MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS1

Total Repeats: 3300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010366	GT	3	6	111434	111439	0 %	50 %	50 %	0 %	169237281
2502	NC_010366	TCG	2	6	111524	111529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237281
2503	NC_010366	CAT	2	6	111591	111596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237281
2504	NC_010366	CT	3	6	111693	111698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_010366	GTGAG	2	10	111773	111782	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_010366	TAC	2	6	111903	111908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_010366	TGA	2	6	112018	112023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237282
2508	NC_010366	CT	3	6	112025	112030	0 %	50 %	0 %	50 %	169237282
2509	NC_010366	CGA	2	6	112108	112113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237282
2510	NC_010366	GGC	2	6	112133	112138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237282
2511	NC_010366	CCG	2	6	112277	112282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237282
2512	NC_010366	GGC	2	6	112320	112325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237282
2513	NC_010366	GCT	2	6	112343	112348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237282
2514	NC_010366	GA	3	6	112420	112425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_010366	ACG	2	6	112489	112494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_010366	GTC	2	6	112502	112507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_010366	CGC	2	6	112539	112544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_010366	CGAACG	2	12	112677	112688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_010366	ACG	2	6	112698	112703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_010366	GTC	2	6	112716	112721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_010366	ACACC	2	10	112758	112767	40 %	0 %	0 %	60 %	169237283
2522	NC_010366	TCG	2	6	112775	112780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2523	NC_010366	GCT	2	6	112781	112786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2524	NC_010366	CGA	2	6	112794	112799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2525	NC_010366	CCG	3	9	112811	112819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2526	NC_010366	ACC	2	6	112852	112857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237283
2527	NC_010366	ACCG	2	8	112894	112901	25 %	0 %	25 %	50 %	169237283
2528	NC_010366	TCG	2	6	112910	112915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2529	NC_010366	GAC	2	6	112984	112989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2530	NC_010366	CT	3	6	113007	113012	0 %	50 %	0 %	50 %	169237283
2531	NC_010366	CGC	2	6	113019	113024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2532	NC_010366	GTC	2	6	113028	113033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2533	NC_010366	CGA	2	6	113040	113045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2534	NC_010366	GGC	2	6	113046	113051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2535	NC_010366	CCG	2	6	113055	113060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2536	NC_010366	GAC	2	6	113074	113079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2537	NC_010366	GCC	2	6	113080	113085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2538	NC_010366	TCCGC	2	10	113090	113099	0 %	20 %	20 %	60 %	169237283
2539	NC_010366	CGA	2	6	113111	113116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2540	NC_010366	TCC	2	6	113119	113124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237283
2541	NC_010366	GGA	2	6	113142	113147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237283
2542	NC_010366	GCC	2	6	113203	113208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2543	NC_010366	TC	3	6	113256	113261	0 %	50 %	0 %	50 %	169237283
2544	NC_010366	GAC	2	6	113262	113267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2545	NC_010366	GCG	2	6	113298	113303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2546	NC_010366	CCT	2	6	113316	113321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237283
2547	NC_010366	GGA	2	6	113322	113327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237283
2548	NC_010366	GCT	2	6	113424	113429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2549	NC_010366	CG	3	6	113497	113502	0 %	0 %	50 %	50 %	169237283
2550	NC_010366	ATG	2	6	113561	113566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237283
2551	NC_010366	CTC	2	6	113650	113655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237283
2552	NC_010366	CG	3	6	113729	113734	0 %	0 %	50 %	50 %	169237283
2553	NC_010366	TC	3	6	113740	113745	0 %	50 %	0 %	50 %	169237283
2554	NC_010366	GC	3	6	113747	113752	0 %	0 %	50 %	50 %	169237283
2555	NC_010366	CTC	2	6	113815	113820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237283
2556	NC_010366	ACC	2	6	113828	113833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237283
2557	NC_010366	GCC	2	6	113846	113851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2558	NC_010366	CCT	2	6	113879	113884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237283
2559	NC_010366	GTG	2	6	114023	114028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237283
2560	NC_010366	GAC	3	9	114040	114048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2561	NC_010366	TC	3	6	114054	114059	0 %	50 %	0 %	50 %	169237283
2562	NC_010366	GCA	2	6	114065	114070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2563	NC_010366	CGA	2	6	114084	114089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2564	NC_010366	CGA	2	6	114117	114122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2565	NC_010366	GTC	2	6	114142	114147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2566	NC_010366	AGTG	2	8	114250	114257	25 %	25 %	50 %	0 %	169237283
2567	NC_010366	CAA	2	6	114271	114276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169237283
2568	NC_010366	CCCG	2	8	114279	114286	0 %	0 %	25 %	75 %	169237283
2569	NC_010366	CCA	2	6	114294	114299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237283
2570	NC_010366	CGA	2	6	114306	114311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2571	NC_010366	GCC	2	6	114322	114327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2572	NC_010366	GA	3	6	114413	114418	50 %	0 %	50 %	0 %	169237283
2573	NC_010366	GGAG	2	8	114465	114472	25 %	0 %	75 %	0 %	169237283
2574	NC_010366	GTCG	2	8	114474	114481	0 %	25 %	50 %	25 %	169237283
2575	NC_010366	CGA	2	6	114507	114512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2576	NC_010366	TGG	2	6	114534	114539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237283
2577	NC_010366	GAC	2	6	114553	114558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2578	NC_010366	GTC	2	6	114565	114570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2579	NC_010366	GTC	2	6	114659	114664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2580	NC_010366	GCA	2	6	114668	114673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2581	NC_010366	GGGC	2	8	114689	114696	0 %	0 %	75 %	25 %	169237283
2582	NC_010366	GC	3	6	114740	114745	0 %	0 %	50 %	50 %	169237283
2583	NC_010366	AGC	2	6	114863	114868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2584	NC_010366	TGT	2	6	114878	114883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169237283
2585	NC_010366	CGA	2	6	114902	114907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2586	NC_010366	CGA	2	6	114911	114916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2587	NC_010366	TGC	2	6	114927	114932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2588	NC_010366	CGA	2	6	114987	114992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2589	NC_010366	TTC	2	6	115018	115023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237283
2590	NC_010366	CGGT	2	8	115024	115031	0 %	25 %	50 %	25 %	169237283
2591	NC_010366	CGC	2	6	115099	115104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2592	NC_010366	GCG	2	6	115119	115124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2593	NC_010366	GC	3	6	115229	115234	0 %	0 %	50 %	50 %	169237283
2594	NC_010366	AGG	2	6	115271	115276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237283
2595	NC_010366	GAG	2	6	115282	115287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237283
2596	NC_010366	CGGAG	2	10	115323	115332	20 %	0 %	60 %	20 %	169237283
2597	NC_010366	ACG	2	6	115333	115338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2598	NC_010366	TCG	2	6	115346	115351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2599	NC_010366	GAA	2	6	115365	115370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169237283
2600	NC_010366	GGC	2	6	115470	115475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2601	NC_010366	TGA	2	6	115587	115592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237283
2602	NC_010366	GTC	2	6	115683	115688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2603	NC_010366	TCG	2	6	115736	115741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2604	NC_010366	GTG	2	6	115782	115787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169237283
2605	NC_010366	ATG	2	6	115829	115834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237283
2606	NC_010366	GA	3	6	115835	115840	50 %	0 %	50 %	0 %	169237283
2607	NC_010366	TGC	2	6	115890	115895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237283
2608	NC_010366	GCG	2	6	115924	115929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2609	NC_010366	GAG	2	6	115963	115968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237283
2610	NC_010366	GAG	2	6	116035	116040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169237283
2611	NC_010366	GCC	2	6	116046	116051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237283
2612	NC_010366	CCA	2	6	116077	116082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169237283
2613	NC_010366	CGG	2	6	116117	116122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169237283
2614	NC_010366	CT	3	6	116172	116177	0 %	50 %	0 %	50 %	169237284
2615	NC_010366	CGA	2	6	116221	116226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237284
2616	NC_010366	TAC	2	6	116268	116273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237284
2617	NC_010366	TG	3	6	116281	116286	0 %	50 %	50 %	0 %	169237284
2618	NC_010366	CTT	2	6	116389	116394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237284
2619	NC_010366	GTCA	2	8	116453	116460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2620	NC_010366	GGA	2	6	116622	116627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_010366	TC	3	6	116669	116674	0 %	50 %	0 %	50 %	169237285
2622	NC_010366	GATATC	2	12	116749	116760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169237285
2623	NC_010366	TAC	2	6	116829	116834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169237285
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2738	NC_010366	CGA	2	6	121748	121753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237287
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2740	NC_010366	CCT	2	6	121814	121819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169237287
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2743	NC_010366	CGA	2	6	121931	121936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237287
2744	NC_010366	TGA	2	6	121939	121944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237287
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2753	NC_010366	ACG	2	6	122212	122217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237287
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2845	NC_010366	CTG	2	6	126847	126852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2847	NC_010366	TAT	2	6	126923	126928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2848	NC_010366	G	6	6	126977	126982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2849	NC_010366	AT	3	6	127026	127031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2850	NC_010366	TGA	2	6	127157	127162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169237291
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2852	NC_010366	CGA	2	6	127280	127285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237291
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2854	NC_010366	CTT	2	6	127428	127433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169237291
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2857	NC_010366	TGT	2	6	127492	127497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2858	NC_010366	GACG	2	8	127521	127528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2859	NC_010366	AT	3	6	127568	127573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2860	NC_010366	GA	3	6	127577	127582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2861	NC_010366	ACTC	2	8	127591	127598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2862	NC_010366	GGC	2	6	127624	127629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2863	NC_010366	TG	3	6	127668	127673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2987	NC_010366	TGA	2	6	132669	132674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2988	NC_010366	GCG	2	6	132700	132705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2989	NC_010366	AAC	2	6	132739	132744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2990	NC_010366	GGC	2	6	132798	132803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2991	NC_010366	CGC	2	6	132828	132833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2992	NC_010366	GTCG	2	8	132860	132867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2993	NC_010366	CTT	2	6	132894	132899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2994	NC_010366	CCCT	2	8	132930	132937	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2995	NC_010366	AAC	2	6	133028	133033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2996	NC_010366	CGC	2	6	133069	133074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237294
2997	NC_010366	GA	3	6	133121	133126	50 %	0 %	50 %	0 %	169237294
2998	NC_010366	GTC	2	6	133190	133195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169237294
2999	NC_010366	GCC	2	6	133213	133218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169237294
3000	NC_010366	CGA	2	6	133287	133292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169237294

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