MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 47934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010519	TCA	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010519	AAG	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010519	T	7	7	140	146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010519	T	7	7	174	180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010519	TAA	2	6	188	193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010519	TTG	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170717207
7	NC_010519	AAT	2	6	498	503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170717207
8	NC_010519	ACA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717207
9	NC_010519	CAA	2	6	612	617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717207
10	NC_010519	TTG	2	6	661	666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170717207
11	NC_010519	CCAA	2	8	676	683	50 %	0 %	0 %	50 %	170717207
12	NC_010519	TGG	2	6	755	760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170717207
13	NC_010519	AAT	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170717207
14	NC_010519	GTT	2	6	834	839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170717207
15	NC_010519	ATGC	2	8	843	850	25 %	25 %	25 %	25 %	170717207
16	NC_010519	TGAT	2	8	940	947	25 %	50 %	25 %	0 %	170717207
17	NC_010519	T	6	6	957	962	0 %	100 %	0 %	0 %	170717207
18	NC_010519	AAG	2	6	982	987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
19	NC_010519	AT	3	6	997	1002	50 %	50 %	0 %	0 %	170717207
20	NC_010519	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170717207
21	NC_010519	GAA	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
22	NC_010519	GAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
23	NC_010519	A	7	7	1177	1183	100 %	0 %	0 %	0 %	170717207
24	NC_010519	A	6	6	1381	1386	100 %	0 %	0 %	0 %	170717207
25	NC_010519	ATT	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170717207
26	NC_010519	GAA	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
27	NC_010519	AAG	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
28	NC_010519	ACA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718298
29	NC_010519	AGT	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718298
30	NC_010519	TAT	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718298
31	NC_010519	A	7	7	1873	1879	100 %	0 %	0 %	0 %	170718298
32	NC_010519	GAA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718298
33	NC_010519	ATTTA	2	10	1972	1981	40 %	60 %	0 %	0 %	170718298
34	NC_010519	TAC	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718298
35	NC_010519	GCT	2	6	2294	2299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718298
36	NC_010519	AAT	2	6	2318	2323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718298
37	NC_010519	TAT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718298
38	NC_010519	AATT	2	8	2361	2368	50 %	50 %	0 %	0 %	170718298
39	NC_010519	CTG	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718298
40	NC_010519	CAA	2	6	2538	2543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718298
41	NC_010519	AAG	2	6	2553	2558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718298
42	NC_010519	AT	3	6	2582	2587	50 %	50 %	0 %	0 %	170718298
43	NC_010519	TCA	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718298
44	NC_010519	GTT	2	6	2694	2699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718298
45	NC_010519	TGA	3	9	2713	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718298
46	NC_010519	ATC	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718431
47	NC_010519	TAT	2	6	2842	2847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718431
48	NC_010519	CAA	2	6	2851	2856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
49	NC_010519	T	6	6	2889	2894	0 %	100 %	0 %	0 %	170718431
50	NC_010519	AAT	2	6	2938	2943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718431
51	NC_010519	CAA	2	6	2990	2995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
52	NC_010519	AAC	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
53	NC_010519	A	8	8	3067	3074	100 %	0 %	0 %	0 %	170718431
54	NC_010519	TTA	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718431
55	NC_010519	TCA	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718431
56	NC_010519	CAT	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718431
57	NC_010519	AAC	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
58	NC_010519	ACA	2	6	3256	3261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
59	NC_010519	A	6	6	3372	3377	100 %	0 %	0 %	0 %	170718431
60	NC_010519	TCA	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718431
61	NC_010519	ACA	2	6	3463	3468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
62	NC_010519	TG	3	6	3594	3599	0 %	50 %	50 %	0 %	170718431
63	NC_010519	CAA	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
64	NC_010519	A	8	8	3636	3643	100 %	0 %	0 %	0 %	170718431
65	NC_010519	TTGC	2	8	3704	3711	0 %	50 %	25 %	25 %	170718431
66	NC_010519	A	7	7	3723	3729	100 %	0 %	0 %	0 %	170718431
67	NC_010519	ACA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
68	NC_010519	GAA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718431
69	NC_010519	A	6	6	3846	3851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010519	ACA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718540
71	NC_010519	TCT	2	6	3950	3955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718540
72	NC_010519	TAATTT	2	12	4023	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718540
73	NC_010519	AATT	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	170718540
74	NC_010519	T	6	6	4222	4227	0 %	100 %	0 %	0 %	170718540
75	NC_010519	TCA	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718540
76	NC_010519	A	7	7	4315	4321	100 %	0 %	0 %	0 %	170718540
77	NC_010519	ATA	2	6	4402	4407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718540
78	NC_010519	ATGA	2	8	4432	4439	50 %	25 %	25 %	0 %	170718540
79	NC_010519	TTG	2	6	4525	4530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718540
80	NC_010519	A	6	6	4565	4570	100 %	0 %	0 %	0 %	170718646
81	NC_010519	ATTTT	2	10	4574	4583	20 %	80 %	0 %	0 %	170718646
82	NC_010519	TAAA	2	8	4647	4654	75 %	25 %	0 %	0 %	170718646
83	NC_010519	T	6	6	4662	4667	0 %	100 %	0 %	0 %	170718646
84	NC_010519	TAC	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718646
85	NC_010519	TAA	2	6	4735	4740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718646
86	NC_010519	TAT	2	6	4809	4814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718753
87	NC_010519	CAG	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718753
88	NC_010519	TTG	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718753
89	NC_010519	AAT	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718753
90	NC_010519	T	6	6	4939	4944	0 %	100 %	0 %	0 %	170718753
91	NC_010519	TC	3	6	4968	4973	0 %	50 %	0 %	50 %	170718753
92	NC_010519	A	6	6	5021	5026	100 %	0 %	0 %	0 %	170718753
93	NC_010519	T	6	6	5103	5108	0 %	100 %	0 %	0 %	170718753
94	NC_010519	TC	3	6	5139	5144	0 %	50 %	0 %	50 %	170718753
95	NC_010519	TAAA	2	8	5194	5201	75 %	25 %	0 %	0 %	170718753
96	NC_010519	TAT	2	6	5212	5217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718753
97	NC_010519	AAT	2	6	5220	5225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718753
98	NC_010519	GTC	2	6	5307	5312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718753
99	NC_010519	GAC	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718753
100	NC_010519	T	6	6	5401	5406	0 %	100 %	0 %	0 %	170718753
101	NC_010519	T	6	6	5410	5415	0 %	100 %	0 %	0 %	170718753
102	NC_010519	CAA	2	6	5425	5430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718753
103	NC_010519	TGT	2	6	5460	5465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718753
104	NC_010519	ATT	2	6	5469	5474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718753
105	NC_010519	T	6	6	5473	5478	0 %	100 %	0 %	0 %	170718862
106	NC_010519	ACC	2	6	5494	5499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718862
107	NC_010519	TTC	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718862
108	NC_010519	TAC	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718862
109	NC_010519	CTG	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718862
110	NC_010519	CTGG	2	8	5793	5800	0 %	25 %	50 %	25 %	170718862
111	NC_010519	CAAC	2	8	5817	5824	50 %	0 %	0 %	50 %	170718862
112	NC_010519	AATCC	2	10	5832	5841	40 %	20 %	0 %	40 %	170718862
113	NC_010519	TTC	2	6	5931	5936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718971
114	NC_010519	AAT	2	6	5958	5963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718971
115	NC_010519	CT	3	6	6013	6018	0 %	50 %	0 %	50 %	170718971
116	NC_010519	CAT	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718971
117	NC_010519	ACA	2	6	6172	6177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718971
118	NC_010519	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718971
119	NC_010519	T	6	6	6275	6280	0 %	100 %	0 %	0 %	170718971
120	NC_010519	TTG	2	6	6548	6553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718971
121	NC_010519	CAC	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718971
122	NC_010519	CAC	2	6	6680	6685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718971
123	NC_010519	CAC	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718971
124	NC_010519	TTG	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718971
125	NC_010519	TTG	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718971
126	NC_010519	ATA	2	6	6821	6826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718971
127	NC_010519	ACCG	2	8	6840	6847	25 %	0 %	25 %	50 %	170718971
128	NC_010519	ACT	2	6	7030	7035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718971
129	NC_010519	AATT	2	8	7068	7075	50 %	50 %	0 %	0 %	170718971
130	NC_010519	GCA	2	6	7090	7095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718971
131	NC_010519	CCG	2	6	7099	7104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170718971
132	NC_010519	A	6	6	7239	7244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010519	CAA	2	6	7262	7267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010519	T	6	6	7293	7298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010519	ACA	2	6	7326	7331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719078
136	NC_010519	GA	3	6	7350	7355	50 %	0 %	50 %	0 %	170719078
137	NC_010519	ACT	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719078
138	NC_010519	TCA	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719078
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274	NC_010519	GTG	2	6	13801	13806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170717973
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277	NC_010519	TGA	2	6	14114	14119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170717973
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404	NC_010519	T	6	6	19369	19374	0 %	100 %	0 %	0 %	170718354
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