MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 2024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009974	CCCAT	2	10	48908	48917	20 %	20 %	0 %	60 %	159901778
1002	NC_009974	CCATA	2	10	49008	49017	40 %	20 %	0 %	40 %	159901778
1003	NC_009974	TGC	3	9	49046	49054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1004	NC_009974	CAC	2	6	49091	49096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901778
1005	NC_009974	TGC	3	9	49166	49174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1006	NC_009974	TAA	2	6	49228	49233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901778
1007	NC_009974	TTA	2	6	49351	49356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901778
1008	NC_009974	CTG	2	6	49366	49371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1009	NC_009974	CCAC	2	8	49372	49379	25 %	0 %	0 %	75 %	159901778
1010	NC_009974	AGA	2	6	49453	49458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901778
1011	NC_009974	TGA	2	6	49538	49543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901778
1012	NC_009974	CT	3	6	49564	49569	0 %	50 %	0 %	50 %	159901778
1013	NC_009974	TTA	2	6	49570	49575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901778
1014	NC_009974	CTG	2	6	49585	49590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1015	NC_009974	TGC	3	9	49703	49711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1016	NC_009974	TGA	2	6	49757	49762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901778
1017	NC_009974	CCCAT	2	10	49763	49772	20 %	20 %	0 %	60 %	159901778
1018	NC_009974	TGC	3	9	49802	49810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1019	NC_009974	TGA	2	6	49856	49861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901778
1020	NC_009974	CCATA	2	10	49863	49872	40 %	20 %	0 %	40 %	159901778
1021	NC_009974	TGC	2	6	49901	49906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1022	NC_009974	CAC	2	6	49946	49951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901778
1023	NC_009974	TGA	2	6	49976	49981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901778
1024	NC_009974	GCT	2	6	50022	50027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1025	NC_009974	TGA	2	6	50096	50101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901778
1026	NC_009974	GCT	2	6	50142	50147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1027	NC_009974	CCCAT	2	10	50222	50231	20 %	20 %	0 %	60 %	159901778
1028	NC_009974	TGC	2	6	50261	50266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1029	NC_009974	CCATA	2	10	50319	50328	40 %	20 %	0 %	40 %	159901778
1030	NC_009974	TGC	3	9	50357	50365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1031	NC_009974	CAC	2	6	50402	50407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901778
1032	NC_009974	CCCAT	2	10	50438	50447	20 %	20 %	0 %	60 %	159901778
1033	NC_009974	TGC	3	9	50477	50485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901778
1034	NC_009974	TGA	2	6	50531	50536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901778
1035	NC_009974	ACC	2	6	50641	50646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901778
1036	NC_009974	CAT	2	6	50663	50668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901778
1037	NC_009974	ATT	2	6	50777	50782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901778
1038	NC_009974	GAA	2	6	50817	50822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901778
1039	NC_009974	GAAC	2	8	50834	50841	50 %	0 %	25 %	25 %	159901778
1040	NC_009974	GTCAT	2	10	50878	50887	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1041	NC_009974	TCA	2	6	50956	50961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_009974	GCCACC	2	12	51015	51026	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_009974	GCG	2	6	51064	51069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901779
1044	NC_009974	TGG	2	6	51082	51087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901779
1045	NC_009974	GTTG	2	8	51140	51147	0 %	50 %	50 %	0 %	159901779
1046	NC_009974	GTG	2	6	51192	51197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901779
1047	NC_009974	TGGA	2	8	51293	51300	25 %	25 %	50 %	0 %	159901779
1048	NC_009974	AGACCG	2	12	51339	51350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901779
1049	NC_009974	CGA	2	6	51493	51498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901779
1050	NC_009974	ATT	2	6	51542	51547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901779
1051	NC_009974	AGTC	2	8	51577	51584	25 %	25 %	25 %	25 %	159901779
1052	NC_009974	CGT	2	6	51623	51628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901779
1053	NC_009974	TGG	2	6	51714	51719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901779
1054	NC_009974	CCT	2	6	51764	51769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901779
1055	NC_009974	GCG	2	6	51805	51810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901779
1056	NC_009974	CGC	2	6	51818	51823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901779
1057	NC_009974	CTG	2	6	51838	51843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901779
1058	NC_009974	AGC	2	6	51852	51857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901779
1059	NC_009974	ACCA	2	8	51869	51876	50 %	0 %	0 %	50 %	159901779
1060	NC_009974	ATCC	2	8	51941	51948	25 %	25 %	0 %	50 %	159901779
1061	NC_009974	CA	3	6	51961	51966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_009974	GCA	2	6	51968	51973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_009974	CGC	2	6	51974	51979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_009974	TGA	2	6	51989	51994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009974	CAT	2	6	52004	52009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_009974	CCG	2	6	52039	52044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_009974	TGAT	2	8	52087	52094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009974	CAAT	2	8	52103	52110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_009974	CA	3	6	52121	52126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_009974	CGC	2	6	52128	52133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_009974	TCG	2	6	52137	52142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_009974	CCG	2	6	52164	52169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_009974	GCGCTC	2	12	52181	52192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_009974	GCC	2	6	52256	52261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_009974	GCA	2	6	52267	52272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_009974	TGA	2	6	52288	52293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009974	TAT	2	6	52320	52325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_009974	CGG	2	6	52419	52424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901780
1079	NC_009974	GGT	2	6	52428	52433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901780
1080	NC_009974	GAAC	2	8	52439	52446	50 %	0 %	25 %	25 %	159901780
1081	NC_009974	ACG	2	6	52460	52465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901780
1082	NC_009974	ATT	2	6	52466	52471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901780
1083	NC_009974	GAC	2	6	52480	52485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901780
1084	NC_009974	C	6	6	52574	52579	0 %	0 %	0 %	100 %	159901780
1085	NC_009974	ACGA	2	8	52585	52592	50 %	0 %	25 %	25 %	159901780
1086	NC_009974	GATT	2	8	52645	52652	25 %	50 %	25 %	0 %	159901780
1087	NC_009974	CCG	2	6	52659	52664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901780
1088	NC_009974	TGA	3	9	52678	52686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901780
1089	NC_009974	GTC	2	6	52705	52710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901780
1090	NC_009974	GGT	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901780
1091	NC_009974	ACC	2	6	52761	52766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901780
1092	NC_009974	GT	3	6	52784	52789	0 %	50 %	50 %	0 %	159901780
1093	NC_009974	TGG	2	6	52845	52850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901780
1094	NC_009974	TCA	2	6	52891	52896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901780
1095	NC_009974	TG	3	6	52916	52921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009974	AGG	2	6	52923	52928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009974	CTTG	2	8	53021	53028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_009974	GT	3	6	53109	53114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009974	AGC	2	6	53121	53126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_009974	TGG	2	6	53183	53188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009974	CGT	2	6	53275	53280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_009974	CTT	2	6	53350	53355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_009974	ATT	2	6	53459	53464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009974	GATG	2	8	53517	53524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009974	A	7	7	53612	53618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009974	ACT	2	6	53684	53689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009974	TCG	2	6	53706	53711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_009974	TAC	2	6	53721	53726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009974	ATT	2	6	53735	53740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009974	TCC	2	6	53829	53834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_009974	TAC	2	6	53839	53844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009974	GCAT	2	8	53957	53964	25 %	25 %	25 %	25 %	159901781
1113	NC_009974	GATC	2	8	53995	54002	25 %	25 %	25 %	25 %	159901781
1114	NC_009974	TGG	2	6	54055	54060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901781
1115	NC_009974	ATT	2	6	54153	54158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901781
1116	NC_009974	ATT	2	6	54210	54215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901781
1117	NC_009974	TTG	2	6	54218	54223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901781
1118	NC_009974	CTC	2	6	54326	54331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901781
1119	NC_009974	CTG	2	6	54347	54352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901781
1120	NC_009974	GCT	2	6	54553	54558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901781
1121	NC_009974	GAT	2	6	54639	54644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901781
1122	NC_009974	CAA	2	6	54647	54652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901781
1123	NC_009974	GCA	4	12	54670	54681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901781
1124	NC_009974	TGC	2	6	54793	54798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901781
1125	NC_009974	ATT	2	6	54840	54845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901781
1126	NC_009974	GAT	2	6	54866	54871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901781
1127	NC_009974	TTCG	2	8	54905	54912	0 %	50 %	25 %	25 %	159901781
1128	NC_009974	C	6	6	54978	54983	0 %	0 %	0 %	100 %	159901781
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