MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 34890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011126	CAA	2	6	46148	46153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952432
1002	NC_011126	TAT	2	6	46188	46193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952432
1003	NC_011126	TAT	2	6	46218	46223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952432
1004	NC_011126	AAG	2	6	46248	46253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952432
1005	NC_011126	TA	3	6	46366	46371	50 %	50 %	0 %	0 %	195952432
1006	NC_011126	ACAA	2	8	46378	46385	75 %	0 %	0 %	25 %	195952432
1007	NC_011126	ATA	2	6	46443	46448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952432
1008	NC_011126	CTT	3	9	46500	46508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952433
1009	NC_011126	TG	3	6	46511	46516	0 %	50 %	50 %	0 %	195952433
1010	NC_011126	CTT	2	6	46565	46570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952433
1011	NC_011126	TTG	2	6	46636	46641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952433
1012	NC_011126	TGG	2	6	46674	46679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952433
1013	NC_011126	TAC	2	6	46681	46686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952433
1014	NC_011126	CTC	2	6	46740	46745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952433
1015	NC_011126	GCTTG	2	10	46775	46784	0 %	40 %	40 %	20 %	195952433
1016	NC_011126	TGT	2	6	46842	46847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952433
1017	NC_011126	T	6	6	46855	46860	0 %	100 %	0 %	0 %	195952433
1018	NC_011126	AAT	2	6	46866	46871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952433
1019	NC_011126	TGC	2	6	46909	46914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952433
1020	NC_011126	TTC	2	6	46917	46922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952433
1021	NC_011126	GTA	2	6	46928	46933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952433
1022	NC_011126	GAG	2	6	46947	46952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952433
1023	NC_011126	ACC	2	6	46991	46996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952433
1024	NC_011126	CATC	2	8	47001	47008	25 %	25 %	0 %	50 %	195952433
1025	NC_011126	CTG	2	6	47079	47084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952433
1026	NC_011126	CTT	2	6	47163	47168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952433
1027	NC_011126	TAA	2	6	47180	47185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952433
1028	NC_011126	GTT	3	9	47221	47229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952433
1029	NC_011126	TTTG	2	8	47290	47297	0 %	75 %	25 %	0 %	195952433
1030	NC_011126	ATA	2	6	47305	47310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952433
1031	NC_011126	ACA	2	6	47345	47350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952433
1032	NC_011126	T	6	6	47390	47395	0 %	100 %	0 %	0 %	195952433
1033	NC_011126	CTTT	2	8	47441	47448	0 %	75 %	0 %	25 %	195952433
1034	NC_011126	ACC	2	6	47455	47460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952433
1035	NC_011126	AT	3	6	47485	47490	50 %	50 %	0 %	0 %	195952433
1036	NC_011126	TCT	2	6	47558	47563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952433
1037	NC_011126	ACC	2	6	47564	47569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952433
1038	NC_011126	ACC	2	6	47629	47634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952433
1039	NC_011126	ACC	2	6	47662	47667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952433
1040	NC_011126	CT	3	6	47692	47697	0 %	50 %	0 %	50 %	195952433
1041	NC_011126	GGA	2	6	47750	47755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952433
1042	NC_011126	GGT	2	6	47772	47777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952433
1043	NC_011126	CCA	2	6	47779	47784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952433
1044	NC_011126	GGC	2	6	47788	47793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195952433
1045	NC_011126	T	6	6	47825	47830	0 %	100 %	0 %	0 %	195952433
1046	NC_011126	ATCTT	2	10	47831	47840	20 %	60 %	0 %	20 %	195952433
1047	NC_011126	ACC	2	6	47896	47901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952433
1048	NC_011126	ACC	2	6	47929	47934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952433
1049	NC_011126	GAT	2	6	48027	48032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952433
1050	NC_011126	TCT	2	6	48125	48130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952433
1051	NC_011126	GTG	2	6	48161	48166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952433
1052	NC_011126	T	6	6	48218	48223	0 %	100 %	0 %	0 %	195952433
1053	NC_011126	CTG	2	6	48255	48260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952433
1054	NC_011126	AAC	2	6	48346	48351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952433
1055	NC_011126	AT	3	6	48362	48367	50 %	50 %	0 %	0 %	195952433
1056	NC_011126	CCT	2	6	48372	48377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952434
1057	NC_011126	CT	3	6	48499	48504	0 %	50 %	0 %	50 %	195952434
1058	NC_011126	TCCG	2	8	48532	48539	0 %	25 %	25 %	50 %	195952434
1059	NC_011126	GGT	2	6	48622	48627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952434
1060	NC_011126	T	6	6	48664	48669	0 %	100 %	0 %	0 %	195952434
1061	NC_011126	TCG	2	6	48677	48682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952434
1062	NC_011126	CATA	2	8	48696	48703	50 %	25 %	0 %	25 %	195952434
1063	NC_011126	TCT	2	6	48721	48726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952434
1064	NC_011126	ATG	2	6	48818	48823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952434
1065	NC_011126	TGG	2	6	48847	48852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952434
1066	NC_011126	TTA	2	6	48885	48890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952434
1067	NC_011126	TTGGC	2	10	48921	48930	0 %	40 %	40 %	20 %	195952434
1068	NC_011126	CA	3	6	48937	48942	50 %	0 %	0 %	50 %	195952434
1069	NC_011126	CTG	2	6	48990	48995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952434
1070	NC_011126	T	6	6	48997	49002	0 %	100 %	0 %	0 %	195952434
1071	NC_011126	CGT	2	6	49047	49052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952434
1072	NC_011126	T	6	6	49102	49107	0 %	100 %	0 %	0 %	195952434
1073	NC_011126	TCT	2	6	49115	49120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952434
1074	NC_011126	ATC	2	6	49162	49167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952434
1075	NC_011126	AAG	2	6	49189	49194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952434
1076	NC_011126	CTTGG	2	10	49283	49292	0 %	40 %	40 %	20 %	195952434
1077	NC_011126	CTA	2	6	49305	49310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952434
1078	NC_011126	GGT	2	6	49328	49333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952434
1079	NC_011126	TGA	2	6	49350	49355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952434
1080	NC_011126	CTCC	2	8	49375	49382	0 %	25 %	0 %	75 %	195952434
1081	NC_011126	CCT	2	6	49443	49448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_011126	AATA	2	8	49453	49460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011126	ATTA	2	8	49464	49471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011126	ATT	2	6	49553	49558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011126	TAT	2	6	49606	49611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011126	CTG	2	6	49633	49638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011126	A	9	9	49649	49657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011126	TA	3	6	49681	49686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011126	AT	3	6	49707	49712	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1090	NC_011126	T	7	7	49753	49759	0 %	100 %	0 %	0 %	195952435
1091	NC_011126	GTT	2	6	49763	49768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952435
1092	NC_011126	TAA	2	6	49894	49899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952435
1093	NC_011126	GGTG	2	8	49909	49916	0 %	25 %	75 %	0 %	195952435
1094	NC_011126	CTTT	2	8	49979	49986	0 %	75 %	0 %	25 %	195952435
1095	NC_011126	A	6	6	49994	49999	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1096	NC_011126	A	6	6	50006	50011	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1097	NC_011126	TATG	2	8	50047	50054	25 %	50 %	25 %	0 %	195952435
1098	NC_011126	TTA	2	6	50142	50147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952435
1099	NC_011126	TA	3	6	50159	50164	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1100	NC_011126	T	6	6	50219	50224	0 %	100 %	0 %	0 %	195952435
1101	NC_011126	ATT	2	6	50240	50245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952435
1102	NC_011126	AT	3	6	50289	50294	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1103	NC_011126	CAA	2	6	50384	50389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952435
1104	NC_011126	AT	3	6	50395	50400	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1105	NC_011126	AGC	2	6	50435	50440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952435
1106	NC_011126	TCTG	2	8	50518	50525	0 %	50 %	25 %	25 %	195952435
1107	NC_011126	AT	3	6	50542	50547	50 %	50 %	0 %	0 %	195952435
1108	NC_011126	A	6	6	50574	50579	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1109	NC_011126	AG	3	6	50593	50598	50 %	0 %	50 %	0 %	195952435
1110	NC_011126	CT	3	6	50629	50634	0 %	50 %	0 %	50 %	195952435
1111	NC_011126	TAT	2	6	50769	50774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952435
1112	NC_011126	AAC	2	6	50813	50818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952435
1113	NC_011126	CTA	2	6	50970	50975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952435
1114	NC_011126	GA	3	6	50978	50983	50 %	0 %	50 %	0 %	195952435
1115	NC_011126	ATG	2	6	51051	51056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952435
1116	NC_011126	CAA	2	6	51058	51063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952435
1117	NC_011126	GAA	2	6	51134	51139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
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1119	NC_011126	A	6	6	51268	51273	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1120	NC_011126	AAAC	2	8	51280	51287	75 %	0 %	0 %	25 %	195952435
1121	NC_011126	ATG	2	6	51347	51352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952435
1122	NC_011126	A	6	6	51364	51369	100 %	0 %	0 %	0 %	195952435
1123	NC_011126	AACAG	2	10	51403	51412	60 %	0 %	20 %	20 %	195952435
1124	NC_011126	GAA	2	6	51499	51504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
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1126	NC_011126	ATT	2	6	51609	51614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952435
1127	NC_011126	AAG	2	6	51648	51653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
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1129	NC_011126	AGA	2	6	51679	51684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952435
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1255	NC_011126	TCT	2	6	57194	57199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952440
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1258	NC_011126	ACT	2	6	57263	57268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952440
1259	NC_011126	ATC	2	6	57316	57321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952440
1260	NC_011126	CTT	2	6	57405	57410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952440
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1335	NC_011126	TAA	2	6	60633	60638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1343	NC_011126	TAGA	2	8	60810	60817	50 %	25 %	25 %	0 %	195952444
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1349	NC_011126	GATT	2	8	60988	60995	25 %	50 %	25 %	0 %	195952444
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1377	NC_011126	TAT	2	6	62841	62846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952446
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1383	NC_011126	CCA	3	9	63289	63297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952447
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1385	NC_011126	A	6	6	63313	63318	100 %	0 %	0 %	0 %	195952447
1386	NC_011126	A	6	6	63321	63326	100 %	0 %	0 %	0 %	195952447
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