MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_011852	ACT	2	6	1450051	1450056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28502	NC_011852	TA	3	6	1450065	1450070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28503	NC_011852	TGT	2	6	1450177	1450182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871610
28504	NC_011852	ATC	2	6	1450236	1450241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871610
28505	NC_011852	A	6	6	1450243	1450248	100 %	0 %	0 %	0 %	219871610
28506	NC_011852	A	7	7	1450266	1450272	100 %	0 %	0 %	0 %	219871610
28507	NC_011852	TTA	2	6	1450347	1450352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871610
28508	NC_011852	ACT	2	6	1450462	1450467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871610
28509	NC_011852	CGG	2	6	1450493	1450498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871610
28510	NC_011852	GTC	2	6	1450534	1450539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871610
28511	NC_011852	TTA	2	6	1450552	1450557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871610
28512	NC_011852	CTT	2	6	1450578	1450583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871610
28513	NC_011852	TAG	2	6	1450585	1450590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871610
28514	NC_011852	GTA	2	6	1450593	1450598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871610
28515	NC_011852	ATT	2	6	1450619	1450624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871610
28516	NC_011852	CAG	2	6	1450654	1450659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871610
28517	NC_011852	CT	3	6	1450668	1450673	0 %	50 %	0 %	50 %	219871610
28518	NC_011852	GAA	2	6	1450686	1450691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871610
28519	NC_011852	ATT	2	6	1450773	1450778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871610
28520	NC_011852	TAC	2	6	1450785	1450790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871610
28521	NC_011852	ATC	2	6	1450821	1450826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871610
28522	NC_011852	TTC	2	6	1450842	1450847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871610
28523	NC_011852	CAG	2	6	1450870	1450875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871610
28524	NC_011852	TTC	2	6	1450929	1450934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871610
28525	NC_011852	TTC	2	6	1450965	1450970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871610
28526	NC_011852	TGGT	2	8	1451164	1451171	0 %	50 %	50 %	0 %	219871610
28527	NC_011852	TTC	2	6	1451246	1451251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871610
28528	NC_011852	CTT	2	6	1451258	1451263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871610
28529	NC_011852	GGT	2	6	1451274	1451279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871610
28530	NC_011852	GCA	2	6	1451340	1451345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871610
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28533	NC_011852	TACTT	2	10	1451472	1451481	20 %	60 %	0 %	20 %	219871610
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28535	NC_011852	CAG	2	6	1451518	1451523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871610
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28537	NC_011852	CAG	2	6	1451572	1451577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871610
28538	NC_011852	CTT	2	6	1451603	1451608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871610
28539	NC_011852	AGC	3	9	1451672	1451680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871610
28540	NC_011852	TTC	2	6	1451694	1451699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871610
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28542	NC_011852	AAG	2	6	1451722	1451727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871610
28543	NC_011852	TGA	2	6	1451744	1451749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871610
28544	NC_011852	TTG	2	6	1451776	1451781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28545	NC_011852	A	6	6	1451837	1451842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28546	NC_011852	TA	3	6	1451863	1451868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28547	NC_011852	T	7	7	1451898	1451904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28548	NC_011852	T	6	6	1451985	1451990	0 %	100 %	0 %	0 %	219871611
28549	NC_011852	TTC	2	6	1452012	1452017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871611
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28551	NC_011852	GTT	2	6	1452430	1452435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871611
28552	NC_011852	GT	3	6	1452438	1452443	0 %	50 %	50 %	0 %	219871611
28553	NC_011852	TCCA	2	8	1452562	1452569	25 %	25 %	0 %	50 %	219871611
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28555	NC_011852	A	6	6	1452799	1452804	100 %	0 %	0 %	0 %	219871611
28556	NC_011852	T	6	6	1452878	1452883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28557	NC_011852	TAT	2	6	1452895	1452900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28558	NC_011852	AAT	2	6	1452957	1452962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28559	NC_011852	TTA	2	6	1453037	1453042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28560	NC_011852	CCA	2	6	1453091	1453096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28561	NC_011852	TAAA	2	8	1453127	1453134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28562	NC_011852	TCA	2	6	1453139	1453144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28563	NC_011852	TA	3	6	1453179	1453184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28564	NC_011852	T	6	6	1453187	1453192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28569	NC_011852	GTT	2	6	1453433	1453438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28571	NC_011852	ATT	2	6	1453545	1453550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28572	NC_011852	T	6	6	1453597	1453602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28573	NC_011852	TTA	2	6	1453690	1453695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28574	NC_011852	A	7	7	1453715	1453721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28576	NC_011852	AT	3	6	1453873	1453878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28577	NC_011852	ATT	2	6	1453881	1453886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28579	NC_011852	ATA	2	6	1454064	1454069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28593	NC_011852	TCA	3	9	1454853	1454861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871613
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28600	NC_011852	TC	3	6	1455067	1455072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28601	NC_011852	AAT	2	6	1455084	1455089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28602	NC_011852	ATT	2	6	1455147	1455152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28603	NC_011852	TCA	2	6	1455186	1455191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871614
28604	NC_011852	CTTTTG	2	12	1455214	1455225	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	219871614
28605	NC_011852	TAC	2	6	1455257	1455262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871614
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28608	NC_011852	TTTC	2	8	1455355	1455362	0 %	75 %	0 %	25 %	219871614
28609	NC_011852	TCA	2	6	1455372	1455377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871614
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28986	NC_011852	GCT	2	6	1473585	1473590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871628
28987	NC_011852	ACT	2	6	1473591	1473596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871628
28988	NC_011852	AG	3	6	1473753	1473758	50 %	0 %	50 %	0 %	219871628
28989	NC_011852	TTTA	2	8	1473835	1473842	25 %	75 %	0 %	0 %	219871628
28990	NC_011852	GAT	2	6	1473880	1473885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871628
28991	NC_011852	T	6	6	1474312	1474317	0 %	100 %	0 %	0 %	219871629
28992	NC_011852	A	6	6	1474319	1474324	100 %	0 %	0 %	0 %	219871629
28993	NC_011852	GCTC	2	8	1474457	1474464	0 %	25 %	25 %	50 %	219871629
28994	NC_011852	TAAGCC	2	12	1474570	1474581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219871629
28995	NC_011852	TGGTT	2	10	1474592	1474601	0 %	60 %	40 %	0 %	219871629
28996	NC_011852	GCG	2	6	1474616	1474621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871629
28997	NC_011852	T	6	6	1474634	1474639	0 %	100 %	0 %	0 %	219871629
28998	NC_011852	AG	3	6	1474708	1474713	50 %	0 %	50 %	0 %	219871629
28999	NC_011852	TG	4	8	1474742	1474749	0 %	50 %	50 %	0 %	219871629
29000	NC_011852	A	6	6	1474757	1474762	100 %	0 %	0 %	0 %	219871629

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