MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 6621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010368	TCG	2	6	122013	122018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237478
3002	NC_010368	ACG	2	6	122021	122026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237478
3003	NC_010368	TCA	2	6	122028	122033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237478
3004	NC_010368	CGT	2	6	122059	122064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237478
3005	NC_010368	CGG	2	6	122070	122075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237478
3006	NC_010368	TGA	2	6	122106	122111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237478
3007	NC_010368	CCG	2	6	122145	122150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237478
3008	NC_010368	CGC	2	6	122178	122183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237478
3009	NC_010368	AGC	2	6	122228	122233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237478
3010	NC_010368	ACG	2	6	122240	122245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237478
3011	NC_010368	ATG	2	6	122252	122257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237478
3012	NC_010368	CGAA	2	8	122273	122280	50 %	0 %	25 %	25 %	169237478
3013	NC_010368	GC	3	6	122313	122318	0 %	0 %	50 %	50 %	169237478
3014	NC_010368	CCGAG	2	10	122337	122346	20 %	0 %	40 %	40 %	169237478
3015	NC_010368	AACG	2	8	122347	122354	50 %	0 %	25 %	25 %	169237478
3016	NC_010368	GAT	2	6	122371	122376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237478
3017	NC_010368	GCTG	2	8	122443	122450	0 %	25 %	50 %	25 %	169237478
3018	NC_010368	CGT	2	6	122476	122481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237478
3019	NC_010368	GAC	2	6	122495	122500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237478
3020	NC_010368	TCG	2	6	122542	122547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237478
3021	NC_010368	TAGC	2	8	122616	122623	25 %	25 %	25 %	25 %	169237478
3022	NC_010368	CGG	2	6	122640	122645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_010368	AGTT	2	8	122680	122687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_010368	CAT	2	6	122753	122758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237479
3025	NC_010368	AAC	2	6	122767	122772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237479
3026	NC_010368	CG	3	6	122805	122810	0 %	0 %	50 %	50 %	169237479
3027	NC_010368	CTC	2	6	122871	122876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237479
3028	NC_010368	CGAGC	2	10	122882	122891	20 %	0 %	40 %	40 %	169237479
3029	NC_010368	GCG	2	6	122935	122940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237479
3030	NC_010368	TCG	2	6	122944	122949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3031	NC_010368	CTC	2	6	122966	122971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237479
3032	NC_010368	AAG	2	6	122979	122984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237479
3033	NC_010368	TGC	2	6	123040	123045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3034	NC_010368	AGC	2	6	123062	123067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3035	NC_010368	GCGA	2	8	123075	123082	25 %	0 %	50 %	25 %	169237479
3036	NC_010368	TCG	2	6	123085	123090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3037	NC_010368	CCT	2	6	123143	123148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237479
3038	NC_010368	CAT	2	6	123200	123205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237479
3039	NC_010368	CG	3	6	123246	123251	0 %	0 %	50 %	50 %	169237479
3040	NC_010368	TCA	2	6	123280	123285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237479
3041	NC_010368	CGT	2	6	123314	123319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3042	NC_010368	CGA	2	6	123434	123439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3043	NC_010368	CCAC	2	8	123481	123488	25 %	0 %	0 %	75 %	169237479
3044	NC_010368	GCC	2	6	123495	123500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237479
3045	NC_010368	GAC	2	6	123504	123509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3046	NC_010368	CAT	2	6	123515	123520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237479
3047	NC_010368	CGA	2	6	123539	123544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3048	NC_010368	CGA	2	6	123560	123565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3049	NC_010368	CA	3	6	123595	123600	50 %	0 %	0 %	50 %	169237479
3050	NC_010368	CTG	2	6	123624	123629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3051	NC_010368	CCG	2	6	123643	123648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237479
3052	NC_010368	CGA	2	6	123659	123664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237479
3053	NC_010368	CCGG	2	8	123727	123734	0 %	0 %	50 %	50 %	169237480
3054	NC_010368	CGA	2	6	123780	123785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237480
3055	NC_010368	CCA	2	6	123822	123827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237480
3056	NC_010368	CGA	2	6	123939	123944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237480
3057	NC_010368	CGTCG	2	10	123949	123958	0 %	20 %	40 %	40 %	169237480
3058	NC_010368	CGT	2	6	123969	123974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237480
3059	NC_010368	ACG	2	6	124019	124024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237480
3060	NC_010368	CGA	2	6	124053	124058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237480
3061	NC_010368	GGC	2	6	124128	124133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237480
3062	NC_010368	TC	3	6	124158	124163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_010368	CTG	2	6	124188	124193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_010368	GAG	2	6	124373	124378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237481
3065	NC_010368	CGCGGC	2	12	124414	124425	0 %	0 %	50 %	50 %	169237481
3066	NC_010368	CGG	2	6	124449	124454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237481
3067	NC_010368	GGC	2	6	124517	124522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237481
3068	NC_010368	GACGC	2	10	124559	124568	20 %	0 %	40 %	40 %	169237481
3069	NC_010368	CGA	2	6	124572	124577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3070	NC_010368	TCC	2	6	124578	124583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237481
3071	NC_010368	CGGA	2	8	124607	124614	25 %	0 %	50 %	25 %	169237481
3072	NC_010368	TGA	2	6	124713	124718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237481
3073	NC_010368	GC	3	6	124730	124735	0 %	0 %	50 %	50 %	169237481
3074	NC_010368	ACG	2	6	124740	124745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3075	NC_010368	CGA	2	6	124819	124824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3076	NC_010368	GAC	2	6	124838	124843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3077	NC_010368	CCT	2	6	124855	124860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237481
3078	NC_010368	CAG	2	6	124871	124876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3079	NC_010368	AGC	2	6	124881	124886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3080	NC_010368	GACC	2	8	124927	124934	25 %	0 %	25 %	50 %	169237481
3081	NC_010368	CGA	2	6	125014	125019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3082	NC_010368	ATCG	2	8	125060	125067	25 %	25 %	25 %	25 %	169237481
3083	NC_010368	ACG	2	6	125082	125087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3084	NC_010368	AGG	2	6	125136	125141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237481
3085	NC_010368	ACG	2	6	125148	125153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3086	NC_010368	TCA	2	6	125154	125159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237481
3087	NC_010368	ACG	2	6	125178	125183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3088	NC_010368	GCG	2	6	125193	125198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237481
3089	NC_010368	GAC	2	6	125231	125236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3090	NC_010368	CTCG	2	8	125278	125285	0 %	25 %	25 %	50 %	169237481
3091	NC_010368	ACG	2	6	125313	125318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3092	NC_010368	CGA	2	6	125397	125402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3093	NC_010368	ACG	2	6	125424	125429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3094	NC_010368	GTG	2	6	125447	125452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237481
3095	NC_010368	TCG	2	6	125487	125492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3096	NC_010368	ATC	2	6	125591	125596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237481
3097	NC_010368	GAG	2	6	125636	125641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237481
3098	NC_010368	ATC	2	6	125642	125647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237481
3099	NC_010368	CGA	2	6	125665	125670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3100	NC_010368	TGG	2	6	125727	125732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237481
3101	NC_010368	ACGCGA	2	12	125740	125751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3102	NC_010368	ACG	2	6	125753	125758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3103	NC_010368	CGA	2	6	125767	125772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3104	NC_010368	CGC	2	6	125854	125859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237481
3105	NC_010368	CGA	2	6	125869	125874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3106	NC_010368	GCT	2	6	125911	125916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3107	NC_010368	ACG	2	6	125967	125972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237481
3108	NC_010368	CCT	2	6	125992	125997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237481
3109	NC_010368	ACGC	2	8	126057	126064	25 %	0 %	25 %	50 %	169237481
3110	NC_010368	CCT	2	6	126073	126078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237481
3111	NC_010368	CGGCCT	2	12	126112	126123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	169237481
3112	NC_010368	CTA	2	6	126208	126213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_010368	A	6	6	126266	126271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010368	CTC	2	6	126338	126343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237482
3115	NC_010368	AAC	2	6	126386	126391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237482
3116	NC_010368	GA	3	6	126402	126407	50 %	0 %	50 %	0 %	169237482
3117	NC_010368	AGT	2	6	126418	126423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237482
3118	NC_010368	ATC	2	6	126492	126497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237482
3119	NC_010368	TCG	2	6	126561	126566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237482
3120	NC_010368	AGTG	2	8	126620	126627	25 %	25 %	50 %	0 %	169237482
3121	NC_010368	TAA	2	6	126772	126777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169237482
3122	NC_010368	GAG	2	6	126809	126814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237482
3123	NC_010368	GTT	2	6	126815	126820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237482
3124	NC_010368	GAT	2	6	126860	126865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237482
3125	NC_010368	TGCC	2	8	127024	127031	0 %	25 %	25 %	50 %	169237482
3126	NC_010368	ACC	2	6	127067	127072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237482
3127	NC_010368	AG	3	6	127119	127124	50 %	0 %	50 %	0 %	169237482
3128	NC_010368	GAT	2	6	127136	127141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237482
3129	NC_010368	AGTGT	2	10	127206	127215	20 %	40 %	40 %	0 %	169237482
3130	NC_010368	GCG	2	6	127222	127227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237482
3131	NC_010368	GCG	2	6	127276	127281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237482
3132	NC_010368	CGAG	2	8	127324	127331	25 %	0 %	50 %	25 %	169237482
3133	NC_010368	GTC	2	6	127338	127343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237482
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3135	NC_010368	CCG	2	6	127405	127410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237482
3136	NC_010368	ATG	2	6	127437	127442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237482
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3138	NC_010368	ATC	2	6	127671	127676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237482
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3141	NC_010368	ATT	2	6	127768	127773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_010368	TGTT	2	8	127774	127781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_010368	ATT	2	6	127923	127928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_010368	AAT	2	6	127951	127956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_010368	TAT	2	6	127957	127962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_010368	AT	3	6	127968	127973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_010368	CTG	2	6	128001	128006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3148	NC_010368	TCA	2	6	128032	128037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_010368	CAC	2	6	128038	128043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3150	NC_010368	TAC	3	9	128075	128083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3151	NC_010368	CA	3	6	128122	128127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3152	NC_010368	CAA	2	6	128138	128143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_010368	A	6	6	128142	128147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_010368	CCG	2	6	128261	128266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237483
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3159	NC_010368	TCG	2	6	128506	128511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237483
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3203	NC_010368	GCA	2	6	130118	130123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3206	NC_010368	AC	3	6	130206	130211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3211	NC_010368	TCC	2	6	130384	130389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237485
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3221	NC_010368	CGT	2	6	130823	130828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237485
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3226	NC_010368	CGA	2	6	131069	131074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237485
3227	NC_010368	CG	3	6	131115	131120	0 %	0 %	50 %	50 %	169237485
3228	NC_010368	GAGCA	2	10	131161	131170	40 %	0 %	40 %	20 %	169237485
3229	NC_010368	CTG	2	6	131193	131198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237485
3230	NC_010368	GCT	2	6	131228	131233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237485
3231	NC_010368	TCG	2	6	131246	131251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237485
3232	NC_010368	CCT	2	6	131282	131287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237485
3233	NC_010368	GGAGTG	2	12	131292	131303	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	169237485
3234	NC_010368	GAG	2	6	131443	131448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237485
3235	NC_010368	TGCCGT	2	12	131462	131473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237485
3236	NC_010368	TCG	2	6	131482	131487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237485
3237	NC_010368	GCC	2	6	131521	131526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237485
3238	NC_010368	ATG	2	6	131611	131616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237485
3239	NC_010368	AACG	2	8	131619	131626	50 %	0 %	25 %	25 %	169237485
3240	NC_010368	CGG	2	6	131675	131680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237485
3241	NC_010368	ACT	2	6	131724	131729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237485
3242	NC_010368	CGG	2	6	131805	131810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_010368	ACCTC	2	10	131825	131834	20 %	20 %	0 %	60 %	169237486
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3245	NC_010368	CGAT	2	8	131966	131973	25 %	25 %	25 %	25 %	169237486
3246	NC_010368	TCC	2	6	131989	131994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237486
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3262	NC_010368	A	6	6	132912	132917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3282	NC_010368	TAT	2	6	133913	133918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3324	NC_010368	TGC	2	6	135963	135968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3347	NC_010368	GTA	2	6	137145	137150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237490
3348	NC_010368	TG	3	6	137155	137160	0 %	50 %	50 %	0 %	169237490
3349	NC_010368	AG	3	6	137223	137228	50 %	0 %	50 %	0 %	169237490
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3358	NC_010368	CCA	2	6	137491	137496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3359	NC_010368	CAG	2	6	137650	137655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3360	NC_010368	TAA	2	6	137668	137673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_010368	AT	3	6	137685	137690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_010368	AG	3	6	137824	137829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3490	NC_010368	GTT	2	6	143059	143064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_010368	GATA	2	8	143104	143111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_010368	TAT	2	6	143153	143158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_010368	CTT	2	6	143170	143175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_010368	GTAC	2	8	143213	143220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3495	NC_010368	GCTTCA	2	12	143231	143242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3496	NC_010368	ACTGTT	2	12	143277	143288	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3497	NC_010368	ACT	2	6	143436	143441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237494
3498	NC_010368	CGA	2	6	143479	143484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237494
3499	NC_010368	CCA	2	6	143562	143567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237494
3500	NC_010368	ACC	2	6	143655	143660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237494

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