MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium salinarum R1

Total Repeats: 58651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010364	CCG	2	6	136778	136783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235191
3502	NC_010364	CGA	2	6	136808	136813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235191
3503	NC_010364	GAC	2	6	136863	136868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235191
3504	NC_010364	GAAG	2	8	136928	136935	50 %	0 %	50 %	0 %	169235191
3505	NC_010364	AAC	2	6	136987	136992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_010364	TGG	3	9	137011	137019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_010364	CTC	2	6	137036	137041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235192
3508	NC_010364	CG	4	8	137060	137067	0 %	0 %	50 %	50 %	169235192
3509	NC_010364	CTA	2	6	137071	137076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235192
3510	NC_010364	CGA	2	6	137080	137085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3511	NC_010364	CCG	2	6	137088	137093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235192
3512	NC_010364	TCG	2	6	137094	137099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3513	NC_010364	CCA	2	6	137100	137105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235192
3514	NC_010364	CCGG	2	8	137106	137113	0 %	0 %	50 %	50 %	169235192
3515	NC_010364	CGG	2	6	137157	137162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235192
3516	NC_010364	TCC	2	6	137163	137168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235192
3517	NC_010364	GGC	2	6	137170	137175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235192
3518	NC_010364	GCG	2	6	137187	137192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235192
3519	NC_010364	ACC	2	6	137226	137231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235192
3520	NC_010364	GCC	2	6	137237	137242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235192
3521	NC_010364	CGA	2	6	137299	137304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3522	NC_010364	ACGCCG	2	12	137346	137357	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	169235192
3523	NC_010364	CGA	2	6	137397	137402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3524	NC_010364	TCA	2	6	137409	137414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235192
3525	NC_010364	CGA	2	6	137416	137421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3526	NC_010364	CGC	2	6	137425	137430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235192
3527	NC_010364	GACGCC	2	12	137450	137461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	169235192
3528	NC_010364	CTG	2	6	137462	137467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3529	NC_010364	CGA	2	6	137482	137487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3530	NC_010364	GAC	2	6	137513	137518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3531	NC_010364	CAC	2	6	137545	137550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235192
3532	NC_010364	CACC	2	8	137575	137582	25 %	0 %	0 %	75 %	169235192
3533	NC_010364	GTG	2	6	137591	137596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235192
3534	NC_010364	TGT	3	9	137604	137612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235192
3535	NC_010364	CCAC	2	8	137613	137620	25 %	0 %	0 %	75 %	169235192
3536	NC_010364	GACACC	2	12	137633	137644	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	169235192
3537	NC_010364	CCAC	2	8	137715	137722	25 %	0 %	0 %	75 %	169235192
3538	NC_010364	CGC	2	6	137743	137748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235192
3539	NC_010364	TG	3	6	137790	137795	0 %	50 %	50 %	0 %	169235192
3540	NC_010364	ACG	2	6	137841	137846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3541	NC_010364	CCG	2	6	137883	137888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235192
3542	NC_010364	GC	3	6	137892	137897	0 %	0 %	50 %	50 %	169235192
3543	NC_010364	CGA	2	6	137907	137912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3544	NC_010364	CCGA	2	8	138000	138007	25 %	0 %	25 %	50 %	169235192
3545	NC_010364	CGC	2	6	138013	138018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235192
3546	NC_010364	GCCGC	2	10	138030	138039	0 %	0 %	40 %	60 %	169235192
3547	NC_010364	CGT	2	6	138085	138090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3548	NC_010364	CGA	2	6	138091	138096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3549	NC_010364	ACG	2	6	138105	138110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3550	NC_010364	TCG	2	6	138141	138146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3551	NC_010364	ACCG	2	8	138209	138216	25 %	0 %	25 %	50 %	169235192
3552	NC_010364	GGT	2	6	138250	138255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235192
3553	NC_010364	CGA	2	6	138256	138261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3554	NC_010364	CAT	3	9	138298	138306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235192
3555	NC_010364	CGG	2	6	138310	138315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235192
3556	NC_010364	TCC	2	6	138326	138331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235192
3557	NC_010364	GGA	2	6	138340	138345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169235192
3558	NC_010364	ACG	2	6	138360	138365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3559	NC_010364	CGT	2	6	138382	138387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3560	NC_010364	C	6	6	138393	138398	0 %	0 %	0 %	100 %	169235192
3561	NC_010364	ACG	2	6	138399	138404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3562	NC_010364	TCG	2	6	138429	138434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3563	NC_010364	CAA	2	6	138454	138459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169235192
3564	NC_010364	ACC	2	6	138473	138478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235192
3565	NC_010364	TCG	2	6	138483	138488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3566	NC_010364	CGT	2	6	138510	138515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3567	NC_010364	GCG	2	6	138526	138531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235192
3568	NC_010364	TCG	2	6	138540	138545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3569	NC_010364	CAC	2	6	138556	138561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235192
3570	NC_010364	CGA	2	6	138610	138615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235192
3571	NC_010364	CGG	3	9	138643	138651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_010364	TCC	2	6	138660	138665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235193
3573	NC_010364	AGC	2	6	138696	138701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3575	NC_010364	GTC	2	6	138767	138772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3576	NC_010364	CGT	2	6	138781	138786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3577	NC_010364	CGT	2	6	138793	138798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3578	NC_010364	CGA	2	6	138799	138804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3580	NC_010364	GCCG	2	8	138845	138852	0 %	0 %	50 %	50 %	169235193
3581	NC_010364	TCC	2	6	138876	138881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235193
3582	NC_010364	CGC	2	6	138898	138903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235193
3583	NC_010364	GC	4	8	138902	138909	0 %	0 %	50 %	50 %	169235193
3584	NC_010364	TCGG	2	8	138965	138972	0 %	25 %	50 %	25 %	169235193
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3588	NC_010364	GTGG	2	8	139088	139095	0 %	25 %	75 %	0 %	169235193
3589	NC_010364	GTG	2	6	139104	139109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235193
3590	NC_010364	GC	3	6	139110	139115	0 %	0 %	50 %	50 %	169235193
3591	NC_010364	CGC	2	6	139139	139144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235193
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3594	NC_010364	TGG	2	6	139216	139221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235193
3595	NC_010364	CCGC	2	8	139271	139278	0 %	0 %	25 %	75 %	169235193
3596	NC_010364	CAGC	2	8	139279	139286	25 %	0 %	25 %	50 %	169235193
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3601	NC_010364	CCG	2	6	139345	139350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235193
3602	NC_010364	GAC	2	6	139436	139441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3604	NC_010364	ACGA	2	8	139482	139489	50 %	0 %	25 %	25 %	169235193
3605	NC_010364	CGT	2	6	139490	139495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3611	NC_010364	GCA	2	6	139639	139644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3613	NC_010364	CG	3	6	139649	139654	0 %	0 %	50 %	50 %	169235193
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3615	NC_010364	CG	3	6	139703	139708	0 %	0 %	50 %	50 %	169235193
3616	NC_010364	TTC	2	6	139776	139781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169235193
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3619	NC_010364	TCG	2	6	139953	139958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3621	NC_010364	AGC	2	6	139968	139973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3622	NC_010364	TCG	2	6	139974	139979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3623	NC_010364	TCG	2	6	139986	139991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3624	NC_010364	GCC	2	6	140009	140014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235193
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3626	NC_010364	GTC	2	6	140139	140144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3630	NC_010364	GGC	2	6	140225	140230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235193
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3632	NC_010364	GCG	2	6	140298	140303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235193
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3634	NC_010364	CGG	2	6	140331	140336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235193
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3642	NC_010364	GTC	2	6	140484	140489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3644	NC_010364	TCG	2	6	140556	140561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3650	NC_010364	CGCC	2	8	140675	140682	0 %	0 %	25 %	75 %	169235193
3651	NC_010364	CGT	2	6	140701	140706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3652	NC_010364	CAGCGT	2	12	140708	140719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3653	NC_010364	GTC	3	9	140753	140761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3654	NC_010364	CG	3	6	140828	140833	0 %	0 %	50 %	50 %	169235193
3655	NC_010364	GTC	2	6	140865	140870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3659	NC_010364	CAG	2	6	140954	140959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235193
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3666	NC_010364	CCG	2	6	141175	141180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235193
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3669	NC_010364	CAG	2	6	141215	141220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235193
3670	NC_010364	CAGCCA	2	12	141306	141317	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3671	NC_010364	CGC	2	6	141337	141342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3672	NC_010364	CGT	2	6	141348	141353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235194
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3674	NC_010364	GGCC	2	8	141382	141389	0 %	0 %	50 %	50 %	169235194
3675	NC_010364	CGC	2	6	141438	141443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235194
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3682	NC_010364	CG	3	6	141629	141634	0 %	0 %	50 %	50 %	169235194
3683	NC_010364	GCC	2	6	141659	141664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235194
3684	NC_010364	CGT	2	6	141702	141707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235194
3685	NC_010364	CGCC	2	8	141723	141730	0 %	0 %	25 %	75 %	169235194
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3687	NC_010364	TCG	2	6	141738	141743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235194
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3696	NC_010364	ACCG	2	8	141931	141938	25 %	0 %	25 %	50 %	169235194
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3699	NC_010364	GTC	2	6	142001	142006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235194
3700	NC_010364	GC	5	10	142020	142029	0 %	0 %	50 %	50 %	169235194
3701	NC_010364	TCAC	2	8	142139	142146	25 %	25 %	0 %	50 %	169235194
3702	NC_010364	CGC	2	6	142168	142173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235194
3703	NC_010364	GC	3	6	142172	142177	0 %	0 %	50 %	50 %	169235194
3704	NC_010364	TCGCCA	2	12	142215	142226	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	169235194
3705	NC_010364	ACC	2	6	142247	142252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235194
3706	NC_010364	CGT	2	6	142287	142292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235194
3707	NC_010364	GTC	2	6	142324	142329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235194
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3710	NC_010364	GCGCC	2	10	142375	142384	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3711	NC_010364	CAG	3	9	142512	142520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
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3713	NC_010364	CG	3	6	142580	142585	0 %	0 %	50 %	50 %	169235195
3714	NC_010364	TCG	3	9	142645	142653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235195
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3718	NC_010364	CAG	2	6	142782	142787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
3719	NC_010364	ACG	2	6	142810	142815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
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3721	NC_010364	CGG	2	6	142880	142885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235195
3722	NC_010364	CG	3	6	142886	142891	0 %	0 %	50 %	50 %	169235195
3723	NC_010364	CTC	2	6	142908	142913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235195
3724	NC_010364	GCG	2	6	142930	142935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235195
3725	NC_010364	TCCG	2	8	142958	142965	0 %	25 %	25 %	50 %	169235195
3726	NC_010364	ACG	2	6	143041	143046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
3727	NC_010364	CGA	2	6	143060	143065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
3728	NC_010364	GC	3	6	143084	143089	0 %	0 %	50 %	50 %	169235195
3729	NC_010364	CGA	2	6	143183	143188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
3730	NC_010364	CGA	2	6	143204	143209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
3731	NC_010364	CGC	2	6	143219	143224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235195
3732	NC_010364	CGA	2	6	143225	143230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
3733	NC_010364	CGA	6	18	143234	143251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235195
3734	NC_010364	CGT	2	6	143262	143267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3735	NC_010364	GCA	2	6	143272	143277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3736	NC_010364	CCG	2	6	143341	143346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235196
3737	NC_010364	CGA	2	6	143368	143373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235196
3738	NC_010364	CGC	2	6	143380	143385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235196
3739	NC_010364	GTT	2	6	143413	143418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169235196
3740	NC_010364	ACC	2	6	143423	143428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169235196
3741	NC_010364	CGT	2	6	143458	143463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235196
3742	NC_010364	GGT	2	6	143494	143499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169235196
3743	NC_010364	CGA	2	6	143515	143520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235196
3744	NC_010364	TCG	2	6	143529	143534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235196
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3965	NC_010364	CGTCGG	2	12	150022	150033	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	169235201
3966	NC_010364	GCG	2	6	150106	150111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235201
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3969	NC_010364	CGGCG	2	10	150181	150190	0 %	0 %	60 %	40 %	169235201
3970	NC_010364	GCGT	2	8	150191	150198	0 %	25 %	50 %	25 %	169235201
3971	NC_010364	CGTC	2	8	150252	150259	0 %	25 %	25 %	50 %	169235201
3972	NC_010364	TGC	2	6	150267	150272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235201
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3978	NC_010364	TCG	2	6	150375	150380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235201
3979	NC_010364	TCG	2	6	150401	150406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235201
3980	NC_010364	CGGACA	2	12	150408	150419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169235201
3981	NC_010364	CGT	2	6	150436	150441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235201
3982	NC_010364	CCT	2	6	150475	150480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169235201
3983	NC_010364	GGC	2	6	150487	150492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169235201
3984	NC_010364	GC	3	6	150498	150503	0 %	0 %	50 %	50 %	169235201
3985	NC_010364	GCT	2	6	150622	150627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235201
3986	NC_010364	CGC	2	6	150631	150636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235201
3987	NC_010364	GCC	3	9	150644	150652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235201
3988	NC_010364	CG	3	6	150675	150680	0 %	0 %	50 %	50 %	169235201
3989	NC_010364	GCCA	2	8	150686	150693	25 %	0 %	25 %	50 %	169235201
3990	NC_010364	GCC	2	6	150704	150709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235201
3991	NC_010364	GCC	2	6	150734	150739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235201
3992	NC_010364	G	7	7	150759	150765	0 %	0 %	100 %	0 %	169235201
3993	NC_010364	CGC	2	6	150773	150778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235201
3994	NC_010364	GCCG	2	8	150853	150860	0 %	0 %	50 %	50 %	169235201
3995	NC_010364	CCG	3	9	150858	150866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235201
3996	NC_010364	CAT	2	6	150880	150885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169235201
3997	NC_010364	CG	3	6	150922	150927	0 %	0 %	50 %	50 %	169235201
3998	NC_010364	CG	3	6	150929	150934	0 %	0 %	50 %	50 %	169235201
3999	NC_010364	TCG	2	6	150942	150947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169235201
4000	NC_010364	CCG	2	6	150948	150953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169235201

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