MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_011852	CT	3	6	2179244	2179249	0 %	50 %	0 %	50 %	219872218
43002	NC_011852	ATA	2	6	2179294	2179299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43003	NC_011852	ATTT	2	8	2179326	2179333	25 %	75 %	0 %	0 %	219872219
43004	NC_011852	T	7	7	2179348	2179354	0 %	100 %	0 %	0 %	219872219
43005	NC_011852	GAA	2	6	2179367	2179372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872219
43006	NC_011852	T	6	6	2179394	2179399	0 %	100 %	0 %	0 %	219872219
43007	NC_011852	GGA	2	6	2179406	2179411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219872219
43008	NC_011852	TAA	2	6	2179417	2179422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872219
43009	NC_011852	ATT	2	6	2179439	2179444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43010	NC_011852	TTA	2	6	2179453	2179458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43011	NC_011852	T	6	6	2179463	2179468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43012	NC_011852	T	6	6	2179486	2179491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43013	NC_011852	ATT	2	6	2179566	2179571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872220
43014	NC_011852	TGA	2	6	2179644	2179649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872220
43015	NC_011852	AGT	2	6	2179656	2179661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872220
43016	NC_011852	TCA	2	6	2179687	2179692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872220
43017	NC_011852	GCA	2	6	2179702	2179707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872220
43018	NC_011852	GTAG	2	8	2179708	2179715	25 %	25 %	50 %	0 %	219872220
43019	NC_011852	A	6	6	2179808	2179813	100 %	0 %	0 %	0 %	219872220
43020	NC_011852	GT	4	8	2179879	2179886	0 %	50 %	50 %	0 %	219872220
43021	NC_011852	CAG	2	6	2179889	2179894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872220
43022	NC_011852	TGGTGC	2	12	2179938	2179949	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219872220
43023	NC_011852	TTTA	2	8	2179958	2179965	25 %	75 %	0 %	0 %	219872220
43024	NC_011852	GCT	2	6	2179981	2179986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872220
43025	NC_011852	GCT	2	6	2180017	2180022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872220
43026	NC_011852	GGT	2	6	2180047	2180052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872220
43027	NC_011852	ACA	2	6	2180053	2180058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872220
43028	NC_011852	TGG	2	6	2180112	2180117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872220
43029	NC_011852	ATC	2	6	2180137	2180142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872220
43030	NC_011852	AAC	2	6	2180181	2180186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872220
43031	NC_011852	A	6	6	2180200	2180205	100 %	0 %	0 %	0 %	219872220
43032	NC_011852	AAG	2	6	2180312	2180317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872220
43033	NC_011852	AAC	2	6	2180333	2180338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872220
43034	NC_011852	TTG	2	6	2180351	2180356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872220
43035	NC_011852	CCA	2	6	2180386	2180391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872220
43036	NC_011852	TTA	2	6	2180446	2180451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872220
43037	NC_011852	GTG	2	6	2180531	2180536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872220
43038	NC_011852	GAT	2	6	2180553	2180558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872220
43039	NC_011852	GAC	2	6	2180587	2180592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872220
43040	NC_011852	TTA	2	6	2180611	2180616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43041	NC_011852	CAC	2	6	2180712	2180717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43042	NC_011852	TAT	2	6	2180837	2180842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872221
43043	NC_011852	GTAA	2	8	2180876	2180883	50 %	25 %	25 %	0 %	219872221
43044	NC_011852	AAC	2	6	2180934	2180939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872221
43045	NC_011852	ACGTTT	2	12	2180995	2181006	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219872221
43046	NC_011852	ACT	2	6	2181007	2181012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872221
43047	NC_011852	A	6	6	2181041	2181046	100 %	0 %	0 %	0 %	219872221
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43049	NC_011852	GTA	2	6	2181092	2181097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872221
43050	NC_011852	TTG	2	6	2181126	2181131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872221
43051	NC_011852	TGA	2	6	2181145	2181150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872221
43052	NC_011852	AGT	2	6	2181191	2181196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872221
43053	NC_011852	TCAC	2	8	2181219	2181226	25 %	25 %	0 %	50 %	219872221
43054	NC_011852	ATG	2	6	2181417	2181422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872221
43055	NC_011852	TTAT	2	8	2181481	2181488	25 %	75 %	0 %	0 %	219872221
43056	NC_011852	CAA	2	6	2181501	2181506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872221
43057	NC_011852	GAA	2	6	2181509	2181514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872221
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43059	NC_011852	A	6	6	2181611	2181616	100 %	0 %	0 %	0 %	219872221
43060	NC_011852	AAGT	2	8	2181621	2181628	50 %	25 %	25 %	0 %	219872221
43061	NC_011852	TGA	2	6	2181631	2181636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872221
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43063	NC_011852	GAA	2	6	2181662	2181667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872221
43064	NC_011852	CACAG	2	10	2181713	2181722	40 %	0 %	20 %	40 %	219872221
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43067	NC_011852	GATCT	2	10	2181937	2181946	20 %	40 %	20 %	20 %	219872222
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43071	NC_011852	AT	3	6	2182065	2182070	50 %	50 %	0 %	0 %	219872222
43072	NC_011852	TCT	2	6	2182091	2182096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872222
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43086	NC_011852	ACG	2	6	2183398	2183403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872223
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43088	NC_011852	ACT	2	6	2183431	2183436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872223
43089	NC_011852	C	6	6	2183438	2183443	0 %	0 %	0 %	100 %	219872223
43090	NC_011852	TGGAA	2	10	2183483	2183492	40 %	20 %	40 %	0 %	219872223
43091	NC_011852	A	6	6	2183506	2183511	100 %	0 %	0 %	0 %	219872223
43092	NC_011852	AACA	2	8	2183559	2183566	75 %	0 %	0 %	25 %	219872223
43093	NC_011852	TTTG	2	8	2183578	2183585	0 %	75 %	25 %	0 %	219872224
43094	NC_011852	CTCAA	2	10	2183586	2183595	40 %	20 %	0 %	40 %	219872224
43095	NC_011852	GCACG	2	10	2183689	2183698	20 %	0 %	40 %	40 %	219872224
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43099	NC_011852	ATC	2	6	2183864	2183869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872224
43100	NC_011852	TAAA	2	8	2183933	2183940	75 %	25 %	0 %	0 %	219872224
43101	NC_011852	CCA	2	6	2183946	2183951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872224
43102	NC_011852	GTT	2	6	2183998	2184003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872224
43103	NC_011852	TAGT	2	8	2184015	2184022	25 %	50 %	25 %	0 %	219872224
43104	NC_011852	GTTT	2	8	2184053	2184060	0 %	75 %	25 %	0 %	219872224
43105	NC_011852	T	6	6	2184221	2184226	0 %	100 %	0 %	0 %	219872224
43106	NC_011852	AGT	2	6	2184235	2184240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872224
43107	NC_011852	T	6	6	2184296	2184301	0 %	100 %	0 %	0 %	219872224
43108	NC_011852	GTGC	2	8	2184349	2184356	0 %	25 %	50 %	25 %	219872224
43109	NC_011852	GTT	2	6	2184369	2184374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872224
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43112	NC_011852	TCT	2	6	2184531	2184536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872224
43113	NC_011852	TA	3	6	2184646	2184651	50 %	50 %	0 %	0 %	219872224
43114	NC_011852	AAT	2	6	2184783	2184788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872224
43115	NC_011852	TAC	2	6	2184841	2184846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872224
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43118	NC_011852	AGT	2	6	2184982	2184987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872224
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43120	NC_011852	TAA	2	6	2185015	2185020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872224
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