MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_011852	TCGC	2	8	1501095	1501102	0 %	25 %	25 %	50 %	219871649
29503	NC_011852	TTG	3	9	1501189	1501197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871649
29504	NC_011852	CTT	2	6	1501248	1501253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871649
29505	NC_011852	GCTT	2	8	1501336	1501343	0 %	50 %	25 %	25 %	219871649
29506	NC_011852	TAA	2	6	1501363	1501368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871649
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29512	NC_011852	ATC	2	6	1501612	1501617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871649
29513	NC_011852	CTT	2	6	1501662	1501667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871649
29514	NC_011852	CCTGTA	2	12	1501671	1501682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219871649
29515	NC_011852	CTT	2	6	1501722	1501727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871649
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29519	NC_011852	TCGA	2	8	1502018	1502025	25 %	25 %	25 %	25 %	219871649
29520	NC_011852	GTGA	2	8	1502122	1502129	25 %	25 %	50 %	0 %	219871649
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29534	NC_011852	A	6	6	1502929	1502934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29537	NC_011852	TA	3	6	1503001	1503006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29538	NC_011852	TAT	2	6	1503015	1503020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29539	NC_011852	TTA	2	6	1503026	1503031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29540	NC_011852	GAA	2	6	1503039	1503044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29541	NC_011852	TAA	2	6	1503067	1503072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29542	NC_011852	TGA	2	6	1503103	1503108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871650
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29548	NC_011852	TCTAT	2	10	1503270	1503279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29549	NC_011852	A	7	7	1503330	1503336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29617	NC_011852	A	7	7	1506093	1506099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29618	NC_011852	GGCT	2	8	1506121	1506128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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29977	NC_011852	AAC	2	6	1525449	1525454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871669
29978	NC_011852	TAA	2	6	1525455	1525460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871669
29979	NC_011852	CAT	2	6	1525493	1525498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871669
29980	NC_011852	TAA	2	6	1525668	1525673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871669
29981	NC_011852	TAA	2	6	1525692	1525697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871669
29982	NC_011852	T	6	6	1525701	1525706	0 %	100 %	0 %	0 %	219871669
29983	NC_011852	TAA	2	6	1525733	1525738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29984	NC_011852	CAA	2	6	1525810	1525815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29985	NC_011852	AAAT	2	8	1525820	1525827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29986	NC_011852	GTAT	2	8	1525837	1525844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29987	NC_011852	T	6	6	1525902	1525907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29988	NC_011852	T	6	6	1525915	1525920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29989	NC_011852	TGA	2	6	1525933	1525938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29990	NC_011852	A	6	6	1525969	1525974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29991	NC_011852	T	7	7	1525999	1526005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29992	NC_011852	GA	3	6	1526020	1526025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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29998	NC_011852	TCT	2	6	1526375	1526380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871670
29999	NC_011852	TCC	2	6	1526422	1526427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219871670
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