MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_011852	TGA	2	6	2080573	2080578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872136
41002	NC_011852	TCA	2	6	2080579	2080584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872136
41003	NC_011852	GAT	2	6	2080624	2080629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872136
41004	NC_011852	TCA	2	6	2080686	2080691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872136
41005	NC_011852	TTC	2	6	2080715	2080720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872136
41006	NC_011852	ATTC	2	8	2080757	2080764	25 %	50 %	0 %	25 %	219872136
41007	NC_011852	GTT	2	6	2080785	2080790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872136
41008	NC_011852	AG	3	6	2080863	2080868	50 %	0 %	50 %	0 %	219872136
41009	NC_011852	GT	3	6	2080938	2080943	0 %	50 %	50 %	0 %	219872136
41010	NC_011852	TAC	2	6	2080979	2080984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872136
41011	NC_011852	TGC	2	6	2081003	2081008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872136
41012	NC_011852	ACAA	2	8	2081117	2081124	75 %	0 %	0 %	25 %	219872136
41013	NC_011852	A	6	6	2081174	2081179	100 %	0 %	0 %	0 %	219872136
41014	NC_011852	TTG	2	6	2081198	2081203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872136
41015	NC_011852	GAG	2	6	2081332	2081337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219872137
41016	NC_011852	T	6	6	2081350	2081355	0 %	100 %	0 %	0 %	219872137
41017	NC_011852	ATC	2	6	2081370	2081375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
41018	NC_011852	AT	3	6	2081440	2081445	50 %	50 %	0 %	0 %	219872137
41019	NC_011852	A	6	6	2081472	2081477	100 %	0 %	0 %	0 %	219872137
41020	NC_011852	AAAT	2	8	2081521	2081528	75 %	25 %	0 %	0 %	219872137
41021	NC_011852	TCA	2	6	2081538	2081543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
41022	NC_011852	T	6	6	2081559	2081564	0 %	100 %	0 %	0 %	219872137
41023	NC_011852	CCT	2	6	2081565	2081570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219872137
41024	NC_011852	TC	3	6	2081583	2081588	0 %	50 %	0 %	50 %	219872137
41025	NC_011852	ATA	2	6	2081601	2081606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872137
41026	NC_011852	AAT	2	6	2081641	2081646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872137
41027	NC_011852	AAT	2	6	2081729	2081734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872137
41028	NC_011852	CTA	2	6	2081745	2081750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
41029	NC_011852	TCA	2	6	2081763	2081768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
41030	NC_011852	CCA	2	6	2081771	2081776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872137
41031	NC_011852	GTT	2	6	2081833	2081838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872137
41032	NC_011852	TCA	2	6	2081853	2081858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
41033	NC_011852	AT	3	6	2081863	2081868	50 %	50 %	0 %	0 %	219872137
41034	NC_011852	TCC	2	6	2081990	2081995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219872137
41035	NC_011852	AC	3	6	2082027	2082032	50 %	0 %	0 %	50 %	219872137
41036	NC_011852	ATC	2	6	2082080	2082085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872137
41037	NC_011852	ATT	2	6	2082116	2082121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872137
41038	NC_011852	TCTG	2	8	2082143	2082150	0 %	50 %	25 %	25 %	219872137
41039	NC_011852	TAAA	2	8	2082172	2082179	75 %	25 %	0 %	0 %	219872137
41040	NC_011852	T	6	6	2082258	2082263	0 %	100 %	0 %	0 %	219872137
41041	NC_011852	TAA	2	6	2082287	2082292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872137
41042	NC_011852	GTA	2	6	2082327	2082332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872137
41043	NC_011852	GTC	2	6	2082422	2082427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872138
41044	NC_011852	CT	3	6	2082475	2082480	0 %	50 %	0 %	50 %	219872138
41045	NC_011852	AG	3	6	2082484	2082489	50 %	0 %	50 %	0 %	219872138
41046	NC_011852	CCT	2	6	2082490	2082495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219872138
41047	NC_011852	ATG	2	6	2082526	2082531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872138
41048	NC_011852	TTG	2	6	2082543	2082548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872138
41049	NC_011852	TTTTG	2	10	2082565	2082574	0 %	80 %	20 %	0 %	219872138
41050	NC_011852	TCA	2	6	2082644	2082649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872138
41051	NC_011852	AAAT	2	8	2082703	2082710	75 %	25 %	0 %	0 %	219872138
41052	NC_011852	GAAA	2	8	2082738	2082745	75 %	0 %	25 %	0 %	219872138
41053	NC_011852	ATT	2	6	2082779	2082784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872138
41054	NC_011852	ACA	2	6	2082959	2082964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872138
41055	NC_011852	AGCTA	2	10	2083021	2083030	40 %	20 %	20 %	20 %	219872138
41056	NC_011852	AAC	2	6	2083057	2083062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872138
41057	NC_011852	TAC	2	6	2083111	2083116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872138
41058	NC_011852	TTTA	2	8	2083210	2083217	25 %	75 %	0 %	0 %	219872138
41059	NC_011852	CTCCAG	2	12	2083254	2083265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219872138
41060	NC_011852	AT	3	6	2083298	2083303	50 %	50 %	0 %	0 %	219872138
41061	NC_011852	CAC	2	6	2083496	2083501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872139
41062	NC_011852	TAA	2	6	2083531	2083536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872139
41063	NC_011852	GTT	2	6	2083549	2083554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872139
41064	NC_011852	TAA	2	6	2083736	2083741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219872139
41065	NC_011852	GTT	2	6	2083813	2083818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872139
41066	NC_011852	CACT	2	8	2083879	2083886	25 %	25 %	0 %	50 %	219872139
41067	NC_011852	AG	3	6	2083995	2084000	50 %	0 %	50 %	0 %	219872139
41068	NC_011852	TC	3	6	2084037	2084042	0 %	50 %	0 %	50 %	219872139
41069	NC_011852	CCA	2	6	2084050	2084055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872139
41070	NC_011852	GCAA	2	8	2084101	2084108	50 %	0 %	25 %	25 %	219872139
41071	NC_011852	CTG	2	6	2084183	2084188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872139
41072	NC_011852	CTG	2	6	2084209	2084214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872139
41073	NC_011852	TTG	2	6	2084221	2084226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872139
41074	NC_011852	GT	3	6	2084308	2084313	0 %	50 %	50 %	0 %	219872139
41075	NC_011852	ATTG	2	8	2084319	2084326	25 %	50 %	25 %	0 %	219872139
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41077	NC_011852	GAC	2	6	2084386	2084391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872139
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41083	NC_011852	GTTT	2	8	2084591	2084598	0 %	75 %	25 %	0 %	219872140
41084	NC_011852	TTC	2	6	2084652	2084657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872140
41085	NC_011852	TTC	2	6	2084679	2084684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872140
41086	NC_011852	TTGC	2	8	2084692	2084699	0 %	50 %	25 %	25 %	219872140
41087	NC_011852	AGC	2	6	2084751	2084756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872140
41088	NC_011852	TGC	2	6	2084775	2084780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872140
41089	NC_011852	CTG	2	6	2084996	2085001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872140
41090	NC_011852	GTTG	2	8	2085004	2085011	0 %	50 %	50 %	0 %	219872140
41091	NC_011852	CCA	3	9	2085117	2085125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872140
41092	NC_011852	AAC	2	6	2085151	2085156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219872140
41093	NC_011852	CTT	2	6	2085233	2085238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872140
41094	NC_011852	CACG	2	8	2085323	2085330	25 %	0 %	25 %	50 %	219872140
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41096	NC_011852	AAAATA	2	12	2085352	2085363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219872140
41097	NC_011852	T	7	7	2085389	2085395	0 %	100 %	0 %	0 %	219872140
41098	NC_011852	T	6	6	2085451	2085456	0 %	100 %	0 %	0 %	219872140
41099	NC_011852	TGT	2	6	2085460	2085465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872140
41100	NC_011852	AAAG	2	8	2085469	2085476	75 %	0 %	25 %	0 %	219872140
41101	NC_011852	GTCATT	2	12	2085490	2085501	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219872140
41102	NC_011852	TA	3	6	2085510	2085515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41103	NC_011852	CGCT	2	8	2085624	2085631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41104	NC_011852	ACTT	2	8	2085634	2085641	25 %	50 %	0 %	25 %	219872141
41105	NC_011852	AGGCAA	2	12	2085729	2085740	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219872141
41106	NC_011852	TAATTG	2	12	2085762	2085773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219872141
41107	NC_011852	ATC	2	6	2085807	2085812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
41108	NC_011852	TCA	2	6	2085817	2085822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
41109	NC_011852	TG	3	6	2085832	2085837	0 %	50 %	50 %	0 %	219872141
41110	NC_011852	CAT	2	6	2085911	2085916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
41111	NC_011852	TCA	2	6	2085931	2085936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
41112	NC_011852	TGTT	2	8	2086113	2086120	0 %	75 %	25 %	0 %	219872141
41113	NC_011852	TTCA	2	8	2086149	2086156	25 %	50 %	0 %	25 %	219872141
41114	NC_011852	T	6	6	2086164	2086169	0 %	100 %	0 %	0 %	219872141
41115	NC_011852	AGT	2	6	2086224	2086229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872141
41116	NC_011852	TTG	2	6	2086253	2086258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872141
41117	NC_011852	ACC	2	6	2086272	2086277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219872141
41118	NC_011852	TTG	2	6	2086323	2086328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872141
41119	NC_011852	AATT	2	8	2086350	2086357	50 %	50 %	0 %	0 %	219872141
41120	NC_011852	TAC	2	6	2086398	2086403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
41121	NC_011852	TCA	2	6	2086414	2086419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
41122	NC_011852	TCA	2	6	2086471	2086476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
41123	NC_011852	A	6	6	2086575	2086580	100 %	0 %	0 %	0 %	219872141
41124	NC_011852	TCAA	2	8	2086624	2086631	50 %	25 %	0 %	25 %	219872141
41125	NC_011852	CGTC	2	8	2086661	2086668	0 %	25 %	25 %	50 %	219872141
41126	NC_011852	CAT	2	6	2086697	2086702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
41127	NC_011852	CTG	2	6	2086792	2086797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219872141
41128	NC_011852	ATC	2	6	2086857	2086862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872141
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41133	NC_011852	AAG	2	6	2087123	2087128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872141
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41141	NC_011852	CAT	2	6	2087536	2087541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41142	NC_011852	ATAG	2	8	2087600	2087607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41143	NC_011852	TAA	2	6	2087621	2087626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41144	NC_011852	T	6	6	2087637	2087642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41145	NC_011852	TGAT	2	8	2087697	2087704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41146	NC_011852	A	6	6	2087715	2087720	100 %	0 %	0 %	0 %	219872142
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41185	NC_011852	TTATG	2	10	2089573	2089582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41186	NC_011852	TAGA	2	8	2089599	2089606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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41227	NC_011852	A	6	6	2091429	2091434	100 %	0 %	0 %	0 %	219872145
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41230	NC_011852	A	6	6	2091620	2091625	100 %	0 %	0 %	0 %	219872145
41231	NC_011852	TAT	2	6	2091778	2091783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872146
41232	NC_011852	ATT	2	6	2091851	2091856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872146
41233	NC_011852	GCG	2	6	2091932	2091937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219872146
41234	NC_011852	CT	3	6	2091953	2091958	0 %	50 %	0 %	50 %	219872146
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41356	NC_011852	AACG	2	8	2098158	2098165	50 %	0 %	25 %	25 %	219872153
41357	NC_011852	ATT	2	6	2098296	2098301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219872153
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41418	NC_011852	AAAAT	2	10	2101421	2101430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41451	NC_011852	TA	3	6	2103266	2103271	50 %	50 %	0 %	0 %	219872159
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41474	NC_011852	GAC	2	6	2104432	2104437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872160
41475	NC_011852	TTC	2	6	2104463	2104468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219872160
41476	NC_011852	AATA	2	8	2104619	2104626	75 %	25 %	0 %	0 %	219872160
41477	NC_011852	TGA	2	6	2104896	2104901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41478	NC_011852	AC	3	6	2105011	2105016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41479	NC_011852	GT	3	6	2105020	2105025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41480	NC_011852	CCG	2	6	2105026	2105031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41481	NC_011852	TTG	2	6	2105045	2105050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41482	NC_011852	AC	3	6	2105057	2105062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41483	NC_011852	GT	3	6	2105066	2105071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41484	NC_011852	ATCAC	2	10	2105156	2105165	40 %	20 %	0 %	40 %	219872161
41485	NC_011852	GCA	2	6	2105183	2105188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219872161
41486	NC_011852	ATC	2	6	2105194	2105199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872161
41487	NC_011852	T	6	6	2105247	2105252	0 %	100 %	0 %	0 %	219872161
41488	NC_011852	TGA	2	6	2105363	2105368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219872161
41489	NC_011852	CAT	3	9	2105379	2105387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872161
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41491	NC_011852	TGT	2	6	2105484	2105489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219872161
41492	NC_011852	T	6	6	2105491	2105496	0 %	100 %	0 %	0 %	219872161
41493	NC_011852	AATT	2	8	2105506	2105513	50 %	50 %	0 %	0 %	219872161
41494	NC_011852	GTGC	2	8	2105535	2105542	0 %	25 %	50 %	25 %	219872161
41495	NC_011852	TAGA	2	8	2105631	2105638	50 %	25 %	25 %	0 %	219872161
41496	NC_011852	TATTCA	2	12	2105685	2105696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	219872161
41497	NC_011852	CAT	2	6	2105716	2105721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219872161
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41499	NC_011852	GAA	2	6	2105882	2105887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219872161
41500	NC_011852	AC	3	6	2105888	2105893	50 %	0 %	0 %	50 %	219872161

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