MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 4532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010369	GC	3	6	173293	173298	0 %	0 %	50 %	50 %	169237789
4002	NC_010369	GGC	2	6	173315	173320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237789
4003	NC_010369	TGC	2	6	173340	173345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4004	NC_010369	GCT	2	6	173449	173454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4005	NC_010369	CGA	2	6	173459	173464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4006	NC_010369	GC	3	6	173467	173472	0 %	0 %	50 %	50 %	169237789
4007	NC_010369	GTCGT	2	10	173475	173484	0 %	40 %	40 %	20 %	169237789
4008	NC_010369	TGC	3	9	173493	173501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4009	NC_010369	GCC	3	9	173504	173512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237789
4010	NC_010369	GTC	2	6	173522	173527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4011	NC_010369	GACA	2	8	173549	173556	50 %	0 %	25 %	25 %	169237789
4012	NC_010369	TCG	3	9	173704	173712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4013	NC_010369	CGGT	2	8	173826	173833	0 %	25 %	50 %	25 %	169237789
4014	NC_010369	GGTC	2	8	173878	173885	0 %	25 %	50 %	25 %	169237789
4015	NC_010369	GTGTCG	2	12	173976	173987	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	169237789
4016	NC_010369	GCG	2	6	173988	173993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237789
4017	NC_010369	GACG	2	8	174050	174057	25 %	0 %	50 %	25 %	169237789
4018	NC_010369	GACGT	2	10	174093	174102	20 %	20 %	40 %	20 %	169237789
4019	NC_010369	TCG	2	6	174177	174182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4020	NC_010369	TCACC	2	10	174355	174364	20 %	20 %	0 %	60 %	169237789
4021	NC_010369	AG	3	6	174407	174412	50 %	0 %	50 %	0 %	169237789
4022	NC_010369	CCG	2	6	174414	174419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237789
4023	NC_010369	CCT	2	6	174478	174483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237789
4024	NC_010369	CGA	2	6	174514	174519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4025	NC_010369	CCG	2	6	174543	174548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237789
4026	NC_010369	CGG	2	6	174563	174568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237789
4027	NC_010369	CGAG	2	8	174610	174617	25 %	0 %	50 %	25 %	169237789
4028	NC_010369	CGTCG	2	10	174626	174635	0 %	20 %	40 %	40 %	169237789
4029	NC_010369	CTT	2	6	174649	174654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237789
4030	NC_010369	CCG	2	6	174667	174672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237789
4031	NC_010369	CGT	2	6	174799	174804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4032	NC_010369	GTC	2	6	174825	174830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4033	NC_010369	CGC	2	6	174859	174864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237789
4034	NC_010369	C	7	7	174868	174874	0 %	0 %	0 %	100 %	169237789
4035	NC_010369	CCA	2	6	174939	174944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237789
4036	NC_010369	ACGGTC	2	12	174957	174968	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4037	NC_010369	CT	3	6	174981	174986	0 %	50 %	0 %	50 %	169237789
4038	NC_010369	GTCGCA	2	12	174999	175010	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4039	NC_010369	CGC	2	6	175072	175077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237789
4040	NC_010369	TGGA	2	8	175125	175132	25 %	25 %	50 %	0 %	169237789
4041	NC_010369	CGT	2	6	175135	175140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4042	NC_010369	CGT	2	6	175190	175195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4043	NC_010369	AGC	3	9	175244	175252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4044	NC_010369	CGA	3	9	175279	175287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4045	NC_010369	CCT	2	6	175328	175333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237790
4046	NC_010369	CGC	2	6	175356	175361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237790
4047	NC_010369	GCC	2	6	175391	175396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237790
4048	NC_010369	GCG	2	6	175408	175413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237790
4049	NC_010369	ATC	2	6	175420	175425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237790
4050	NC_010369	GAGG	2	8	175446	175453	25 %	0 %	75 %	0 %	169237790
4051	NC_010369	CTC	2	6	175518	175523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237790
4052	NC_010369	CGT	2	6	175568	175573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237790
4053	NC_010369	GC	3	6	175583	175588	0 %	0 %	50 %	50 %	169237790
4054	NC_010369	GCC	2	6	175651	175656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237790
4055	NC_010369	AGCC	2	8	175673	175680	25 %	0 %	25 %	50 %	169237790
4056	NC_010369	GTT	2	6	175713	175718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237790
4057	NC_010369	CCGC	2	8	175727	175734	0 %	0 %	25 %	75 %	169237790
4058	NC_010369	TCG	2	6	175738	175743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237790
4059	NC_010369	CAG	2	6	175812	175817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237790
4060	NC_010369	TTC	2	6	175824	175829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237790
4061	NC_010369	GAC	2	6	175837	175842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237790
4062	NC_010369	GGC	2	6	175851	175856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237790
4063	NC_010369	CGA	2	6	175901	175906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237790
4064	NC_010369	CGC	2	6	175928	175933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237790
4065	NC_010369	CGA	2	6	176001	176006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237790
4066	NC_010369	GTCG	2	8	176066	176073	0 %	25 %	50 %	25 %	169237790
4067	NC_010369	CTC	2	6	176193	176198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237790
4068	NC_010369	GTC	2	6	176242	176247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237790
4069	NC_010369	GCT	2	6	176284	176289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237790
4070	NC_010369	TCC	2	6	176319	176324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237791
4071	NC_010369	CCA	2	6	176332	176337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237791
4072	NC_010369	TCGAT	2	10	176356	176365	20 %	40 %	20 %	20 %	169237791
4073	NC_010369	GAA	2	6	176390	176395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237791
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4075	NC_010369	CCG	2	6	176410	176415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237791
4076	NC_010369	GA	3	6	176416	176421	50 %	0 %	50 %	0 %	169237791
4077	NC_010369	ATC	2	6	176541	176546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237791
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4080	NC_010369	GCAC	2	8	176645	176652	25 %	0 %	25 %	50 %	169237791
4081	NC_010369	CGT	2	6	176707	176712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
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4085	NC_010369	TCG	2	6	176793	176798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
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4087	NC_010369	AGT	2	6	176833	176838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237791
4088	NC_010369	GTC	2	6	176894	176899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
4089	NC_010369	GTC	2	6	176915	176920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
4090	NC_010369	CGTCG	2	10	176939	176948	0 %	20 %	40 %	40 %	169237791
4091	NC_010369	TTG	2	6	176963	176968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237791
4092	NC_010369	ACG	2	6	176986	176991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237791
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4094	NC_010369	ACCG	2	8	177047	177054	25 %	0 %	25 %	50 %	169237791
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4097	NC_010369	TCG	3	9	177129	177137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
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4099	NC_010369	GC	3	6	177182	177187	0 %	0 %	50 %	50 %	169237791
4100	NC_010369	CG	4	8	177193	177200	0 %	0 %	50 %	50 %	169237791
4101	NC_010369	CCA	2	6	177201	177206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237791
4102	NC_010369	CAGTC	2	10	177236	177245	20 %	20 %	20 %	40 %	169237791
4103	NC_010369	GTC	3	9	177243	177251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
4104	NC_010369	TCA	2	6	177294	177299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237791
4105	NC_010369	CGC	2	6	177320	177325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237791
4106	NC_010369	CGT	2	6	177331	177336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
4107	NC_010369	TCG	2	6	177351	177356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
4108	NC_010369	CGC	2	6	177416	177421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237791
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4110	NC_010369	AC	3	6	177484	177489	50 %	0 %	0 %	50 %	169237791
4111	NC_010369	CTG	2	6	177497	177502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
4112	NC_010369	GTC	2	6	177534	177539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
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4114	NC_010369	GACG	2	8	177670	177677	25 %	0 %	50 %	25 %	169237791
4115	NC_010369	CCCGCC	2	12	177698	177709	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	169237791
4116	NC_010369	TCG	2	6	177717	177722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237791
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4119	NC_010369	AAC	2	6	177939	177944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237791
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4121	NC_010369	GTT	2	6	177998	178003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237791
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4238	NC_010369	CGA	2	6	182439	182444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237794
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4240	NC_010369	CCCA	2	8	182539	182546	25 %	0 %	0 %	75 %	169237794
4241	NC_010369	CCG	2	6	182549	182554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237794
4242	NC_010369	AACG	2	8	182569	182576	50 %	0 %	25 %	25 %	169237794
4243	NC_010369	CGC	2	6	182707	182712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237794
4244	NC_010369	CGC	2	6	182724	182729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237794
4245	NC_010369	ACGA	2	8	182743	182750	50 %	0 %	25 %	25 %	169237794
4246	NC_010369	GTG	2	6	182786	182791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237794
4247	NC_010369	GCC	2	6	182804	182809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237794
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4249	NC_010369	CGTT	2	8	182859	182866	0 %	50 %	25 %	25 %	169237794
4250	NC_010369	CG	3	6	182935	182940	0 %	0 %	50 %	50 %	169237794
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4253	NC_010369	ACG	2	6	183011	183016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237794
4254	NC_010369	GCT	2	6	183091	183096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237794
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4257	NC_010369	CGA	2	6	183231	183236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237794
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4259	NC_010369	CTG	2	6	183289	183294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237794
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4265	NC_010369	CGC	2	6	183438	183443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4266	NC_010369	CCG	2	6	183487	183492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4267	NC_010369	GCG	2	6	183592	183597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4268	NC_010369	GCT	2	6	183607	183612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4269	NC_010369	ACG	3	9	183616	183624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4270	NC_010369	GCG	2	6	183641	183646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4271	NC_010369	TCG	2	6	183686	183691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237795
4272	NC_010369	CGT	2	6	183727	183732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237795
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4278	NC_010369	GACC	2	8	184013	184020	25 %	0 %	25 %	50 %	169237795
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4282	NC_010369	AGCCG	2	10	184215	184224	20 %	0 %	40 %	40 %	169237795
4283	NC_010369	CGA	2	6	184233	184238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237795
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4294	NC_010369	CGT	2	6	184752	184757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4295	NC_010369	CGA	2	6	184758	184763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4297	NC_010369	TTAAT	2	10	184876	184885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4298	NC_010369	TA	3	6	184891	184896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4299	NC_010369	ATC	2	6	185008	185013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237796
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4301	NC_010369	CAG	2	6	185034	185039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237796
4302	NC_010369	TCG	2	6	185054	185059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237796
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4309	NC_010369	CGC	2	6	185434	185439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237796
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4313	NC_010369	GC	3	6	185552	185557	0 %	0 %	50 %	50 %	169237796
4314	NC_010369	GCT	2	6	185640	185645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237796
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4319	NC_010369	TCG	2	6	185837	185842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237796
4320	NC_010369	GAC	2	6	185844	185849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237796
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4349	NC_010369	GACGC	2	10	187177	187186	20 %	0 %	40 %	40 %	169237797
4350	NC_010369	CTG	2	6	187264	187269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237797
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4353	NC_010369	TCA	2	6	187401	187406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237797
4354	NC_010369	CTG	2	6	187435	187440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237797
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4357	NC_010369	CAA	2	6	187561	187566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237797
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4359	NC_010369	CGC	2	6	187590	187595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237797
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4361	NC_010369	ACT	2	6	187648	187653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237797
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4486	NC_010369	TGG	2	6	192732	192737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237800
4487	NC_010369	GCG	2	6	192741	192746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237800
4488	NC_010369	TC	3	6	192772	192777	0 %	50 %	0 %	50 %	169237800
4489	NC_010369	GTCG	2	8	192865	192872	0 %	25 %	50 %	25 %	169237800
4490	NC_010369	GTT	2	6	192902	192907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237800
4491	NC_010369	GCT	2	6	192909	192914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237800
4492	NC_010369	GTT	2	6	192942	192947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237800
4493	NC_010369	TGA	2	6	192971	192976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237800
4494	NC_010369	CTGGG	2	10	193088	193097	0 %	20 %	60 %	20 %	169237800
4495	NC_010369	TCG	2	6	193210	193215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237800
4496	NC_010369	G	6	6	193215	193220	0 %	0 %	100 %	0 %	169237800
4497	NC_010369	CTCG	2	8	193223	193230	0 %	25 %	25 %	50 %	169237800
4498	NC_010369	CGC	2	6	193241	193246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237800
4499	NC_010369	GACCTC	2	12	193328	193339	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169237800
4500	NC_010369	GAGT	2	8	193366	193373	25 %	25 %	50 %	0 %	169237800

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