MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 4532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010369	TC	3	6	65291	65296	0 %	50 %	0 %	50 %	169237682
1502	NC_010369	GC	4	8	65326	65333	0 %	0 %	50 %	50 %	169237682
1503	NC_010369	GC	3	6	65335	65340	0 %	0 %	50 %	50 %	169237682
1504	NC_010369	GAGTTC	2	12	65370	65381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169237682
1505	NC_010369	GTA	2	6	65538	65543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237682
1506	NC_010369	CGA	2	6	65594	65599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237682
1507	NC_010369	TCG	2	6	65623	65628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237682
1508	NC_010369	ACA	2	6	65649	65654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237682
1509	NC_010369	TCG	2	6	65677	65682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237682
1510	NC_010369	GCC	2	6	65736	65741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237682
1511	NC_010369	TCG	2	6	65755	65760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237682
1512	NC_010369	TCG	2	6	65764	65769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237682
1513	NC_010369	TTC	2	6	65859	65864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237682
1514	NC_010369	TTCG	2	8	65867	65874	0 %	50 %	25 %	25 %	169237682
1515	NC_010369	TCC	2	6	65893	65898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237682
1516	NC_010369	TCG	2	6	65902	65907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237682
1517	NC_010369	GA	3	6	65935	65940	50 %	0 %	50 %	0 %	169237682
1518	NC_010369	ACC	2	6	65977	65982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237682
1519	NC_010369	CAG	2	6	65995	66000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010369	GAA	2	6	66037	66042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010369	AAC	2	6	66177	66182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237683
1522	NC_010369	GAG	2	6	66201	66206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237683
1523	NC_010369	TAC	2	6	66265	66270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237683
1524	NC_010369	CCG	2	6	66357	66362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237683
1525	NC_010369	AGA	2	6	66484	66489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237683
1526	NC_010369	CGC	2	6	66544	66549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237683
1527	NC_010369	AGA	2	6	66550	66555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237683
1528	NC_010369	ATT	2	6	66565	66570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237683
1529	NC_010369	TCT	2	6	66657	66662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237683
1530	NC_010369	GTC	2	6	66729	66734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237683
1531	NC_010369	AG	3	6	66755	66760	50 %	0 %	50 %	0 %	169237683
1532	NC_010369	GTG	2	6	66829	66834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237683
1533	NC_010369	GGAT	2	8	66846	66853	25 %	25 %	50 %	0 %	169237683
1534	NC_010369	AGA	2	6	66892	66897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237683
1535	NC_010369	GAGC	2	8	67006	67013	25 %	0 %	50 %	25 %	169237684
1536	NC_010369	AC	3	6	67063	67068	50 %	0 %	0 %	50 %	169237684
1537	NC_010369	TGT	2	6	67106	67111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237684
1538	NC_010369	TC	3	6	67200	67205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_010369	GTTGA	2	10	67222	67231	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010369	CTC	2	6	67277	67282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_010369	GTC	2	6	67284	67289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_010369	GA	3	6	67298	67303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010369	GCTT	2	8	67333	67340	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_010369	AGAT	2	8	67360	67367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010369	GT	3	6	67456	67461	0 %	50 %	50 %	0 %	169237685
1546	NC_010369	ACC	2	6	67482	67487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237685
1547	NC_010369	ACAG	2	8	67555	67562	50 %	0 %	25 %	25 %	169237685
1548	NC_010369	GAAC	2	8	67684	67691	50 %	0 %	25 %	25 %	169237685
1549	NC_010369	CG	3	6	67774	67779	0 %	0 %	50 %	50 %	169237685
1550	NC_010369	TCGA	2	8	67860	67867	25 %	25 %	25 %	25 %	169237685
1551	NC_010369	AGG	2	6	67878	67883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237685
1552	NC_010369	ATC	2	6	67929	67934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237685
1553	NC_010369	TCCG	2	8	68062	68069	0 %	25 %	25 %	50 %	169237685
1554	NC_010369	CCGA	2	8	68099	68106	25 %	0 %	25 %	50 %	169237685
1555	NC_010369	GCG	2	6	68146	68151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237685
1556	NC_010369	CGTTCG	2	12	68160	68171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237685
1557	NC_010369	TCG	2	6	68175	68180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237685
1558	NC_010369	GCT	2	6	68212	68217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237685
1559	NC_010369	CGA	3	9	68221	68229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237685
1560	NC_010369	TGG	2	6	68263	68268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237685
1561	NC_010369	TCG	2	6	68325	68330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237685
1562	NC_010369	CGT	2	6	68333	68338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237685
1563	NC_010369	TC	3	6	68395	68400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_010369	CGG	2	6	68480	68485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_010369	GCC	2	6	68494	68499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_010369	TGGG	2	8	68514	68521	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010369	GCG	2	6	68522	68527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_010369	A	6	6	68552	68557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010369	ACT	2	6	68575	68580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237686
1570	NC_010369	CAC	2	6	68583	68588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237686
1571	NC_010369	CGC	2	6	68663	68668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237686
1572	NC_010369	TCC	2	6	68694	68699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237686
1573	NC_010369	TTCG	2	8	68736	68743	0 %	50 %	25 %	25 %	169237686
1574	NC_010369	CCT	2	6	68830	68835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237686
1575	NC_010369	CGA	2	6	68908	68913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237686
1576	NC_010369	TCA	2	6	68920	68925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237686
1577	NC_010369	GAC	2	6	68939	68944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237686
1578	NC_010369	GCC	2	6	68956	68961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237686
1579	NC_010369	CGC	2	6	68969	68974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237686
1580	NC_010369	CCAT	2	8	68981	68988	25 %	25 %	0 %	50 %	169237686
1581	NC_010369	GTTC	2	8	69016	69023	0 %	50 %	25 %	25 %	169237686
1582	NC_010369	CGCT	2	8	69094	69101	0 %	25 %	25 %	50 %	169237686
1583	NC_010369	CGC	2	6	69102	69107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237686
1584	NC_010369	CGC	2	6	69123	69128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237686
1585	NC_010369	CGC	2	6	69143	69148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237686
1586	NC_010369	CGTT	2	8	69158	69165	0 %	50 %	25 %	25 %	169237686
1587	NC_010369	TCCT	2	8	69281	69288	0 %	50 %	0 %	50 %	169237686
1588	NC_010369	CG	3	6	69294	69299	0 %	0 %	50 %	50 %	169237686
1589	NC_010369	CGA	2	6	69370	69375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237686
1590	NC_010369	ACT	2	6	69441	69446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237686
1591	NC_010369	ACA	2	6	69523	69528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_010369	CGA	2	6	69542	69547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_010369	CGAC	2	8	69551	69558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_010369	GC	3	6	69569	69574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_010369	TCGC	2	8	69577	69584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_010369	GCGA	2	8	69609	69616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_010369	GC	3	6	69619	69624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_010369	GACG	2	8	69629	69636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_010369	CG	3	6	69649	69654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_010369	CCCG	2	8	69659	69666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1601	NC_010369	GAGC	2	8	69667	69674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_010369	CGTC	2	8	69712	69719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_010369	TCC	2	6	69741	69746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_010369	CGGGCG	2	12	69810	69821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_010369	GGTC	2	8	69850	69857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_010369	GCGA	2	8	69858	69865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_010369	GTGC	2	8	69891	69898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_010369	C	6	6	70035	70040	0 %	0 %	0 %	100 %	169237687
1609	NC_010369	GTCA	2	8	70049	70056	25 %	25 %	25 %	25 %	169237687
1610	NC_010369	CGA	2	6	70081	70086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237687
1611	NC_010369	TCC	2	6	70155	70160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237687
1612	NC_010369	CTT	2	6	70168	70173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237687
1613	NC_010369	TCA	2	6	70209	70214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237687
1614	NC_010369	CAA	2	6	70285	70290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237687
1615	NC_010369	GGTC	2	8	70327	70334	0 %	25 %	50 %	25 %	169237687
1616	NC_010369	CCA	2	6	70384	70389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237687
1617	NC_010369	GTC	2	6	70415	70420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237687
1618	NC_010369	CGT	2	6	70423	70428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237687
1619	NC_010369	ACA	2	6	70447	70452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237687
1620	NC_010369	CTC	2	6	70520	70525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237687
1621	NC_010369	C	6	6	70544	70549	0 %	0 %	0 %	100 %	169237687
1622	NC_010369	GAT	2	6	70550	70555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237687
1623	NC_010369	GCA	2	6	70671	70676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237687
1624	NC_010369	TCG	2	6	70695	70700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237687
1625	NC_010369	GTC	2	6	70722	70727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237687
1626	NC_010369	AC	3	6	70741	70746	50 %	0 %	0 %	50 %	169237687
1627	NC_010369	GCG	2	6	70783	70788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237687
1628	NC_010369	GT	3	6	70840	70845	0 %	50 %	50 %	0 %	169237687
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1630	NC_010369	GCCC	2	8	70900	70907	0 %	0 %	25 %	75 %	169237687
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