MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_011852	TAAAGA	2	12	2130178	2130189	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219872180
42003	NC_011852	TGC	2	6	2130240	2130245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872180
42004	NC_011852	AAT	2	6	2130302	2130307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872180
42005	NC_011852	TTA	2	6	2130332	2130337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872180
42006	NC_011852	ATC	2	6	2130419	2130424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872180
42007	NC_011852	CAA	2	6	2130455	2130460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872180
42008	NC_011852	TCT	2	6	2130501	2130506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872180
42009	NC_011852	TGA	2	6	2130528	2130533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872180
42010	NC_011852	A	6	6	2130565	2130570	100 %	0 %	0 %	0 %	219872180
42011	NC_011852	CCTT	2	8	2130603	2130610	0 %	50 %	0 %	50 %	219872180
42012	NC_011852	TGGC	2	8	2130693	2130700	0 %	25 %	50 %	25 %	219872181
42013	NC_011852	ATT	2	6	2130851	2130856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872181
42014	NC_011852	AG	3	6	2130862	2130867	50 %	0 %	50 %	0 %	219872181
42015	NC_011852	TGA	2	6	2130886	2130891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872181
42016	NC_011852	A	6	6	2130957	2130962	100 %	0 %	0 %	0 %	219872181
42017	NC_011852	AAATC	2	10	2131026	2131035	60 %	20 %	0 %	20 %	219872181
42018	NC_011852	AAATT	2	10	2131104	2131113	60 %	40 %	0 %	0 %	219872181
42019	NC_011852	T	6	6	2131118	2131123	0 %	100 %	0 %	0 %	219872181
42020	NC_011852	CAA	2	6	2131151	2131156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872181
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42022	NC_011852	CAA	2	6	2131349	2131354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872181
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42024	NC_011852	ATTG	2	8	2131496	2131503	25 %	50 %	25 %	0 %	219872181
42025	NC_011852	CGG	2	6	2131596	2131601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872181
42026	NC_011852	CTTA	2	8	2131612	2131619	25 %	50 %	0 %	25 %	219872181
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42033	NC_011852	ACCG	2	8	2132091	2132098	25 %	0 %	25 %	50 %	219872181
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42037	NC_011852	CAAT	2	8	2132386	2132393	50 %	25 %	0 %	25 %	219872181
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42039	NC_011852	TCA	2	6	2132523	2132528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872181
42040	NC_011852	TGGC	2	8	2132586	2132593	0 %	25 %	50 %	25 %	219872181
42041	NC_011852	A	6	6	2132705	2132710	100 %	0 %	0 %	0 %	219872181
42042	NC_011852	TGA	2	6	2132728	2132733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872181
42043	NC_011852	CTTAC	2	10	2132785	2132794	20 %	40 %	0 %	40 %	219872181
42044	NC_011852	TGA	2	6	2133536	2133541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42045	NC_011852	GAT	2	6	2133627	2133632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42046	NC_011852	ATT	2	6	2133721	2133726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42047	NC_011852	TAAT	2	8	2133746	2133753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42048	NC_011852	GGC	2	6	2133790	2133795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42049	NC_011852	AT	3	6	2133797	2133802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42050	NC_011852	TGG	2	6	2133826	2133831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42051	NC_011852	ACA	2	6	2133894	2133899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42052	NC_011852	AAT	2	6	2134000	2134005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42053	NC_011852	TTG	2	6	2134048	2134053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42054	NC_011852	TAA	2	6	2134140	2134145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42055	NC_011852	A	6	6	2134191	2134196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42056	NC_011852	CGG	2	6	2134224	2134229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42057	NC_011852	GTTTGC	2	12	2134249	2134260	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42058	NC_011852	T	6	6	2134294	2134299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42059	NC_011852	AT	3	6	2134309	2134314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42060	NC_011852	T	7	7	2134331	2134337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42061	NC_011852	ATG	2	6	2134338	2134343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42062	NC_011852	ATT	2	6	2134352	2134357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42063	NC_011852	ACA	2	6	2134378	2134383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872182
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42065	NC_011852	ACA	2	6	2134449	2134454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872182
42066	NC_011852	GTT	2	6	2134474	2134479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872182
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42070	NC_011852	CTTT	2	8	2134641	2134648	0 %	75 %	0 %	25 %	219872182
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42073	NC_011852	GAA	2	6	2134787	2134792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42074	NC_011852	ATT	2	6	2134811	2134816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42075	NC_011852	A	6	6	2134829	2134834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42076	NC_011852	GAT	2	6	2134835	2134840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42079	NC_011852	T	6	6	2134908	2134913	0 %	100 %	0 %	0 %	219872183
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42089	NC_011852	CT	3	6	2135433	2135438	0 %	50 %	0 %	50 %	219872184
42090	NC_011852	TGA	2	6	2135484	2135489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872184
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42092	NC_011852	ACG	2	6	2135538	2135543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872184
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42103	NC_011852	TAA	2	6	2135966	2135971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872184
42104	NC_011852	CTT	2	6	2136020	2136025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872184
42105	NC_011852	T	6	6	2136075	2136080	0 %	100 %	0 %	0 %	219872184
42106	NC_011852	GGTT	2	8	2136119	2136126	0 %	50 %	50 %	0 %	219872184
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42108	NC_011852	CTG	2	6	2136218	2136223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872184
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42111	NC_011852	ACC	2	6	2136316	2136321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872184
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42115	NC_011852	AATG	2	8	2136423	2136430	50 %	25 %	25 %	0 %	219872184
42116	NC_011852	TTA	2	6	2136445	2136450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872184
42117	NC_011852	ACAA	2	8	2136480	2136487	75 %	0 %	0 %	25 %	219872184
42118	NC_011852	AGC	2	6	2136501	2136506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872184
42119	NC_011852	CGG	2	6	2136516	2136521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872184
42120	NC_011852	TGGATT	2	12	2136531	2136542	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219872184
42121	NC_011852	GCC	2	6	2136568	2136573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219872184
42122	NC_011852	GCATC	2	10	2136641	2136650	20 %	20 %	20 %	40 %	219872184
42123	NC_011852	GCCA	2	8	2136662	2136669	25 %	0 %	25 %	50 %	219872184
42124	NC_011852	ATC	2	6	2136672	2136677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872184
42125	NC_011852	GTC	2	6	2136699	2136704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872184
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42127	NC_011852	CAAG	2	8	2136795	2136802	50 %	0 %	25 %	25 %	219872184
42128	NC_011852	GCC	2	6	2136811	2136816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219872184
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42142	NC_011852	AAT	2	6	2137504	2137509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42144	NC_011852	ATG	2	6	2137558	2137563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42145	NC_011852	TAT	2	6	2137575	2137580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42148	NC_011852	AAG	2	6	2137632	2137637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42151	NC_011852	T	7	7	2137711	2137717	0 %	100 %	0 %	0 %	219872185
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42158	NC_011852	TCT	2	6	2138108	2138113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42192	NC_011852	A	7	7	2140151	2140157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42225	NC_011852	ATC	2	6	2141714	2141719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872187
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42236	NC_011852	TG	3	6	2142191	2142196	0 %	50 %	50 %	0 %	219872187
42237	NC_011852	AG	3	6	2142290	2142295	50 %	0 %	50 %	0 %	219872187
42238	NC_011852	TAA	2	6	2142352	2142357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42479	NC_011852	ATT	2	6	2152827	2152832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42480	NC_011852	T	7	7	2152877	2152883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42481	NC_011852	ATT	2	6	2152888	2152893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42482	NC_011852	TTTTC	2	10	2152940	2152949	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42483	NC_011852	T	6	6	2152956	2152961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42486	NC_011852	ATT	2	6	2153049	2153054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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