MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 4532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010369	GAG	2	6	106112	106117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_010369	AGG	2	6	106187	106192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_010369	CGA	2	6	106265	106270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_010369	GAG	2	6	106290	106295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_010369	AGG	2	6	106493	106498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237724
2506	NC_010369	CCT	2	6	106532	106537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237724
2507	NC_010369	CGG	2	6	106547	106552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237724
2508	NC_010369	GCCG	2	8	106586	106593	0 %	0 %	50 %	50 %	169237724
2509	NC_010369	AAT	2	6	106607	106612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237724
2510	NC_010369	GTC	2	6	106675	106680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2511	NC_010369	GGC	2	6	106687	106692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237724
2512	NC_010369	GCA	2	6	106709	106714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2513	NC_010369	TCG	2	6	106717	106722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2514	NC_010369	TCGCGT	2	12	106768	106779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2515	NC_010369	GCT	2	6	106781	106786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2516	NC_010369	CGG	2	6	106841	106846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237724
2517	NC_010369	CGA	2	6	106853	106858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2518	NC_010369	GC	3	6	106869	106874	0 %	0 %	50 %	50 %	169237724
2519	NC_010369	TCA	2	6	106940	106945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237724
2520	NC_010369	CGCC	2	8	106946	106953	0 %	0 %	25 %	75 %	169237724
2521	NC_010369	CGTC	2	8	106964	106971	0 %	25 %	25 %	50 %	169237724
2522	NC_010369	GCG	2	6	106986	106991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237724
2523	NC_010369	CG	3	6	107073	107078	0 %	0 %	50 %	50 %	169237724
2524	NC_010369	GCG	2	6	107080	107085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237724
2525	NC_010369	GCT	2	6	107088	107093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2526	NC_010369	GCA	2	6	107107	107112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2527	NC_010369	GC	3	6	107116	107121	0 %	0 %	50 %	50 %	169237724
2528	NC_010369	TCG	2	6	107122	107127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2529	NC_010369	CGT	2	6	107180	107185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2530	NC_010369	CTT	2	6	107204	107209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237724
2531	NC_010369	CGG	2	6	107210	107215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237724
2532	NC_010369	GTC	2	6	107218	107223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2533	NC_010369	CCA	2	6	107259	107264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237724
2534	NC_010369	GC	4	8	107275	107282	0 %	0 %	50 %	50 %	169237724
2535	NC_010369	TCT	2	6	107323	107328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237724
2536	NC_010369	TCG	2	6	107365	107370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2537	NC_010369	GTT	2	6	107394	107399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237724
2538	NC_010369	TTG	2	6	107422	107427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237724
2539	NC_010369	GTC	2	6	107481	107486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2540	NC_010369	GAG	2	6	107487	107492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237724
2541	NC_010369	CGT	2	6	107522	107527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237724
2542	NC_010369	GTG	2	6	107633	107638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237725
2543	NC_010369	TCG	2	6	107669	107674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237725
2544	NC_010369	CAGC	2	8	107675	107682	25 %	0 %	25 %	50 %	169237725
2545	NC_010369	CGA	2	6	107688	107693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237725
2546	NC_010369	TGT	2	6	107700	107705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237725
2547	NC_010369	TGG	2	6	107747	107752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237725
2548	NC_010369	CGCT	2	8	107761	107768	0 %	25 %	25 %	50 %	169237725
2549	NC_010369	GGC	2	6	107800	107805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_010369	GTTT	2	8	107822	107829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_010369	AAACC	2	10	107839	107848	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2552	NC_010369	TA	3	6	107923	107928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_010369	CTG	2	6	108034	108039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_010369	AAC	2	6	108081	108086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_010369	AATG	2	8	108216	108223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_010369	CTGG	2	8	108267	108274	0 %	25 %	50 %	25 %	169237726
2557	NC_010369	TGTC	2	8	108306	108313	0 %	50 %	25 %	25 %	169237726
2558	NC_010369	TC	3	6	108341	108346	0 %	50 %	0 %	50 %	169237726
2559	NC_010369	CGC	2	6	108543	108548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237726
2560	NC_010369	TGG	2	6	108556	108561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237726
2561	NC_010369	ACT	2	6	108577	108582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237726
2562	NC_010369	TTCA	2	8	108677	108684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2563	NC_010369	TTG	2	6	108844	108849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237727
2564	NC_010369	TC	3	6	108893	108898	0 %	50 %	0 %	50 %	169237727
2565	NC_010369	ACG	2	6	108998	109003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_010369	CT	4	8	109078	109085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2567	NC_010369	TGT	2	6	109093	109098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_010369	CTG	2	6	109109	109114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_010369	ACT	2	6	109132	109137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237728
2570	NC_010369	GTT	2	6	109150	109155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237728
2571	NC_010369	CG	3	6	109165	109170	0 %	0 %	50 %	50 %	169237728
2572	NC_010369	CTG	2	6	109196	109201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237728
2573	NC_010369	TCG	2	6	109206	109211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237728
2574	NC_010369	CCG	2	6	109329	109334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237728
2575	NC_010369	ACC	2	6	109385	109390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237728
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2577	NC_010369	GCT	2	6	109503	109508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237728
2578	NC_010369	CGT	2	6	109535	109540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237728
2579	NC_010369	GGA	2	6	109726	109731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237728
2580	NC_010369	GCGTCG	2	12	109752	109763	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	169237728
2581	NC_010369	ATC	2	6	109764	109769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237728
2582	NC_010369	CTGC	2	8	109774	109781	0 %	25 %	25 %	50 %	169237728
2583	NC_010369	GAC	2	6	109862	109867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237728
2584	NC_010369	TCG	3	9	109890	109898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237728
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2587	NC_010369	AG	3	6	110030	110035	50 %	0 %	50 %	0 %	169237728
2588	NC_010369	CGT	2	6	110071	110076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237728
2589	NC_010369	CGT	2	6	110113	110118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237728
2590	NC_010369	GGT	2	6	110167	110172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237728
2591	NC_010369	TGT	2	6	110251	110256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_010369	ATA	2	6	110292	110297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_010369	GCT	2	6	110333	110338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_010369	ACG	2	6	110341	110346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_010369	AGT	2	6	110408	110413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_010369	GT	3	6	110412	110417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_010369	TCG	2	6	110682	110687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237729
2598	NC_010369	AAC	2	6	110689	110694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237729
2599	NC_010369	ACT	2	6	110721	110726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237729
2600	NC_010369	CGA	2	6	110767	110772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237729
2601	NC_010369	ATC	2	6	110855	110860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237729
2602	NC_010369	CA	3	6	110958	110963	50 %	0 %	0 %	50 %	169237729
2603	NC_010369	TC	4	8	111007	111014	0 %	50 %	0 %	50 %	169237729
2604	NC_010369	TCG	2	6	111033	111038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237729
2605	NC_010369	TGA	2	6	111067	111072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237729
2606	NC_010369	CGA	2	6	111084	111089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237729
2607	NC_010369	AC	3	6	111093	111098	50 %	0 %	0 %	50 %	169237729
2608	NC_010369	G	6	6	111118	111123	0 %	0 %	100 %	0 %	169237729
2609	NC_010369	CGAG	2	8	111157	111164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2610	NC_010369	CAG	2	6	111284	111289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237730
2611	NC_010369	CGA	2	6	111332	111337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237730
2612	NC_010369	GAA	2	6	111361	111366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237730
2613	NC_010369	AGT	2	6	111421	111426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237730
2614	NC_010369	CAG	2	6	111475	111480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237730
2615	NC_010369	AAC	2	6	111499	111504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237730
2616	NC_010369	CGG	2	6	111515	111520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237730
2617	NC_010369	TCAC	2	8	111572	111579	25 %	25 %	0 %	50 %	169237730
2618	NC_010369	TAC	2	6	111634	111639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237730
2619	NC_010369	TAC	2	6	111655	111660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237730
2620	NC_010369	ACCC	2	8	111662	111669	25 %	0 %	0 %	75 %	169237730
2621	NC_010369	GAGT	2	8	111714	111721	25 %	25 %	50 %	0 %	169237730
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2623	NC_010369	CGA	2	6	111845	111850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2994	NC_010369	CCT	2	6	129301	129306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237744
2995	NC_010369	ACGC	2	8	129402	129409	25 %	0 %	25 %	50 %	169237744
2996	NC_010369	CGA	2	6	129488	129493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237744
2997	NC_010369	ATG	2	6	129504	129509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237744
2998	NC_010369	CGG	2	6	129552	129557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237744
2999	NC_010369	GAC	2	6	129617	129622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237744
3000	NC_010369	AAT	2	6	129764	129769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237744

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