MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29120	NC_011852	TGA	2	6	1480537	1480542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871633
29121	NC_011852	TGA	2	6	1480564	1480569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871633
29122	NC_011852	ACGG	2	8	1480802	1480809	25 %	0 %	50 %	25 %	219871633
29123	NC_011852	TGG	2	6	1480905	1480910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871633
29124	NC_011852	ATA	2	6	1480914	1480919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871633
29125	NC_011852	AATG	2	8	1480966	1480973	50 %	25 %	25 %	0 %	219871633
29126	NC_011852	TGAT	2	8	1480995	1481002	25 %	50 %	25 %	0 %	219871633
29127	NC_011852	CCG	2	6	1481020	1481025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871633
29128	NC_011852	GTGC	2	8	1481090	1481097	0 %	25 %	50 %	25 %	219871633
29129	NC_011852	AACG	2	8	1481111	1481118	50 %	0 %	25 %	25 %	219871633
29130	NC_011852	GCGT	2	8	1481127	1481134	0 %	25 %	50 %	25 %	219871633
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29133	NC_011852	CGG	2	6	1481355	1481360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871633
29134	NC_011852	T	6	6	1481460	1481465	0 %	100 %	0 %	0 %	219871634
29135	NC_011852	AACC	2	8	1481549	1481556	50 %	0 %	0 %	50 %	219871634
29136	NC_011852	AAGC	2	8	1481573	1481580	50 %	0 %	25 %	25 %	219871634
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29141	NC_011852	ATC	2	6	1481703	1481708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871634
29142	NC_011852	T	6	6	1481730	1481735	0 %	100 %	0 %	0 %	219871634
29143	NC_011852	ACC	2	6	1481736	1481741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871634
29144	NC_011852	TAT	2	6	1481828	1481833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871634
29145	NC_011852	TTA	2	6	1481902	1481907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871634
29146	NC_011852	T	7	7	1482003	1482009	0 %	100 %	0 %	0 %	219871635
29147	NC_011852	GGCA	2	8	1482093	1482100	25 %	0 %	50 %	25 %	219871635
29148	NC_011852	TAAG	2	8	1482123	1482130	50 %	25 %	25 %	0 %	219871635
29149	NC_011852	GA	4	8	1482328	1482335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29150	NC_011852	TAT	2	6	1482386	1482391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871636
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29152	NC_011852	ATT	2	6	1482484	1482489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871636
29153	NC_011852	TGG	2	6	1482516	1482521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871636
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29157	NC_011852	CATTGC	2	12	1482732	1482743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219871636
29158	NC_011852	T	6	6	1482757	1482762	0 %	100 %	0 %	0 %	219871636
29159	NC_011852	A	7	7	1482817	1482823	100 %	0 %	0 %	0 %	219871636
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29161	NC_011852	TGG	2	6	1482887	1482892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871636
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29165	NC_011852	T	6	6	1483165	1483170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29166	NC_011852	AGT	2	6	1483232	1483237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29190	NC_011852	A	6	6	1484364	1484369	100 %	0 %	0 %	0 %	219871637
29191	NC_011852	ATA	2	6	1484433	1484438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871637
29192	NC_011852	ATA	2	6	1484533	1484538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29193	NC_011852	AACA	2	8	1484541	1484548	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29194	NC_011852	TGG	2	6	1484565	1484570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29195	NC_011852	TAAA	2	8	1484649	1484656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29196	NC_011852	TAATT	2	10	1484659	1484668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29227	NC_011852	C	7	7	1486315	1486321	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29228	NC_011852	GGGAA	2	10	1486353	1486362	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29229	NC_011852	A	7	7	1486390	1486396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29230	NC_011852	GAA	2	6	1486420	1486425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29231	NC_011852	ATTT	2	8	1486453	1486460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29232	NC_011852	TTC	2	6	1486591	1486596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29233	NC_011852	T	7	7	1486610	1486616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29234	NC_011852	ATC	2	6	1486651	1486656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871639
29235	NC_011852	ATC	2	6	1486694	1486699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871639
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29237	NC_011852	GTC	2	6	1486789	1486794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871639
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29487	NC_011852	GT	3	6	1500335	1500340	0 %	50 %	50 %	0 %	219871648
29488	NC_011852	CCAAT	2	10	1500368	1500377	40 %	20 %	0 %	40 %	219871648
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29490	NC_011852	TCA	2	6	1500486	1500491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871648
29491	NC_011852	AAT	2	6	1500556	1500561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871648
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29496	NC_011852	CAT	2	6	1500745	1500750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29497	NC_011852	CA	3	6	1500786	1500791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29498	NC_011852	CTGG	2	8	1500844	1500851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29499	NC_011852	TTG	2	6	1500888	1500893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29500	NC_011852	AGT	2	6	1500918	1500923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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