MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS4

Total Repeats: 936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010367	GAC	2	6	22115	22120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237332
502	NC_010367	TC	3	6	22124	22129	0 %	50 %	0 %	50 %	169237332
503	NC_010367	TTG	2	6	22228	22233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237332
504	NC_010367	CCG	2	6	22237	22242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237332
505	NC_010367	CGG	2	6	22268	22273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237332
506	NC_010367	CGC	2	6	22316	22321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237332
507	NC_010367	CA	3	6	22341	22346	50 %	0 %	0 %	50 %	169237332
508	NC_010367	CGG	2	6	22363	22368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237332
509	NC_010367	CGACG	2	10	22373	22382	20 %	0 %	40 %	40 %	169237332
510	NC_010367	CTC	2	6	22431	22436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237332
511	NC_010367	TGG	2	6	22462	22467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237332
512	NC_010367	GGA	2	6	22537	22542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010367	AAAC	2	8	22548	22555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_010367	GCA	2	6	22590	22595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010367	ATG	2	6	22601	22606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010367	TCG	2	6	22627	22632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010367	AG	3	6	22660	22665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010367	AGA	2	6	22674	22679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010367	GCT	2	6	22691	22696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_010367	GTT	2	6	22702	22707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010367	AGC	2	6	22728	22733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010367	TCC	2	6	22737	22742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_010367	GGT	2	6	22757	22762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010367	GAG	2	6	22768	22773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010367	ACT	2	6	22912	22917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237333
526	NC_010367	TCA	2	6	22931	22936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237333
527	NC_010367	GGC	2	6	22939	22944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237333
528	NC_010367	GCC	2	6	23038	23043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237333
529	NC_010367	CGC	2	6	23058	23063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237333
530	NC_010367	CGA	2	6	23090	23095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237333
531	NC_010367	TCTG	2	8	23143	23150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_010367	CCT	2	6	23203	23208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_010367	CTG	2	6	23226	23231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010367	GGGGT	2	10	23249	23258	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010367	TAT	2	6	23302	23307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010367	G	6	6	23356	23361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010367	AT	3	6	23405	23410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010367	TGA	2	6	23536	23541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237334
539	NC_010367	TGA	2	6	23638	23643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237334
540	NC_010367	CGA	2	6	23659	23664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237334
541	NC_010367	CT	3	6	23741	23746	0 %	50 %	0 %	50 %	169237334
542	NC_010367	CTT	2	6	23807	23812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237334
543	NC_010367	AGT	2	6	23820	23825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237334
544	NC_010367	TCG	2	6	23838	23843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237334
545	NC_010367	TGT	2	6	23871	23876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010367	GACG	2	8	23900	23907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
547	NC_010367	AT	3	6	23947	23952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010367	GA	3	6	23956	23961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010367	ACTC	2	8	23970	23977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_010367	GGC	2	6	24003	24008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010367	TG	3	6	24047	24052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010367	CT	3	6	24121	24126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_010367	AAC	2	6	24412	24417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237335
554	NC_010367	AGC	2	6	24542	24547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237335
555	NC_010367	GGA	2	6	24558	24563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237335
556	NC_010367	TTC	2	6	24566	24571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237335
557	NC_010367	TC	3	6	24638	24643	0 %	50 %	0 %	50 %	169237335
558	NC_010367	GCA	2	6	24723	24728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237335
559	NC_010367	CATC	2	8	24738	24745	25 %	25 %	0 %	50 %	169237335
560	NC_010367	CGAG	2	8	24750	24757	25 %	0 %	50 %	25 %	169237335
561	NC_010367	AGT	2	6	24777	24782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237335
562	NC_010367	TTC	2	6	24882	24887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010367	CAA	2	6	24958	24963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_010367	GGC	2	6	25072	25077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_010367	GT	3	6	25096	25101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010367	GT	3	6	25119	25124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010367	ACG	2	6	25198	25203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_010367	GTC	2	6	25211	25216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_010367	CTGG	2	8	25227	25234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
570	NC_010367	AAT	2	6	25238	25243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010367	CCG	2	6	25252	25257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_010367	CT	3	6	25355	25360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_010367	ACG	2	6	25409	25414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010367	GTC	2	6	25427	25432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_010367	CA	3	6	25435	25440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_010367	GCT	2	6	25492	25497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237336
577	NC_010367	GAG	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237336
578	NC_010367	CCG	2	6	25522	25527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237336
579	NC_010367	GTACC	2	10	25679	25688	20 %	20 %	20 %	40 %	169237336
580	NC_010367	CGA	2	6	25694	25699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
581	NC_010367	CCAC	2	8	25708	25715	25 %	0 %	0 %	75 %	169237336
582	NC_010367	CGC	2	6	25730	25735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237336
583	NC_010367	TCA	2	6	25740	25745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237336
584	NC_010367	CGA	2	6	25751	25756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
585	NC_010367	GGT	2	6	25760	25765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237336
586	NC_010367	CGA	2	6	25784	25789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
587	NC_010367	CCG	2	6	25792	25797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237336
588	NC_010367	CTG	2	6	25800	25805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237336
589	NC_010367	CGA	2	6	25822	25827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
590	NC_010367	GCC	2	6	25842	25847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237336
591	NC_010367	TC	3	6	25964	25969	0 %	50 %	0 %	50 %	169237336
592	NC_010367	GAC	2	6	25970	25975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
593	NC_010367	GTC	2	6	25977	25982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237336
594	NC_010367	GCG	2	6	26006	26011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237336
595	NC_010367	CCT	2	6	26024	26029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237336
596	NC_010367	CCT	2	6	26036	26041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237336
597	NC_010367	GCC	2	6	26055	26060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237336
598	NC_010367	CGA	2	6	26099	26104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
599	NC_010367	CTC	2	6	26133	26138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237336
600	NC_010367	CG	3	6	26205	26210	0 %	0 %	50 %	50 %	169237336
601	NC_010367	CGA	3	9	26249	26257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
602	NC_010367	TGA	2	6	26270	26275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237336
603	NC_010367	CTC	3	9	26526	26534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237336
604	NC_010367	GGC	2	6	26557	26562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237336
605	NC_010367	CGC	2	6	26630	26635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237336
606	NC_010367	CG	3	6	26639	26644	0 %	0 %	50 %	50 %	169237336
607	NC_010367	TCC	2	6	26659	26664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237336
608	NC_010367	TC	3	6	26711	26716	0 %	50 %	0 %	50 %	169237336
609	NC_010367	CGA	3	9	26750	26758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
610	NC_010367	GCA	2	6	26776	26781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
611	NC_010367	CGA	2	6	26828	26833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
612	NC_010367	CAC	2	6	26834	26839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237336
613	NC_010367	AG	3	6	26961	26966	50 %	0 %	50 %	0 %	169237336
614	NC_010367	C	6	6	27004	27009	0 %	0 %	0 %	100 %	169237336
615	NC_010367	CGA	2	6	27017	27022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
616	NC_010367	AC	3	6	27082	27087	50 %	0 %	0 %	50 %	169237336
617	NC_010367	GA	3	6	27124	27129	50 %	0 %	50 %	0 %	169237336
618	NC_010367	CCA	3	9	27146	27154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237336
619	NC_010367	G	6	6	27246	27251	0 %	0 %	100 %	0 %	169237336
620	NC_010367	CGT	2	6	27253	27258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237336
621	NC_010367	CGA	3	9	27260	27268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
622	NC_010367	GGT	2	6	27275	27280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237336
623	NC_010367	TTG	2	6	27319	27324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237336
624	NC_010367	CGG	2	6	27335	27340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237336
625	NC_010367	TGC	2	6	27422	27427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237336
626	NC_010367	GAC	2	6	27486	27491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
627	NC_010367	GCT	2	6	27533	27538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237336
628	NC_010367	GAG	2	6	27540	27545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237336
629	NC_010367	CGA	2	6	27557	27562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
630	NC_010367	AGC	2	6	27574	27579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
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632	NC_010367	CGA	2	6	27613	27618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237336
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