MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_011852	AT	3	6	2105918	2105923	50 %	50 %	0 %	0 %	219872161
41503	NC_011852	GTT	2	6	2105985	2105990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872161
41504	NC_011852	TCA	2	6	2106105	2106110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872161
41505	NC_011852	CTG	2	6	2106163	2106168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872161
41506	NC_011852	TAA	2	6	2106181	2106186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872161
41507	NC_011852	T	6	6	2106192	2106197	0 %	100 %	0 %	0 %	219872161
41508	NC_011852	GTT	2	6	2106264	2106269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41509	NC_011852	TTAAA	2	10	2106310	2106319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41510	NC_011852	GGC	2	6	2106320	2106325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41511	NC_011852	TGT	2	6	2106334	2106339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41512	NC_011852	AAT	2	6	2106384	2106389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41513	NC_011852	TTC	2	6	2106533	2106538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872162
41514	NC_011852	GT	3	6	2106571	2106576	0 %	50 %	50 %	0 %	219872162
41515	NC_011852	CTT	2	6	2106632	2106637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872162
41516	NC_011852	AAT	2	6	2106745	2106750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872162
41517	NC_011852	AT	3	6	2106757	2106762	50 %	50 %	0 %	0 %	219872162
41518	NC_011852	TTC	2	6	2106813	2106818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41519	NC_011852	TTG	2	6	2106834	2106839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41520	NC_011852	AAC	2	6	2106859	2106864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872163
41521	NC_011852	ATA	2	6	2106885	2106890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872163
41522	NC_011852	TAA	2	6	2106932	2106937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872163
41523	NC_011852	TAA	2	6	2107005	2107010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872163
41524	NC_011852	TAA	2	6	2107020	2107025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872163
41525	NC_011852	T	6	6	2107051	2107056	0 %	100 %	0 %	0 %	219872163
41526	NC_011852	CATT	2	8	2107094	2107101	25 %	50 %	0 %	25 %	219872163
41527	NC_011852	A	6	6	2107182	2107187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41528	NC_011852	A	6	6	2107225	2107230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41529	NC_011852	TAA	2	6	2107234	2107239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41530	NC_011852	TGAT	2	8	2107287	2107294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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41533	NC_011852	GTG	2	6	2107422	2107427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41534	NC_011852	CCT	2	6	2107456	2107461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41535	NC_011852	A	6	6	2107549	2107554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41536	NC_011852	GTG	2	6	2107555	2107560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41537	NC_011852	CCT	2	6	2107589	2107594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41538	NC_011852	AAC	2	6	2107654	2107659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41539	NC_011852	GTG	2	6	2107677	2107682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41540	NC_011852	CCT	2	6	2107711	2107716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41541	NC_011852	CGT	2	6	2107753	2107758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41542	NC_011852	T	6	6	2107811	2107816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41543	NC_011852	CTA	2	6	2107855	2107860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41544	NC_011852	ATCAAA	2	12	2107905	2107916	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41545	NC_011852	A	7	7	2107914	2107920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41546	NC_011852	ATA	2	6	2107929	2107934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872164
41547	NC_011852	TGG	2	6	2108020	2108025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872164
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41549	NC_011852	GGAAT	2	10	2108147	2108156	40 %	20 %	40 %	0 %	219872164
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41552	NC_011852	GAA	2	6	2108240	2108245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872164
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41557	NC_011852	CGTG	2	8	2108431	2108438	0 %	25 %	50 %	25 %	219872164
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41561	NC_011852	GTT	2	6	2108555	2108560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872164
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41572	NC_011852	GATT	2	8	2108959	2108966	25 %	50 %	25 %	0 %	219872164
41573	NC_011852	TC	3	6	2108967	2108972	0 %	50 %	0 %	50 %	219872164
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41579	NC_011852	AG	3	6	2109316	2109321	50 %	0 %	50 %	0 %	219872164
41580	NC_011852	TAGT	2	8	2109371	2109378	25 %	50 %	25 %	0 %	219872164
41581	NC_011852	A	7	7	2109421	2109427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41582	NC_011852	GTC	2	6	2109501	2109506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41587	NC_011852	T	6	6	2109608	2109613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41588	NC_011852	TAG	2	6	2109636	2109641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41589	NC_011852	AATAA	2	10	2109680	2109689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41590	NC_011852	ATA	2	6	2109707	2109712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41591	NC_011852	GTA	2	6	2109805	2109810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41592	NC_011852	T	11	11	2109829	2109839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41593	NC_011852	CT	3	6	2109841	2109846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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41601	NC_011852	TAAA	2	8	2109997	2110004	75 %	25 %	0 %	0 %	219872165
41602	NC_011852	TGC	2	6	2110062	2110067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
41603	NC_011852	GA	3	6	2110096	2110101	50 %	0 %	50 %	0 %	219872165
41604	NC_011852	TGC	2	6	2110216	2110221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
41605	NC_011852	ATA	2	6	2110299	2110304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872165
41606	NC_011852	CTG	2	6	2110353	2110358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
41607	NC_011852	TAA	2	6	2110370	2110375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872165
41608	NC_011852	CAA	2	6	2110490	2110495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872165
41609	NC_011852	GTA	2	6	2110664	2110669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872165
41610	NC_011852	CAG	2	6	2110676	2110681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872165
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41616	NC_011852	CAC	2	6	2110974	2110979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872165
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41621	NC_011852	GAT	2	6	2111430	2111435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872165
41622	NC_011852	ATGGGA	2	12	2111460	2111471	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219872165
41623	NC_011852	AAAG	2	8	2111501	2111508	75 %	0 %	25 %	0 %	219872165
41624	NC_011852	A	6	6	2111583	2111588	100 %	0 %	0 %	0 %	219872165
41625	NC_011852	A	6	6	2111601	2111606	100 %	0 %	0 %	0 %	219872165
41626	NC_011852	TGA	2	6	2111621	2111626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872165
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41629	NC_011852	TGC	2	6	2111770	2111775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
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41633	NC_011852	ACCTT	2	10	2111860	2111869	20 %	40 %	0 %	40 %	219872165
41634	NC_011852	TGAC	2	8	2111897	2111904	25 %	25 %	25 %	25 %	219872165
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41637	NC_011852	GCT	2	6	2111942	2111947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872165
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41641	NC_011852	TA	3	6	2112012	2112017	50 %	50 %	0 %	0 %	219872166
41642	NC_011852	T	6	6	2112098	2112103	0 %	100 %	0 %	0 %	219872166
41643	NC_011852	CTT	2	6	2112126	2112131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872166
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41645	NC_011852	T	6	6	2112202	2112207	0 %	100 %	0 %	0 %	219872166
41646	NC_011852	TTC	2	6	2112244	2112249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872166
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41650	NC_011852	A	6	6	2112400	2112405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41651	NC_011852	AAC	2	6	2112477	2112482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872167
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41729	NC_011852	AAAT	2	8	2116173	2116180	75 %	25 %	0 %	0 %	219872168
41730	NC_011852	TAAAAT	2	12	2116243	2116254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872168
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41980	NC_011852	CATA	2	8	2128851	2128858	50 %	25 %	0 %	25 %	219872178
41981	NC_011852	CCG	2	6	2128932	2128937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219872178
41982	NC_011852	TCT	2	6	2129051	2129056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872178
41983	NC_011852	CAC	2	6	2129064	2129069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872178
41984	NC_011852	CGT	3	9	2129181	2129189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872178
41985	NC_011852	C	6	6	2129246	2129251	0 %	0 %	0 %	100 %	219872178
41986	NC_011852	TCT	2	6	2129395	2129400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872179
41987	NC_011852	ATC	2	6	2129496	2129501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872179
41988	NC_011852	CACTTT	2	12	2129582	2129593	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219872179
41989	NC_011852	TATATT	2	12	2129621	2129632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872179
41990	NC_011852	TAA	2	6	2129652	2129657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872179
41991	NC_011852	TGTA	2	8	2129721	2129728	25 %	50 %	25 %	0 %	219872179
41992	NC_011852	A	6	6	2129761	2129766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41993	NC_011852	TTGAA	2	10	2129806	2129815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41994	NC_011852	TCACGA	2	12	2129824	2129835	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219872180
41995	NC_011852	CACG	2	8	2129860	2129867	25 %	0 %	25 %	50 %	219872180
41996	NC_011852	ATTG	2	8	2129893	2129900	25 %	50 %	25 %	0 %	219872180
41997	NC_011852	CAC	2	6	2129925	2129930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872180
41998	NC_011852	T	6	6	2129966	2129971	0 %	100 %	0 %	0 %	219872180
41999	NC_011852	GTTT	2	8	2129975	2129982	0 %	75 %	25 %	0 %	219872180
42000	NC_011852	GTG	2	6	2129993	2129998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219872180

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