MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 4532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010369	GAG	2	6	43214	43219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237650
1002	NC_010369	CGTGA	2	10	43274	43283	20 %	20 %	40 %	20 %	169237650
1003	NC_010369	GAG	2	6	43295	43300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237650
1004	NC_010369	TCA	2	6	43320	43325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237650
1005	NC_010369	CGC	2	6	43393	43398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237650
1006	NC_010369	ACT	2	6	43450	43455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237651
1007	NC_010369	TC	3	6	43477	43482	0 %	50 %	0 %	50 %	169237651
1008	NC_010369	CTG	2	6	43492	43497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1009	NC_010369	CTC	2	6	43544	43549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237651
1010	NC_010369	TCG	2	6	43617	43622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1011	NC_010369	ACGC	2	8	43636	43643	25 %	0 %	25 %	50 %	169237651
1012	NC_010369	TGT	2	6	43678	43683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237651
1013	NC_010369	CGA	2	6	43696	43701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1014	NC_010369	CGC	2	6	43718	43723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237651
1015	NC_010369	GAC	2	6	43796	43801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1016	NC_010369	CCG	2	6	43829	43834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237651
1017	NC_010369	ATCG	2	8	43835	43842	25 %	25 %	25 %	25 %	169237651
1018	NC_010369	TCG	2	6	43854	43859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1019	NC_010369	TCG	2	6	43870	43875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1020	NC_010369	CG	3	6	43943	43948	0 %	0 %	50 %	50 %	169237651
1021	NC_010369	TCG	2	6	43953	43958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1022	NC_010369	GCG	2	6	43977	43982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237651
1023	NC_010369	GTC	2	6	44012	44017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1024	NC_010369	AC	3	6	44019	44024	50 %	0 %	0 %	50 %	169237651
1025	NC_010369	CGA	2	6	44038	44043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1026	NC_010369	CGT	2	6	44065	44070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237651
1027	NC_010369	CAC	2	6	44082	44087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237651
1028	NC_010369	TGG	2	6	44278	44283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237652
1029	NC_010369	TGC	2	6	44326	44331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237652
1030	NC_010369	CGG	2	6	44397	44402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237652
1031	NC_010369	GCG	2	6	44421	44426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237652
1032	NC_010369	GT	4	8	44449	44456	0 %	50 %	50 %	0 %	169237652
1033	NC_010369	GCGTCG	2	12	44552	44563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	169237652
1034	NC_010369	CGA	2	6	44604	44609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237652
1035	NC_010369	TCG	2	6	44612	44617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237652
1036	NC_010369	TCG	2	6	44714	44719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237652
1037	NC_010369	TGG	2	6	44737	44742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237653
1038	NC_010369	TCG	2	6	44749	44754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237653
1039	NC_010369	CGT	2	6	44793	44798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237653
1040	NC_010369	GTC	2	6	44814	44819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237653
1041	NC_010369	CCGT	2	8	44824	44831	0 %	25 %	25 %	50 %	169237653
1042	NC_010369	TTC	2	6	44859	44864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237653
1043	NC_010369	AGC	2	6	44932	44937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237653
1044	NC_010369	CGT	2	6	45012	45017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237653
1045	NC_010369	GCTC	2	8	45086	45093	0 %	25 %	25 %	50 %	169237653
1046	NC_010369	GCC	2	6	45118	45123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237653
1047	NC_010369	CGT	2	6	45131	45136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237653
1048	NC_010369	CGA	2	6	45146	45151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237653
1049	NC_010369	GTG	2	6	45175	45180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237653
1050	NC_010369	CGT	2	6	45215	45220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237653
1051	NC_010369	TTCT	2	8	45284	45291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_010369	GC	4	8	45309	45316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_010369	CGA	2	6	45319	45324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010369	GAGC	2	8	45328	45335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_010369	CGGAG	2	10	45337	45346	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_010369	CA	3	6	45377	45382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_010369	A	7	7	45385	45391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010369	CAC	2	6	45420	45425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237654
1059	NC_010369	ACC	2	6	45454	45459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237654
1060	NC_010369	TTC	2	6	45495	45500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237654
1061	NC_010369	CTCG	2	8	45520	45527	0 %	25 %	25 %	50 %	169237654
1062	NC_010369	GACC	2	8	45601	45608	25 %	0 %	25 %	50 %	169237654
1063	NC_010369	CCT	2	6	45667	45672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237654
1064	NC_010369	CGAT	2	8	45675	45682	25 %	25 %	25 %	25 %	169237654
1065	NC_010369	TCC	2	6	45684	45689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237654
1066	NC_010369	C	6	6	45711	45716	0 %	0 %	0 %	100 %	169237654
1067	NC_010369	CTC	2	6	45731	45736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237654
1068	NC_010369	CGA	2	6	45775	45780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237654
1069	NC_010369	CGC	2	6	45806	45811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237654
1070	NC_010369	ATC	2	6	45899	45904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237654
1071	NC_010369	CGC	2	6	45935	45940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237654
1072	NC_010369	GCT	2	6	45943	45948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237654
1073	NC_010369	CCG	2	6	45956	45961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237654
1074	NC_010369	GCG	2	6	45981	45986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237654
1075	NC_010369	CCGC	2	8	45988	45995	0 %	0 %	25 %	75 %	169237654
1076	NC_010369	GCT	2	6	46000	46005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237654
1077	NC_010369	CTC	2	6	46079	46084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237654
1078	NC_010369	CTCG	2	8	46115	46122	0 %	25 %	25 %	50 %	169237654
1079	NC_010369	TCG	2	6	46203	46208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237654
1080	NC_010369	CCGC	2	8	46242	46249	0 %	0 %	25 %	75 %	169237654
1081	NC_010369	CGT	2	6	46286	46291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237654
1082	NC_010369	GTT	2	6	46295	46300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237654
1083	NC_010369	TTC	2	6	46375	46380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237655
1084	NC_010369	GAC	3	9	46385	46393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237655
1085	NC_010369	CTCG	2	8	46415	46422	0 %	25 %	25 %	50 %	169237655
1086	NC_010369	CCT	2	6	46438	46443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237655
1087	NC_010369	GCGA	2	8	46448	46455	25 %	0 %	50 %	25 %	169237655
1088	NC_010369	GC	3	6	46458	46463	0 %	0 %	50 %	50 %	169237655
1089	NC_010369	GAG	2	6	46466	46471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237655
1090	NC_010369	CG	3	6	46488	46493	0 %	0 %	50 %	50 %	169237655
1091	NC_010369	CGG	2	6	46522	46527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237655
1092	NC_010369	AGCG	2	8	46541	46548	25 %	0 %	50 %	25 %	169237655
1093	NC_010369	AGC	2	6	46568	46573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237655
1094	NC_010369	GAGT	2	8	46598	46605	25 %	25 %	50 %	0 %	169237655
1095	NC_010369	CCCG	2	8	46616	46623	0 %	0 %	25 %	75 %	169237655
1096	NC_010369	G	6	6	46650	46655	0 %	0 %	100 %	0 %	169237655
1097	NC_010369	AGC	2	6	46658	46663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237655
1098	NC_010369	CGC	2	6	46666	46671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237655
1099	NC_010369	TCC	2	6	46676	46681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237655
1100	NC_010369	CGGGCG	2	12	46727	46738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237655
1101	NC_010369	GGTC	2	8	46767	46774	0 %	25 %	50 %	25 %	169237655
1102	NC_010369	GCGA	2	8	46775	46782	25 %	0 %	50 %	25 %	169237655
1103	NC_010369	G	6	6	46789	46794	0 %	0 %	100 %	0 %	169237655
1104	NC_010369	A	6	6	46831	46836	100 %	0 %	0 %	0 %	169237655
1105	NC_010369	GCCT	2	8	46839	46846	0 %	25 %	25 %	50 %	169237655
1106	NC_010369	ACC	2	6	46860	46865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237655
1107	NC_010369	CA	3	6	46896	46901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_010369	GGC	2	6	47058	47063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237656
1109	NC_010369	GCC	2	6	47075	47080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237656
1110	NC_010369	GTC	2	6	47116	47121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237656
1111	NC_010369	CGG	2	6	47232	47237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237656
1112	NC_010369	GCC	2	6	47286	47291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237656
1113	NC_010369	TCC	2	6	47318	47323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237656
1114	NC_010369	CGG	2	6	47370	47375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237656
1115	NC_010369	CGG	2	6	47390	47395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237656
1116	NC_010369	TCG	2	6	47411	47416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237656
1117	NC_010369	GCTC	2	8	47441	47448	0 %	25 %	25 %	50 %	169237656
1118	NC_010369	CGG	2	6	47463	47468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237656
1119	NC_010369	GCCC	2	8	47525	47532	0 %	0 %	25 %	75 %	169237656
1120	NC_010369	CAG	2	6	47587	47592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237656
1121	NC_010369	TCGCC	2	10	47595	47604	0 %	20 %	20 %	60 %	169237656
1122	NC_010369	AGC	2	6	47747	47752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237656
1123	NC_010369	CCA	2	6	47758	47763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237656
1124	NC_010369	CAG	2	6	47834	47839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237656
1125	NC_010369	CCG	2	6	47856	47861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237656
1126	NC_010369	GGC	2	6	47875	47880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237656
1127	NC_010369	ACCGG	2	10	47892	47901	20 %	0 %	40 %	40 %	169237656
1128	NC_010369	AAG	2	6	47935	47940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237656
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1130	NC_010369	TCG	3	9	48021	48029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237656
1131	NC_010369	CGG	2	6	48042	48047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237656
1132	NC_010369	CGA	2	6	48114	48119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237656
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1141	NC_010369	AG	3	6	48580	48585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1159	NC_010369	ACT	2	6	49443	49448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237658
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1164	NC_010369	ATCA	2	8	49641	49648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1165	NC_010369	GGT	2	6	49652	49657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1168	NC_010369	CGGGCG	2	12	49728	49739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1229	NC_010369	CG	3	6	52995	53000	0 %	0 %	50 %	50 %	169237664
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1246	NC_010369	TTCT	2	8	53523	53530	0 %	75 %	0 %	25 %	169237665
1247	NC_010369	GTC	2	6	53556	53561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237665
1248	NC_010369	CG	3	6	53607	53612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1249	NC_010369	CGT	2	6	53751	53756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237666
1250	NC_010369	CAC	2	6	53839	53844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237666
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1252	NC_010369	CTT	2	6	53878	53883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237666
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1254	NC_010369	TTC	2	6	53927	53932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237666
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1378	NC_010369	CCG	2	6	59157	59162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1379	NC_010369	AGT	2	6	59231	59236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_010369	CTA	2	6	59315	59320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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