
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43542	NC_011852	TGT	2	6	2206427	2206432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872243
43543	NC_011852	ACA	2	6	2206441	2206446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872243
43544	NC_011852	CTG	2	6	2206453	2206458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872243
43545	NC_011852	CTT	2	6	2206473	2206478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872243
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43547	NC_011852	TCACTG	2	12	2206579	2206590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219872243
43548	NC_011852	TAT	2	6	2206648	2206653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872243
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43550	NC_011852	T	6	6	2206779	2206784	0 %	100 %	0 %	0 %	219872243
43551	NC_011852	AACT	2	8	2206841	2206848	50 %	25 %	0 %	25 %	219872243
43552	NC_011852	GTCAC	2	10	2206880	2206889	20 %	20 %	20 %	40 %	219872243
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43554	NC_011852	ACA	2	6	2207036	2207041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872243
43555	NC_011852	TTC	2	6	2207052	2207057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872243
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43563	NC_011852	ACC	2	6	2207515	2207520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872243
43564	NC_011852	TAC	2	6	2207631	2207636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872243
43565	NC_011852	GCA	2	6	2207646	2207651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872243
43566	NC_011852	GAA	2	6	2207673	2207678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872243
43567	NC_011852	TGC	2	6	2207702	2207707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872243
43568	NC_011852	T	7	7	2207888	2207894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43569	NC_011852	AATA	2	8	2207904	2207911	75 %	25 %	0 %	0 %	219872244
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43584	NC_011852	T	7	7	2208903	2208909	0 %	100 %	0 %	0 %	219872244
43585	NC_011852	TGA	2	6	2208968	2208973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872244
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43589	NC_011852	GCTT	2	8	2209193	2209200	0 %	50 %	25 %	25 %	219872245
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43591	NC_011852	A	6	6	2209271	2209276	100 %	0 %	0 %	0 %	219872245
43592	NC_011852	GGT	2	6	2209378	2209383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872245
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43596	NC_011852	ATTTCC	2	12	2209467	2209478	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219872245
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43598	NC_011852	ATT	2	6	2209527	2209532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43599	NC_011852	CAG	2	6	2209691	2209696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872246
43600	NC_011852	CAA	2	6	2209703	2209708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872246
43601	NC_011852	ATT	2	6	2209753	2209758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872246
43602	NC_011852	TTTA	2	8	2209860	2209867	25 %	75 %	0 %	0 %	219872246
43603	NC_011852	TCA	2	6	2209915	2209920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872246
43604	NC_011852	ATT	3	9	2209948	2209956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872246
43605	NC_011852	TAT	2	6	2210014	2210019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872246
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43607	NC_011852	ATG	2	6	2210115	2210120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872246
43608	NC_011852	TGA	2	6	2210173	2210178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872246
43609	NC_011852	A	6	6	2210222	2210227	100 %	0 %	0 %	0 %	219872246
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43612	NC_011852	ATT	2	6	2210326	2210331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872246
43613	NC_011852	A	7	7	2210332	2210338	100 %	0 %	0 %	0 %	219872246
43614	NC_011852	TTA	2	6	2210342	2210347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872246
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43741	NC_011852	TA	3	6	2216376	2216381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43855	NC_011852	AGAA	2	8	2223238	2223245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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