MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 44749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_011852	GAA	2	6	1320674	1320679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871493
26003	NC_011852	CTTT	2	8	1320695	1320702	0 %	75 %	0 %	25 %	219871493
26004	NC_011852	TGAT	2	8	1320798	1320805	25 %	50 %	25 %	0 %	219871493
26005	NC_011852	TTGA	2	8	1320809	1320816	25 %	50 %	25 %	0 %	219871493
26006	NC_011852	ACC	2	6	1320831	1320836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871493
26007	NC_011852	TGA	2	6	1320843	1320848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871493
26008	NC_011852	TGT	2	6	1320958	1320963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871493
26009	NC_011852	A	6	6	1320971	1320976	100 %	0 %	0 %	0 %	219871493
26010	NC_011852	ATG	2	6	1321110	1321115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871493
26011	NC_011852	GTT	2	6	1321118	1321123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871493
26012	NC_011852	TCG	2	6	1321201	1321206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871493
26013	NC_011852	TTA	2	6	1321208	1321213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871493
26014	NC_011852	TGA	2	6	1321270	1321275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871493
26015	NC_011852	AAC	2	6	1321362	1321367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871493
26016	NC_011852	A	6	6	1321482	1321487	100 %	0 %	0 %	0 %	219871493
26017	NC_011852	GGTGA	2	10	1321544	1321553	20 %	20 %	60 %	0 %	219871493
26018	NC_011852	ATG	2	6	1321569	1321574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871493
26019	NC_011852	A	6	6	1321656	1321661	100 %	0 %	0 %	0 %	219871493
26020	NC_011852	AAT	2	6	1321733	1321738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219871493
26021	NC_011852	TTA	2	6	1321777	1321782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871493
26022	NC_011852	AAG	2	6	1321788	1321793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871493
26023	NC_011852	TTG	3	9	1321833	1321841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871493
26024	NC_011852	CCT	2	6	1321941	1321946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219871493
26025	NC_011852	TCA	2	6	1321975	1321980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871493
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26027	NC_011852	GTT	2	6	1322256	1322261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871493
26028	NC_011852	TGAT	2	8	1322385	1322392	25 %	50 %	25 %	0 %	219871493
26029	NC_011852	CGA	2	6	1322425	1322430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871493
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26031	NC_011852	CCG	2	6	1322504	1322509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871493
26032	NC_011852	ATCA	2	8	1322531	1322538	50 %	25 %	0 %	25 %	219871493
26033	NC_011852	TGA	2	6	1322665	1322670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871493
26034	NC_011852	GTC	2	6	1322741	1322746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871493
26035	NC_011852	CAA	2	6	1323074	1323079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871493
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26039	NC_011852	ATT	2	6	1323322	1323327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871493
26040	NC_011852	TAC	2	6	1323333	1323338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871493
26041	NC_011852	CCGCTG	2	12	1323363	1323374	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219871493
26042	NC_011852	TGA	2	6	1323390	1323395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871493
26043	NC_011852	TCA	2	6	1323475	1323480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26044	NC_011852	A	6	6	1323495	1323500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26045	NC_011852	A	6	6	1323593	1323598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26046	NC_011852	ATCA	2	8	1323613	1323620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26047	NC_011852	GAC	2	6	1323625	1323630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26048	NC_011852	A	6	6	1323670	1323675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26049	NC_011852	AAT	2	6	1323699	1323704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26050	NC_011852	TCAAA	2	10	1323756	1323765	60 %	20 %	0 %	20 %	219871494
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26052	NC_011852	ATT	2	6	1323968	1323973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871494
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26054	NC_011852	TGA	2	6	1324109	1324114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871494
26055	NC_011852	TGT	2	6	1324187	1324192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871494
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26063	NC_011852	T	6	6	1324390	1324395	0 %	100 %	0 %	0 %	219871494
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26067	NC_011852	TAT	2	6	1324509	1324514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871494
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26073	NC_011852	ATT	2	6	1324707	1324712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871495
26074	NC_011852	GGAA	2	8	1324816	1324823	50 %	0 %	50 %	0 %	219871495
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26088	NC_011852	ATTCC	2	10	1325663	1325672	20 %	40 %	0 %	40 %	219871495
26089	NC_011852	GT	3	6	1325721	1325726	0 %	50 %	50 %	0 %	219871495
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26099	NC_011852	TCAG	2	8	1326174	1326181	25 %	25 %	25 %	25 %	219871495
26100	NC_011852	AGA	2	6	1326301	1326306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871495
26101	NC_011852	TAC	2	6	1326326	1326331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871495
26102	NC_011852	GTA	2	6	1326381	1326386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871495
26103	NC_011852	T	6	6	1326432	1326437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26104	NC_011852	TCT	2	6	1326708	1326713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871497
26105	NC_011852	GAA	2	6	1326777	1326782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871497
26106	NC_011852	TAT	2	6	1326843	1326848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871497
26107	NC_011852	TGA	2	6	1327084	1327089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871497
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26109	NC_011852	ACC	2	6	1327146	1327151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871497
26110	NC_011852	TGA	2	6	1327157	1327162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871497
26111	NC_011852	AAG	2	6	1327336	1327341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219871497
26112	NC_011852	TGGA	2	8	1327353	1327360	25 %	25 %	50 %	0 %	219871497
26113	NC_011852	A	6	6	1327385	1327390	100 %	0 %	0 %	0 %	219871497
26114	NC_011852	AGC	2	6	1327397	1327402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871497
26115	NC_011852	TGC	2	6	1327423	1327428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871497
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26238	NC_011852	AGC	2	6	1333534	1333539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871504
26239	NC_011852	AGC	2	6	1333603	1333608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871504
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26243	NC_011852	A	6	6	1333669	1333674	100 %	0 %	0 %	0 %	219871505
26244	NC_011852	T	7	7	1333691	1333697	0 %	100 %	0 %	0 %	219871505
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26350	NC_011852	T	7	7	1340192	1340198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26474	NC_011852	TGC	2	6	1345735	1345740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219871517
26475	NC_011852	CAC	2	6	1345781	1345786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219871517
26476	NC_011852	T	6	6	1345849	1345854	0 %	100 %	0 %	0 %	219871517
26477	NC_011852	ACA	2	6	1345888	1345893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219871517
26478	NC_011852	AGG	2	6	1345932	1345937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219871517
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26480	NC_011852	CTTTT	2	10	1345956	1345965	0 %	80 %	0 %	20 %	219871517
26481	NC_011852	CTTTGG	2	12	1345992	1346003	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219871517
26482	NC_011852	AGGCTC	2	12	1346028	1346039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219871517
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26485	NC_011852	GCC	2	6	1346119	1346124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219871517
26486	NC_011852	TGT	2	6	1346157	1346162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219871517
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26488	NC_011852	T	6	6	1346259	1346264	0 %	100 %	0 %	0 %	219871517
26489	NC_011852	TTAC	2	8	1346267	1346274	25 %	50 %	0 %	25 %	219871517
26490	NC_011852	T	6	6	1346282	1346287	0 %	100 %	0 %	0 %	219871518
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26493	NC_011852	ATT	2	6	1346465	1346470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219871518
26494	NC_011852	TCA	2	6	1346499	1346504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871518
26495	NC_011852	GTA	2	6	1346520	1346525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219871518
26496	NC_011852	T	6	6	1346645	1346650	0 %	100 %	0 %	0 %	219871518
26497	NC_011852	TCG	2	6	1346661	1346666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26498	NC_011852	TTC	2	6	1346744	1346749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219871519
26499	NC_011852	CAT	2	6	1346777	1346782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219871519
26500	NC_011852	CAG	2	6	1346809	1346814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219871519

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