MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 4532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010369	GCG	2	6	85375	85380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237698
2002	NC_010369	GTAC	2	8	85425	85432	25 %	25 %	25 %	25 %	169237698
2003	NC_010369	AAT	2	6	85500	85505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237698
2004	NC_010369	CTG	2	6	85530	85535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237698
2005	NC_010369	AGC	2	6	85591	85596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237698
2006	NC_010369	GCT	2	6	85692	85697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237698
2007	NC_010369	TTC	2	6	85747	85752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237698
2008	NC_010369	CG	3	6	85756	85761	0 %	0 %	50 %	50 %	169237698
2009	NC_010369	GGT	2	6	85788	85793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237698
2010	NC_010369	GTC	2	6	85830	85835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237698
2011	NC_010369	TCA	2	6	85837	85842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237698
2012	NC_010369	GTA	2	6	85845	85850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237698
2013	NC_010369	CGA	2	6	85901	85906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237698
2014	NC_010369	GAA	2	6	85916	85921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237698
2015	NC_010369	GAT	2	6	85970	85975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237698
2016	NC_010369	CGG	2	6	86042	86047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237698
2017	NC_010369	CGA	2	6	86054	86059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237698
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2020	NC_010369	TGCT	2	8	86178	86185	0 %	50 %	25 %	25 %	169237698
2021	NC_010369	AC	3	6	86195	86200	50 %	0 %	0 %	50 %	169237698
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2023	NC_010369	CTAA	2	8	86219	86226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2024	NC_010369	TAGC	2	8	86271	86278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2025	NC_010369	CT	3	6	86298	86303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2026	NC_010369	CGAA	2	8	86359	86366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2027	NC_010369	TTG	2	6	86409	86414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2030	NC_010369	TTG	2	6	86518	86523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_010369	CTG	2	6	86585	86590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_010369	TCG	2	6	86599	86604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2042	NC_010369	CT	3	6	86859	86864	0 %	50 %	0 %	50 %	169237699
2043	NC_010369	GA	3	6	86914	86919	50 %	0 %	50 %	0 %	169237699
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2047	NC_010369	CTGAA	2	10	87073	87082	40 %	20 %	20 %	20 %	169237699
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2056	NC_010369	CTG	2	6	87585	87590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237699
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2090	NC_010369	CAT	2	6	88662	88667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2097	NC_010369	GCT	2	6	89103	89108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237702
2098	NC_010369	CAC	2	6	89151	89156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2099	NC_010369	CTA	2	6	89356	89361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237703
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2101	NC_010369	CGGC	2	8	89380	89387	0 %	0 %	50 %	50 %	169237703
2102	NC_010369	CGA	2	6	89401	89406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237703
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2105	NC_010369	CA	3	6	89470	89475	50 %	0 %	0 %	50 %	169237703
2106	NC_010369	GA	3	6	89487	89492	50 %	0 %	50 %	0 %	169237703
2107	NC_010369	TCG	2	6	89500	89505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237703
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2109	NC_010369	TCAC	2	8	89578	89585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2110	NC_010369	CAA	2	6	89588	89593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_010369	TGCT	2	8	89684	89691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2112	NC_010369	CCG	2	6	89712	89717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2113	NC_010369	AGG	2	6	89745	89750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_010369	ACG	2	6	89751	89756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2115	NC_010369	GAC	2	6	90002	90007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_010369	GAC	2	6	90059	90064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_010369	GAAGA	2	10	90136	90145	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_010369	AAG	2	6	90210	90215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_010369	CGA	2	6	90379	90384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237704
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2121	NC_010369	AGTTC	2	10	90405	90414	20 %	40 %	20 %	20 %	169237704
2122	NC_010369	CAA	2	6	90685	90690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_010369	TCG	2	6	90737	90742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_010369	CGG	2	6	90761	90766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_010369	CTA	2	6	90802	90807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NC_010369	CCT	2	6	90873	90878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237705
2127	NC_010369	TGG	2	6	90977	90982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237705
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2129	NC_010369	TCA	2	6	91111	91116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237706
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2377	NC_010369	CGT	2	6	100569	100574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237717
2378	NC_010369	TCC	2	6	100595	100600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237717
2379	NC_010369	ACG	2	6	100613	100618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237717
2380	NC_010369	GACG	2	8	100629	100636	25 %	0 %	50 %	25 %	169237717
2381	NC_010369	TC	4	8	100731	100738	0 %	50 %	0 %	50 %	169237717
2382	NC_010369	CGA	2	6	100812	100817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237717
2383	NC_010369	ATG	2	6	100820	100825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237717
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2385	NC_010369	GGC	2	6	100878	100883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237717
2386	NC_010369	ACG	2	6	100901	100906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237717
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2390	NC_010369	TGA	2	6	101199	101204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237717
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2473	NC_010369	CTA	2	6	104773	104778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2494	NC_010369	TGCG	2	8	105687	105694	0 %	25 %	50 %	25 %	169237723
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2496	NC_010369	GGC	2	6	105884	105889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2497	NC_010369	GCAG	2	8	105976	105983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2498	NC_010369	CCGA	2	8	105994	106001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2499	NC_010369	CGC	2	6	106030	106035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2500	NC_010369	CCG	2	6	106077	106082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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