MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 4532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010369	GC	3	6	22449	22454	0 %	0 %	50 %	50 %	169237626
502	NC_010369	CGA	3	9	22483	22491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
503	NC_010369	CCG	2	6	22532	22537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237626
504	NC_010369	CGA	2	6	22627	22632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
505	NC_010369	TCG	2	6	22665	22670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237626
506	NC_010369	GCC	2	6	22727	22732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237626
507	NC_010369	CCAGG	2	10	22769	22778	20 %	0 %	40 %	40 %	169237626
508	NC_010369	GTC	2	6	22793	22798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237626
509	NC_010369	GAC	2	6	22799	22804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237626
510	NC_010369	TCGCCC	2	12	22827	22838	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	169237626
511	NC_010369	TAC	2	6	22868	22873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237626
512	NC_010369	ACCCC	2	10	23012	23021	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
513	NC_010369	CGT	2	6	23029	23034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010369	CGT	2	6	23083	23088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010369	CCCCA	2	10	23098	23107	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
516	NC_010369	CGT	2	6	23114	23119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010369	TAG	2	6	23134	23139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010369	AGTCC	2	10	23155	23164	20 %	20 %	20 %	40 %	169237627
519	NC_010369	GAC	2	6	23197	23202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237627
520	NC_010369	TTG	2	6	23255	23260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237627
521	NC_010369	CGG	2	6	23318	23323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237627
522	NC_010369	GAT	2	6	23346	23351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237627
523	NC_010369	TCG	2	6	23399	23404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237627
524	NC_010369	CGC	2	6	23440	23445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237627
525	NC_010369	TCC	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237627
526	NC_010369	GAA	2	6	23577	23582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237627
527	NC_010369	GCG	2	6	23618	23623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237627
528	NC_010369	CGT	2	6	23715	23720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237627
529	NC_010369	GAA	2	6	23728	23733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237627
530	NC_010369	GCT	2	6	23752	23757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237627
531	NC_010369	TTG	2	6	23795	23800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237627
532	NC_010369	CCT	2	6	23841	23846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237627
533	NC_010369	GC	3	6	23849	23854	0 %	0 %	50 %	50 %	169237627
534	NC_010369	TCA	2	6	23862	23867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237627
535	NC_010369	GTC	2	6	23875	23880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237627
536	NC_010369	TCA	2	6	23883	23888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237627
537	NC_010369	GATC	2	8	23889	23896	25 %	25 %	25 %	25 %	169237627
538	NC_010369	TCG	2	6	23897	23902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237627
539	NC_010369	GAT	3	9	23905	23913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237627
540	NC_010369	GTA	2	6	23956	23961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237627
541	NC_010369	GT	3	6	23981	23986	0 %	50 %	50 %	0 %	169237627
542	NC_010369	GAG	2	6	24035	24040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237627
543	NC_010369	ATC	2	6	24179	24184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237627
544	NC_010369	TCG	2	6	24248	24253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237627
545	NC_010369	CGAC	2	8	24254	24261	25 %	0 %	25 %	50 %	169237627
546	NC_010369	GATGC	2	10	24316	24325	20 %	20 %	40 %	20 %	169237627
547	NC_010369	TCG	2	6	24344	24349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237627
548	NC_010369	GGAG	2	8	24400	24407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010369	ACC	2	6	24427	24432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_010369	GA	3	6	24526	24531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010369	CA	3	6	24578	24583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_010369	CGT	2	6	24595	24600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010369	GGGGA	2	10	24616	24625	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010369	GAA	2	6	24629	24634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010369	ACG	2	6	24642	24647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_010369	AGC	2	6	24699	24704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010369	CCT	2	6	24747	24752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_010369	AGTT	2	8	24814	24821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010369	ACG	2	6	24903	24908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010369	G	6	6	24916	24921	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010369	CCAC	2	8	24953	24960	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
562	NC_010369	ACG	2	6	24969	24974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010369	GTGGG	2	10	24980	24989	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010369	TCC	2	6	24992	24997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_010369	CCAT	2	8	25030	25037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_010369	TCG	2	6	25051	25056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_010369	TCC	2	6	25081	25086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_010369	AGC	2	6	25181	25186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237628
569	NC_010369	CCTCAT	2	12	25192	25203	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	169237628
570	NC_010369	ATG	2	6	25226	25231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237628
571	NC_010369	CGC	2	6	25314	25319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237628
572	NC_010369	GTAG	2	8	25361	25368	25 %	25 %	50 %	0 %	169237628
573	NC_010369	CTG	2	6	25376	25381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237628
574	NC_010369	CGC	2	6	25459	25464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237628
575	NC_010369	TCTG	2	8	25476	25483	0 %	50 %	25 %	25 %	169237628
576	NC_010369	AGT	2	6	25588	25593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237628
577	NC_010369	GGA	2	6	25600	25605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237628
578	NC_010369	GTG	2	6	25664	25669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237628
579	NC_010369	CAC	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237628
580	NC_010369	CGC	2	6	25757	25762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010369	TGA	2	6	25783	25788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010369	AGT	3	9	25864	25872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237629
583	NC_010369	TGATCG	2	12	25894	25905	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	169237629
584	NC_010369	CTT	2	6	25957	25962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237629
585	NC_010369	CTC	2	6	25973	25978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237629
586	NC_010369	GCT	2	6	26041	26046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237629
587	NC_010369	CGG	3	9	26286	26294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010369	GCC	2	6	26298	26303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_010369	GAA	2	6	26358	26363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010369	GTC	2	6	26367	26372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_010369	GCC	2	6	26422	26427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_010369	GCA	2	6	26429	26434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_010369	GGC	2	6	26471	26476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010369	CGG	2	6	26485	26490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010369	GCC	2	6	26494	26499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_010369	AGC	2	6	26536	26541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010369	CTCGA	2	10	26623	26632	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
598	NC_010369	GCG	2	6	26695	26700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_010369	ATCGT	2	10	26727	26736	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
600	NC_010369	CTG	2	6	26739	26744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010369	CTG	2	6	26818	26823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010369	CAG	2	6	26889	26894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010369	TGT	2	6	26909	26914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010369	GAG	2	6	26964	26969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010369	TGG	2	6	26996	27001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010369	CG	3	6	27055	27060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_010369	CGT	2	6	27084	27089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_010369	GTA	2	6	27144	27149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010369	TAG	2	6	27171	27176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010369	TTC	2	6	27227	27232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010369	AGC	2	6	27328	27333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237630
612	NC_010369	ACGG	2	8	27387	27394	25 %	0 %	50 %	25 %	169237630
613	NC_010369	GTT	2	6	27418	27423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237630
614	NC_010369	CCG	2	6	27448	27453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237630
615	NC_010369	GTG	2	6	27490	27495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237630
616	NC_010369	GAC	2	6	27546	27551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237630
617	NC_010369	GTT	2	6	27596	27601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237630
618	NC_010369	TCC	2	6	27607	27612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010369	TTG	2	6	27655	27660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010369	GAC	2	6	27675	27680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010369	CTG	2	6	27689	27694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010369	ACT	2	6	27703	27708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_010369	CTT	2	6	27714	27719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010369	TA	3	6	27720	27725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010369	CGA	2	6	27816	27821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237631
626	NC_010369	CT	3	6	27845	27850	0 %	50 %	0 %	50 %	169237631
627	NC_010369	TCG	2	6	27867	27872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237631
628	NC_010369	GCG	2	6	27904	27909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237631
629	NC_010369	CTG	2	6	27995	28000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237631
630	NC_010369	TAC	2	6	28025	28030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237631
631	NC_010369	TCG	2	6	28128	28133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237631
632	NC_010369	ACG	2	6	28269	28274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237631
633	NC_010369	CTCG	2	8	28331	28338	0 %	25 %	25 %	50 %	169237631
634	NC_010369	CTA	2	6	28381	28386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237631
635	NC_010369	CGG	2	6	28419	28424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237631
636	NC_010369	CTG	2	6	28429	28434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237631
637	NC_010369	CGG	2	6	28453	28458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237631
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640	NC_010369	GGC	2	6	28531	28536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237631
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644	NC_010369	TCG	2	6	28774	28779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237632
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662	NC_010369	ACT	2	6	29443	29448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_010369	TAC	2	6	29452	29457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_010369	TC	3	6	29466	29471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
665	NC_010369	AGA	2	6	29472	29477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
666	NC_010369	GAC	2	6	29571	29576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237634
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672	NC_010369	GTC	2	6	29760	29765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237634
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745	NC_010369	CTC	2	6	32792	32797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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748	NC_010369	TCG	2	6	32955	32960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
749	NC_010369	CGGG	2	8	33055	33062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
750	NC_010369	GAA	2	6	33068	33073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
751	NC_010369	GCTT	2	8	33117	33124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
752	NC_010369	CG	3	6	33185	33190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
753	NC_010369	ATC	2	6	33216	33221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
754	NC_010369	CCGA	2	8	33231	33238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
755	NC_010369	GGAAG	2	10	33247	33256	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
756	NC_010369	ACT	2	6	33257	33262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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