MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 4532

< Previous12345678910Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010369	GGT	2	6	193384	193389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237800
4502	NC_010369	GAC	2	6	193445	193450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237800
4503	NC_010369	CTC	2	6	193515	193520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237800
4504	NC_010369	GTG	2	6	193613	193618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237801
4505	NC_010369	TGGTTG	2	12	193619	193630	0 %	50 %	50 %	0 %	169237801
4506	NC_010369	ATT	2	6	193649	193654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169237801
4507	NC_010369	ATC	2	6	193687	193692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237801
4508	NC_010369	CTA	2	6	193722	193727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237801
4509	NC_010369	CCT	3	9	193797	193805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237801
4510	NC_010369	ACT	3	9	193815	193823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237801
4511	NC_010369	CAGT	2	8	193865	193872	25 %	25 %	25 %	25 %	169237801
4512	NC_010369	GTC	2	6	193897	193902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237801
4513	NC_010369	AC	3	6	193958	193963	50 %	0 %	0 %	50 %	169237801
4514	NC_010369	CGT	2	6	193977	193982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237801
4515	NC_010369	ACG	2	6	194009	194014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237801
4516	NC_010369	CGACTA	2	12	194040	194051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169237801
4517	NC_010369	ACG	2	6	194144	194149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237801
4518	NC_010369	GTC	2	6	194226	194231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_010369	GAC	2	6	194246	194251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_010369	ACT	2	6	194333	194338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_010369	ATT	2	6	194351	194356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_010369	TCAG	2	8	194424	194431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_010369	GCG	2	6	194448	194453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_010369	GGT	2	6	194516	194521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237802
4525	NC_010369	CGA	2	6	194536	194541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237802
4526	NC_010369	GTA	2	6	194765	194770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237802
4527	NC_010369	TTG	2	6	194777	194782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237802
4528	NC_010369	GTC	2	6	194786	194791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237802
4529	NC_010369	ACC	2	6	194898	194903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237802
4530	NC_010369	AGA	2	6	194908	194913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_010369	TCG	2	6	194919	194924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_010369	ATA	2	6	194948	194953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12345678910Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.