MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 4532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010369	TAG	2	6	152068	152073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237775
3502	NC_010369	TC	3	6	152144	152149	0 %	50 %	0 %	50 %	169237775
3503	NC_010369	G	6	6	152180	152185	0 %	0 %	100 %	0 %	169237775
3504	NC_010369	ACGG	2	8	152228	152235	25 %	0 %	50 %	25 %	169237775
3505	NC_010369	GCG	2	6	152262	152267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237775
3506	NC_010369	GCG	2	6	152269	152274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237775
3507	NC_010369	CGC	2	6	152374	152379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_010369	GGC	2	6	152397	152402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_010369	CGG	2	6	152459	152464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_010369	GTCG	2	8	152557	152564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_010369	GTA	2	6	152587	152592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_010369	TCC	2	6	152597	152602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_010369	CTC	2	6	152626	152631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_010369	TCG	2	6	152782	152787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_010369	CA	3	6	152788	152793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_010369	TGGCG	2	10	152837	152846	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3517	NC_010369	ACCC	2	8	152921	152928	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3518	NC_010369	GTG	2	6	153066	153071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_010369	GTC	2	6	153083	153088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_010369	GAA	2	6	153116	153121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237776
3521	NC_010369	CTG	2	6	153190	153195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237776
3522	NC_010369	ACG	2	6	153197	153202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237776
3523	NC_010369	CGA	2	6	153291	153296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237776
3524	NC_010369	GAA	2	6	153309	153314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237776
3525	NC_010369	CGT	2	6	153327	153332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237776
3526	NC_010369	ACT	2	6	153359	153364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237776
3527	NC_010369	ACG	2	6	153371	153376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237776
3528	NC_010369	CGG	2	6	153590	153595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237776
3529	NC_010369	ACGG	2	8	153678	153685	25 %	0 %	50 %	25 %	169237776
3530	NC_010369	TCG	2	6	153686	153691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237776
3531	NC_010369	GAA	2	6	153834	153839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237776
3532	NC_010369	GTC	2	6	153905	153910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237776
3533	NC_010369	GTGGA	2	10	153916	153925	20 %	20 %	60 %	0 %	169237776
3534	NC_010369	CAC	2	6	154018	154023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237776
3535	NC_010369	CGT	2	6	154052	154057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237776
3536	NC_010369	CCAG	2	8	154109	154116	25 %	0 %	25 %	50 %	169237776
3537	NC_010369	AC	3	6	154134	154139	50 %	0 %	0 %	50 %	169237776
3538	NC_010369	AAG	2	6	154159	154164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237776
3539	NC_010369	GTG	2	6	154208	154213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237776
3540	NC_010369	GGC	2	6	154237	154242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237776
3541	NC_010369	CGG	2	6	154303	154308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237776
3542	NC_010369	ACC	2	6	154507	154512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_010369	AC	3	6	154534	154539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_010369	CCG	2	6	154566	154571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_010369	GCA	2	6	154706	154711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3546	NC_010369	TCG	2	6	154826	154831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3547	NC_010369	GA	3	6	155022	155027	50 %	0 %	50 %	0 %	169237777
3548	NC_010369	TGC	2	6	155083	155088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3549	NC_010369	CGT	2	6	155111	155116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3550	NC_010369	GGCA	2	8	155126	155133	25 %	0 %	50 %	25 %	169237777
3551	NC_010369	CAG	2	6	155139	155144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3552	NC_010369	GGC	2	6	155178	155183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237777
3553	NC_010369	TCG	2	6	155257	155262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3554	NC_010369	CG	3	6	155289	155294	0 %	0 %	50 %	50 %	169237777
3555	NC_010369	CGT	2	6	155324	155329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3556	NC_010369	CGAG	2	8	155357	155364	25 %	0 %	50 %	25 %	169237777
3557	NC_010369	TCGT	2	8	155404	155411	0 %	50 %	25 %	25 %	169237777
3558	NC_010369	GAT	2	6	155418	155423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237777
3559	NC_010369	TCG	2	6	155437	155442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3560	NC_010369	TC	3	6	155479	155484	0 %	50 %	0 %	50 %	169237777
3561	NC_010369	TCG	2	6	155500	155505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3562	NC_010369	GCC	2	6	155523	155528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237777
3563	NC_010369	TCG	2	6	155542	155547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3564	NC_010369	ATC	2	6	155551	155556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237777
3565	NC_010369	CAG	2	6	155559	155564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3566	NC_010369	TCT	3	9	155567	155575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237777
3567	NC_010369	TCC	2	6	155593	155598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237777
3568	NC_010369	TCA	2	6	155642	155647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237777
3569	NC_010369	GAC	2	6	155685	155690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3570	NC_010369	GCG	2	6	155798	155803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237777
3571	NC_010369	CTCG	2	8	155858	155865	0 %	25 %	25 %	50 %	169237777
3572	NC_010369	GGGA	2	8	155866	155873	25 %	0 %	75 %	0 %	169237777
3573	NC_010369	CGA	2	6	155918	155923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237777
3574	NC_010369	GTG	2	6	155970	155975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_010369	GTC	2	6	155988	155993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_010369	GAT	2	6	156015	156020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_010369	GCG	2	6	156046	156051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_010369	G	6	6	156079	156084	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_010369	GT	3	6	156091	156096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_010369	TTA	2	6	156169	156174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_010369	ACT	2	6	156179	156184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3583	NC_010369	GTGTA	2	10	156217	156226	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_010369	GTTG	2	8	156230	156237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_010369	TCAA	2	8	156352	156359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3588	NC_010369	TCG	2	6	156410	156415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_010369	CTC	2	6	156424	156429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_010369	TGA	2	6	156525	156530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_010369	TCG	2	6	156533	156538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_010369	CGTC	2	8	156543	156550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_010369	CCAGC	2	10	156570	156579	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3594	NC_010369	CGC	2	6	156620	156625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_010369	CTC	2	6	156800	156805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_010369	GTG	2	6	156826	156831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_010369	GGC	2	6	156843	156848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_010369	AC	3	6	156881	156886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_010369	GTA	2	6	156888	156893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_010369	CGC	2	6	157078	157083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_010369	CGA	2	6	157120	157125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237778
3602	NC_010369	CGTC	2	8	157289	157296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_010369	CTC	2	6	157436	157441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_010369	CAA	2	6	157459	157464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_010369	ACC	2	6	157483	157488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_010369	CGG	2	6	157514	157519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_010369	CCG	2	6	157527	157532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_010369	ACC	2	6	157554	157559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_010369	GCC	2	6	157570	157575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_010369	GGA	2	6	157601	157606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_010369	CAGC	2	8	157642	157649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_010369	GAA	2	6	157653	157658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_010369	CGT	2	6	157687	157692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_010369	AG	3	6	157695	157700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_010369	GTT	2	6	157796	157801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_010369	AC	3	6	157863	157868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_010369	CCA	2	6	157871	157876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_010369	CGG	2	6	157929	157934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_010369	TC	3	6	157954	157959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_010369	TGT	2	6	158007	158012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_010369	GCA	2	6	158057	158062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_010369	TTTC	2	8	158073	158080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_010369	AGG	2	6	158100	158105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_010369	GTCGC	2	10	158140	158149	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3625	NC_010369	TCG	2	6	158231	158236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237779
3626	NC_010369	GTA	2	6	158248	158253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237779
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3628	NC_010369	CG	3	6	158522	158527	0 %	0 %	50 %	50 %	169237779
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3991	NC_010369	ACT	2	6	173099	173104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237789
3992	NC_010369	GTA	2	6	173159	173164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237789
3993	NC_010369	TCT	2	6	173167	173172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237789
3994	NC_010369	CTC	2	6	173174	173179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237789
3995	NC_010369	GAC	2	6	173180	173185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237789
3996	NC_010369	CGA	2	6	173212	173217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237789
3997	NC_010369	GCTGC	2	10	173227	173236	0 %	20 %	40 %	40 %	169237789
3998	NC_010369	GTC	2	6	173246	173251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
3999	NC_010369	TCG	2	6	173268	173273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237789
4000	NC_010369	CGA	2	6	173287	173292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237789

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