MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_011852	TAG	2	6	1371959	1371964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27003	NC_011852	TAG	2	6	1371971	1371976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27004	NC_011852	AAT	2	6	1371984	1371989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27005	NC_011852	TA	3	6	1372039	1372044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27006	NC_011852	TA	3	6	1372047	1372052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27007	NC_011852	ATC	2	6	1372089	1372094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871542
27008	NC_011852	CTG	2	6	1372097	1372102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871542
27009	NC_011852	A	6	6	1372119	1372124	100 %	0 %	0 %	0 %	219871542
27010	NC_011852	ACC	2	6	1372183	1372188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871542
27011	NC_011852	CAA	2	6	1372192	1372197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871542
27012	NC_011852	A	6	6	1372212	1372217	100 %	0 %	0 %	0 %	219871542
27013	NC_011852	A	6	6	1372302	1372307	100 %	0 %	0 %	0 %	219871542
27014	NC_011852	AAC	2	6	1372340	1372345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871542
27015	NC_011852	ATT	2	6	1372393	1372398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871542
27016	NC_011852	ATTT	2	8	1372452	1372459	25 %	75 %	0 %	0 %	219871542
27017	NC_011852	TGAA	2	8	1372526	1372533	50 %	25 %	25 %	0 %	219871542
27018	NC_011852	GCC	2	6	1372735	1372740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871542
27019	NC_011852	AAC	2	6	1372784	1372789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871542
27020	NC_011852	ATT	2	6	1372855	1372860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871542
27021	NC_011852	AGC	2	6	1372992	1372997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871542
27022	NC_011852	CTT	2	6	1373208	1373213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871542
27023	NC_011852	GCA	2	6	1373299	1373304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871542
27024	NC_011852	CTCTC	2	10	1373347	1373356	0 %	40 %	0 %	60 %	219871542
27025	NC_011852	TCA	3	9	1373472	1373480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871543
27026	NC_011852	GTG	2	6	1373548	1373553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871543
27027	NC_011852	CT	3	6	1373619	1373624	0 %	50 %	0 %	50 %	219871543
27028	NC_011852	TC	3	6	1373628	1373633	0 %	50 %	0 %	50 %	219871543
27029	NC_011852	TAC	2	6	1373841	1373846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871543
27030	NC_011852	TTAT	2	8	1373915	1373922	25 %	75 %	0 %	0 %	219871544
27031	NC_011852	TCA	2	6	1373947	1373952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871544
27032	NC_011852	AGT	2	6	1373980	1373985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871544
27033	NC_011852	GA	3	6	1374029	1374034	50 %	0 %	50 %	0 %	219871544
27034	NC_011852	TGG	2	6	1374042	1374047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219871544
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27036	NC_011852	TCT	2	6	1374109	1374114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871544
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27039	NC_011852	ATA	2	6	1374291	1374296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871544
27040	NC_011852	T	7	7	1374358	1374364	0 %	100 %	0 %	0 %	219871544
27041	NC_011852	TA	3	6	1374371	1374376	50 %	50 %	0 %	0 %	219871544
27042	NC_011852	AAAT	2	8	1374425	1374432	75 %	25 %	0 %	0 %	219871544
27043	NC_011852	CAA	2	6	1374437	1374442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871544
27044	NC_011852	ATC	2	6	1374493	1374498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871544
27045	NC_011852	TAA	2	6	1374641	1374646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27046	NC_011852	TTC	2	6	1374657	1374662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27047	NC_011852	ATT	2	6	1374670	1374675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871545
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27052	NC_011852	CT	3	6	1374855	1374860	0 %	50 %	0 %	50 %	219871545
27053	NC_011852	ATTTT	2	10	1374867	1374876	20 %	80 %	0 %	0 %	219871545
27054	NC_011852	TTC	2	6	1374968	1374973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871545
27055	NC_011852	CT	3	6	1375035	1375040	0 %	50 %	0 %	50 %	219871545
27056	NC_011852	AGGC	2	8	1375142	1375149	25 %	0 %	50 %	25 %	219871545
27057	NC_011852	T	6	6	1375270	1375275	0 %	100 %	0 %	0 %	219871546
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27059	NC_011852	T	6	6	1375325	1375330	0 %	100 %	0 %	0 %	219871546
27060	NC_011852	T	6	6	1375376	1375381	0 %	100 %	0 %	0 %	219871546
27061	NC_011852	ATA	2	6	1375390	1375395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871546
27062	NC_011852	TAA	2	6	1375403	1375408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871546
27063	NC_011852	ACC	2	6	1375439	1375444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871546
27064	NC_011852	TG	3	6	1375448	1375453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27065	NC_011852	A	7	7	1375470	1375476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27066	NC_011852	CGT	2	6	1375483	1375488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27068	NC_011852	TTC	2	6	1375557	1375562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27069	NC_011852	TCA	2	6	1375575	1375580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27072	NC_011852	TTTG	2	8	1375637	1375644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27073	NC_011852	AAG	2	6	1375646	1375651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27074	NC_011852	A	7	7	1375674	1375680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27075	NC_011852	CACTT	2	10	1375761	1375770	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27076	NC_011852	TTG	2	6	1375823	1375828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871547
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27079	NC_011852	AATC	2	8	1375931	1375938	50 %	25 %	0 %	25 %	219871547
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27088	NC_011852	AAT	2	6	1376606	1376611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871547
27089	NC_011852	TGGAC	2	10	1376711	1376720	20 %	20 %	40 %	20 %	219871547
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27094	NC_011852	TAT	2	6	1376860	1376865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871547
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27104	NC_011852	ACA	2	6	1377259	1377264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871547
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27108	NC_011852	AC	3	6	1377409	1377414	50 %	0 %	0 %	50 %	219871547
27109	NC_011852	TGT	2	6	1377463	1377468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871548
27110	NC_011852	AATT	2	8	1377495	1377502	50 %	50 %	0 %	0 %	219871548
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27117	NC_011852	TTTTG	2	10	1377790	1377799	0 %	80 %	20 %	0 %	219871548
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27244	NC_011852	AG	3	6	1384459	1384464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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27248	NC_011852	AG	3	6	1384628	1384633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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27483	NC_011852	TCA	2	6	1395367	1395372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871560
27484	NC_011852	AAT	2	6	1395378	1395383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871560
27485	NC_011852	ATC	2	6	1395441	1395446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871560
27486	NC_011852	CAA	2	6	1395455	1395460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871560
27487	NC_011852	CTT	2	6	1395494	1395499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871560
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27489	NC_011852	TATC	2	8	1395626	1395633	25 %	50 %	0 %	25 %	219871561
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