MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_011852	CAAT	2	8	1421127	1421134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28002	NC_011852	GGC	2	6	1421180	1421185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28003	NC_011852	ACA	2	6	1421188	1421193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28004	NC_011852	TGT	2	6	1421219	1421224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28005	NC_011852	AAC	2	6	1421242	1421247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28006	NC_011852	CAT	2	6	1421328	1421333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28007	NC_011852	CAAGT	2	10	1421356	1421365	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28008	NC_011852	TGGCAA	2	12	1421453	1421464	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28009	NC_011852	GAA	2	6	1421495	1421500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28010	NC_011852	TGG	2	6	1421531	1421536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28011	NC_011852	GGC	2	6	1421565	1421570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28012	NC_011852	CA	3	6	1421610	1421615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28013	NC_011852	GGT	2	6	1421655	1421660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28014	NC_011852	CAT	2	6	1421803	1421808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28015	NC_011852	TAAG	2	8	1421813	1421820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28016	NC_011852	A	6	6	1421832	1421837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28017	NC_011852	AAT	2	6	1421851	1421856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28018	NC_011852	A	6	6	1421864	1421869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28019	NC_011852	A	6	6	1421896	1421901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28020	NC_011852	ATA	2	6	1421950	1421955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28021	NC_011852	TAT	2	6	1421975	1421980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28022	NC_011852	AAC	2	6	1421989	1421994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28023	NC_011852	TCAA	2	8	1422046	1422053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28024	NC_011852	GACC	2	8	1422107	1422114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28025	NC_011852	TTCGT	2	10	1422179	1422188	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28026	NC_011852	GGCA	2	8	1422288	1422295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28027	NC_011852	T	6	6	1422350	1422355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28028	NC_011852	TCG	2	6	1422424	1422429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28029	NC_011852	A	6	6	1422437	1422442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28030	NC_011852	GAT	2	6	1422461	1422466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28031	NC_011852	A	7	7	1422508	1422514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28032	NC_011852	TGAT	2	8	1422561	1422568	25 %	50 %	25 %	0 %	219871587
28033	NC_011852	TGC	2	6	1422648	1422653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871587
28034	NC_011852	TTG	2	6	1422691	1422696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871587
28035	NC_011852	TAT	2	6	1422719	1422724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871587
28036	NC_011852	CAT	2	6	1422794	1422799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871587
28037	NC_011852	TC	3	6	1422850	1422855	0 %	50 %	0 %	50 %	219871587
28038	NC_011852	TCG	2	6	1422896	1422901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871587
28039	NC_011852	CTG	2	6	1422938	1422943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871587
28040	NC_011852	CTG	2	6	1423013	1423018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871587
28041	NC_011852	GCC	2	6	1423050	1423055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871587
28042	NC_011852	TGGT	2	8	1423082	1423089	0 %	50 %	50 %	0 %	219871587
28043	NC_011852	TGT	2	6	1423095	1423100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871587
28044	NC_011852	ATT	2	6	1423191	1423196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871587
28045	NC_011852	ACC	2	6	1423246	1423251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871587
28046	NC_011852	CTTCAC	2	12	1423322	1423333	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	219871587
28047	NC_011852	T	6	6	1423344	1423349	0 %	100 %	0 %	0 %	219871587
28048	NC_011852	CAC	2	6	1423373	1423378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871587
28049	NC_011852	CGG	2	6	1423496	1423501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219871587
28050	NC_011852	CAT	2	6	1423607	1423612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871587
28051	NC_011852	TTG	2	6	1423629	1423634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871587
28052	NC_011852	TCT	2	6	1423687	1423692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871587
28053	NC_011852	CTGC	2	8	1423715	1423722	0 %	25 %	25 %	50 %	219871587
28054	NC_011852	GTT	2	6	1423746	1423751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871587
28055	NC_011852	TCTT	2	8	1423759	1423766	0 %	75 %	0 %	25 %	219871587
28056	NC_011852	TAT	2	6	1423790	1423795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871587
28057	NC_011852	CAA	2	6	1423856	1423861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871587
28058	NC_011852	TCTTGA	2	12	1423864	1423875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219871587
28059	NC_011852	T	6	6	1423946	1423951	0 %	100 %	0 %	0 %	219871587
28060	NC_011852	CTG	2	6	1423970	1423975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871587
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28065	NC_011852	GTTG	2	8	1424307	1424314	0 %	50 %	50 %	0 %	219871587
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28069	NC_011852	GTA	2	6	1424467	1424472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871587
28070	NC_011852	TGT	2	6	1424532	1424537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871587
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28072	NC_011852	TCT	2	6	1424656	1424661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871587
28073	NC_011852	TGA	2	6	1424663	1424668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871587
28074	NC_011852	GTC	2	6	1424673	1424678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871587
28075	NC_011852	T	6	6	1424688	1424693	0 %	100 %	0 %	0 %	219871587
28076	NC_011852	TCTT	2	8	1424746	1424753	0 %	75 %	0 %	25 %	219871587
28077	NC_011852	TAT	2	6	1424780	1424785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871587
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28079	NC_011852	TGGT	2	8	1424850	1424857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28080	NC_011852	TTTG	2	8	1424993	1425000	0 %	75 %	25 %	0 %	219871588
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28087	NC_011852	TCTT	2	8	1425272	1425279	0 %	75 %	0 %	25 %	219871588
28088	NC_011852	GTC	2	6	1425467	1425472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871588
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28091	NC_011852	GGT	2	6	1425599	1425604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28092	NC_011852	TATT	2	8	1425652	1425659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28093	NC_011852	T	7	7	1425693	1425699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28094	NC_011852	CTTCT	2	10	1425737	1425746	0 %	60 %	0 %	40 %	219871589
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28103	NC_011852	TTA	2	6	1426174	1426179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871589
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28105	NC_011852	T	6	6	1426416	1426421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28106	NC_011852	ATCA	2	8	1426445	1426452	50 %	25 %	0 %	25 %	219871590
28107	NC_011852	TCAA	2	8	1426470	1426477	50 %	25 %	0 %	25 %	219871590
28108	NC_011852	TAAT	2	8	1426498	1426505	50 %	50 %	0 %	0 %	219871590
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28118	NC_011852	GTGA	2	8	1427228	1427235	25 %	25 %	50 %	0 %	219871590
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28500	NC_011852	TAT	2	6	1449902	1449907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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