MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 34890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011126	T	8	8	56	63	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011126	TA	3	6	87	92	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011126	A	7	7	127	133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011126	T	6	6	157	162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011126	TCAAA	2	10	178	187	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011126	A	7	7	185	191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011126	TTG	2	6	230	235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011126	A	6	6	342	347	100 %	0 %	0 %	0 %	195952381
9	NC_011126	A	6	6	570	575	100 %	0 %	0 %	0 %	195952381
10	NC_011126	AAG	2	6	590	595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952381
11	NC_011126	TCT	2	6	601	606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952381
12	NC_011126	TA	4	8	693	700	50 %	50 %	0 %	0 %	195952381
13	NC_011126	TA	3	6	711	716	50 %	50 %	0 %	0 %	195952381
14	NC_011126	CT	3	6	774	779	0 %	50 %	0 %	50 %	195952381
15	NC_011126	TA	4	8	792	799	50 %	50 %	0 %	0 %	195952381
16	NC_011126	TAT	2	6	832	837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952381
17	NC_011126	ATA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952381
18	NC_011126	GAT	2	6	901	906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952381
19	NC_011126	ACA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952381
20	NC_011126	GGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952381
21	NC_011126	TGG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952381
22	NC_011126	GAT	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952381
23	NC_011126	TAT	2	6	1107	1112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952381
24	NC_011126	TA	3	6	1165	1170	50 %	50 %	0 %	0 %	195952381
25	NC_011126	ACC	2	6	1180	1185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952381
26	NC_011126	AAC	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952381
27	NC_011126	AG	3	6	1195	1200	50 %	0 %	50 %	0 %	195952381
28	NC_011126	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	195952381
29	NC_011126	A	6	6	1327	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	195952381
30	NC_011126	TAA	2	6	1371	1376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952381
31	NC_011126	AG	3	6	1432	1437	50 %	0 %	50 %	0 %	195952381
32	NC_011126	AG	3	6	1573	1578	50 %	0 %	50 %	0 %	195952381
33	NC_011126	GATT	2	8	1594	1601	25 %	50 %	25 %	0 %	195952381
34	NC_011126	TA	3	6	1616	1621	50 %	50 %	0 %	0 %	195952382
35	NC_011126	T	7	7	1669	1675	0 %	100 %	0 %	0 %	195952382
36	NC_011126	A	6	6	1718	1723	100 %	0 %	0 %	0 %	195952382
37	NC_011126	GTT	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952382
38	NC_011126	TACC	2	8	1806	1813	25 %	25 %	0 %	50 %	195952382
39	NC_011126	AAG	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952382
40	NC_011126	A	6	6	1883	1888	100 %	0 %	0 %	0 %	195952382
41	NC_011126	A	6	6	1903	1908	100 %	0 %	0 %	0 %	195952382
42	NC_011126	A	6	6	1949	1954	100 %	0 %	0 %	0 %	195952382
43	NC_011126	CTT	2	6	1971	1976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952382
44	NC_011126	CTTT	2	8	1986	1993	0 %	75 %	0 %	25 %	195952382
45	NC_011126	AGCTAT	2	12	2017	2028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	195952382
46	NC_011126	CAT	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952382
47	NC_011126	CCA	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952382
48	NC_011126	AAG	2	6	2070	2075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952382
49	NC_011126	TAT	2	6	2104	2109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952382
50	NC_011126	TGAAA	2	10	2160	2169	60 %	20 %	20 %	0 %	195952382
51	NC_011126	TACC	2	8	2193	2200	25 %	25 %	0 %	50 %	195952382
52	NC_011126	AAGTA	2	10	2282	2291	60 %	20 %	20 %	0 %	195952382
53	NC_011126	C	6	6	2314	2319	0 %	0 %	0 %	100 %	195952382
54	NC_011126	CCT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952382
55	NC_011126	AAAG	2	8	2330	2337	75 %	0 %	25 %	0 %	195952382
56	NC_011126	AGTA	2	8	2372	2379	50 %	25 %	25 %	0 %	195952382
57	NC_011126	ATC	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952382
58	NC_011126	TAT	2	6	2439	2444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952383
59	NC_011126	ATACC	2	10	2477	2486	40 %	20 %	0 %	40 %	195952383
60	NC_011126	CAT	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952383
61	NC_011126	TAC	2	6	2529	2534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952383
62	NC_011126	T	7	7	2540	2546	0 %	100 %	0 %	0 %	195952383
63	NC_011126	T	6	6	2600	2605	0 %	100 %	0 %	0 %	195952383
64	NC_011126	CTT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952383
65	NC_011126	TCT	2	6	2704	2709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952383
66	NC_011126	TTA	2	6	2714	2719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952383
67	NC_011126	TTC	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952383
68	NC_011126	TA	3	6	2759	2764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011126	T	6	6	2766	2771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011126	GTT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011126	TAAAAT	2	12	2798	2809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011126	GGTG	2	8	2854	2861	0 %	25 %	75 %	0 %	195952384
73	NC_011126	TCA	2	6	2970	2975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952384
74	NC_011126	CA	3	6	2974	2979	50 %	0 %	0 %	50 %	195952384
75	NC_011126	GT	3	6	3000	3005	0 %	50 %	50 %	0 %	195952384
76	NC_011126	AT	4	8	3018	3025	50 %	50 %	0 %	0 %	195952384
77	NC_011126	AT	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	195952384
78	NC_011126	T	6	6	3074	3079	0 %	100 %	0 %	0 %	195952384
79	NC_011126	ATA	2	6	3197	3202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952384
80	NC_011126	TGG	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952384
81	NC_011126	TGA	2	6	3265	3270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952384
82	NC_011126	ACA	2	6	3294	3299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952384
83	NC_011126	T	6	6	3400	3405	0 %	100 %	0 %	0 %	195952384
84	NC_011126	ACT	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952384
85	NC_011126	CAAA	2	8	3470	3477	75 %	0 %	0 %	25 %	195952384
86	NC_011126	A	7	7	3624	3630	100 %	0 %	0 %	0 %	195952384
87	NC_011126	ATGT	2	8	3635	3642	25 %	50 %	25 %	0 %	195952384
88	NC_011126	CTC	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952384
89	NC_011126	GCA	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952384
90	NC_011126	CAAAA	2	10	3708	3717	80 %	0 %	0 %	20 %	195952384
91	NC_011126	TTGAT	2	10	3723	3732	20 %	60 %	20 %	0 %	195952384
92	NC_011126	ATT	3	9	3795	3803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952384
93	NC_011126	AT	3	6	3873	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	195952384
94	NC_011126	GAT	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952384
95	NC_011126	TGG	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952384
96	NC_011126	A	6	6	4124	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	195952384
97	NC_011126	AGA	2	6	4138	4143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952384
98	NC_011126	GAA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952384
99	NC_011126	TA	3	6	4214	4219	50 %	50 %	0 %	0 %	195952384
100	NC_011126	TGA	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952384
101	NC_011126	TA	4	8	4298	4305	50 %	50 %	0 %	0 %	195952385
102	NC_011126	TGC	2	6	4410	4415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952385
103	NC_011126	ATT	2	6	4537	4542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952385
104	NC_011126	ACA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952385
105	NC_011126	ACA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952385
106	NC_011126	AGA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952385
107	NC_011126	ATA	2	6	4726	4731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952385
108	NC_011126	CTA	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952385
109	NC_011126	TCT	2	6	4774	4779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952385
110	NC_011126	AAGA	2	8	4812	4819	75 %	0 %	25 %	0 %	195952385
111	NC_011126	TG	3	6	4839	4844	0 %	50 %	50 %	0 %	195952385
112	NC_011126	GAA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952385
113	NC_011126	GTG	2	6	4922	4927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952385
114	NC_011126	GAT	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952385
115	NC_011126	CAT	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952385
116	NC_011126	A	6	6	5155	5160	100 %	0 %	0 %	0 %	195952385
117	NC_011126	A	6	6	5349	5354	100 %	0 %	0 %	0 %	195952385
118	NC_011126	ATG	2	6	5378	5383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952385
119	NC_011126	CTA	3	9	5387	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952385
120	NC_011126	AT	3	6	5516	5521	50 %	50 %	0 %	0 %	195952386
121	NC_011126	AAG	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
122	NC_011126	GA	3	6	5711	5716	50 %	0 %	50 %	0 %	195952386
123	NC_011126	A	7	7	5727	5733	100 %	0 %	0 %	0 %	195952386
124	NC_011126	T	6	6	5782	5787	0 %	100 %	0 %	0 %	195952386
125	NC_011126	AGAA	2	8	5821	5828	75 %	0 %	25 %	0 %	195952386
126	NC_011126	AGA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
127	NC_011126	GTT	2	6	5856	5861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952386
128	NC_011126	TA	3	6	5864	5869	50 %	50 %	0 %	0 %	195952386
129	NC_011126	CTT	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952386
130	NC_011126	ATG	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952386
131	NC_011126	TGT	2	6	5938	5943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952386
132	NC_011126	AGA	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
133	NC_011126	CTT	2	6	5970	5975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952386
134	NC_011126	A	6	6	6011	6016	100 %	0 %	0 %	0 %	195952386
135	NC_011126	GAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
136	NC_011126	GGT	3	9	6073	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952386
137	NC_011126	AGA	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
138	NC_011126	AT	3	6	6099	6104	50 %	50 %	0 %	0 %	195952386
139	NC_011126	AT	3	6	6218	6223	50 %	50 %	0 %	0 %	195952387
140	NC_011126	T	6	6	6258	6263	0 %	100 %	0 %	0 %	195952387
141	NC_011126	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952387
142	NC_011126	T	8	8	6371	6378	0 %	100 %	0 %	0 %	195952387
143	NC_011126	TAAT	2	8	6388	6395	50 %	50 %	0 %	0 %	195952387
144	NC_011126	ATC	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952387
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146	NC_011126	CTT	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952387
147	NC_011126	GCT	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952387
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150	NC_011126	TTA	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952387
151	NC_011126	CTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952387
152	NC_011126	TA	3	6	6784	6789	50 %	50 %	0 %	0 %	195952387
153	NC_011126	TCT	2	6	6802	6807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952387
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155	NC_011126	TA	3	6	7008	7013	50 %	50 %	0 %	0 %	195952387
156	NC_011126	CTA	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952387
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162	NC_011126	AG	3	6	7176	7181	50 %	0 %	50 %	0 %	195952387
163	NC_011126	GGT	2	6	7188	7193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952387
164	NC_011126	GGTG	2	8	7221	7228	0 %	25 %	75 %	0 %	195952387
165	NC_011126	CCA	2	6	7413	7418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952387
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169	NC_011126	AT	3	6	7603	7608	50 %	50 %	0 %	0 %	195952388
170	NC_011126	TAG	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952388
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172	NC_011126	AAG	2	6	7828	7833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952388
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174	NC_011126	CTT	2	6	8148	8153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952388
175	NC_011126	T	6	6	8162	8167	0 %	100 %	0 %	0 %	195952388
176	NC_011126	GTTTA	2	10	8203	8212	20 %	60 %	20 %	0 %	195952388
177	NC_011126	AAGC	2	8	8250	8257	50 %	0 %	25 %	25 %	195952388
178	NC_011126	AT	3	6	8567	8572	50 %	50 %	0 %	0 %	195952388
179	NC_011126	GGT	2	6	8582	8587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952388
180	NC_011126	TTTTTG	2	12	8661	8672	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	195952388
181	NC_011126	CCT	2	6	8685	8690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_011126	AAG	2	6	8775	8780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952389
183	NC_011126	TTCT	2	8	8883	8890	0 %	75 %	0 %	25 %	195952389
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198	NC_011126	T	7	7	9450	9456	0 %	100 %	0 %	0 %	195952389
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227	NC_011126	TAT	2	6	10669	10674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
228	NC_011126	ATTCA	2	10	10675	10684	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
229	NC_011126	TAT	2	6	10688	10693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_011126	ACC	2	6	10826	10831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
231	NC_011126	TAT	2	6	10846	10851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_011126	AAT	2	6	10852	10857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_011126	T	7	7	10914	10920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_011126	GTA	2	6	10931	10936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
235	NC_011126	ATGA	2	8	11051	11058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
236	NC_011126	TAT	2	6	11111	11116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952391
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244	NC_011126	TTTG	2	8	11630	11637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
245	NC_011126	T	6	6	11686	11691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_011126	ATT	2	6	11697	11702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_011126	AT	3	6	11729	11734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_011126	GTTT	2	8	11767	11774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
249	NC_011126	A	6	6	11792	11797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_011126	T	6	6	11843	11848	0 %	100 %	0 %	0 %	195952392
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254	NC_011126	GAC	2	6	11975	11980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952392
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257	NC_011126	A	6	6	12266	12271	100 %	0 %	0 %	0 %	195952392
258	NC_011126	ATC	2	6	12306	12311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952392
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264	NC_011126	A	6	6	12489	12494	100 %	0 %	0 %	0 %	195952392
265	NC_011126	AT	3	6	12586	12591	50 %	50 %	0 %	0 %	195952393
266	NC_011126	ATC	2	6	12606	12611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952393
267	NC_011126	A	7	7	12690	12696	100 %	0 %	0 %	0 %	195952393
268	NC_011126	ACC	2	6	12714	12719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952393
269	NC_011126	ATA	2	6	12720	12725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952393
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271	NC_011126	TAG	2	6	12781	12786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952393
272	NC_011126	T	6	6	12899	12904	0 %	100 %	0 %	0 %	195952393
273	NC_011126	GGTT	2	8	12910	12917	0 %	50 %	50 %	0 %	195952393
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275	NC_011126	GTAT	2	8	13049	13056	25 %	50 %	25 %	0 %	195952393
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407	NC_011126	CAC	2	6	19118	19123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952399
408	NC_011126	T	7	7	19173	19179	0 %	100 %	0 %	0 %	195952399
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439	NC_011126	TTC	2	6	20706	20711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952400
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450	NC_011126	TA	3	6	21027	21032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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