MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 2024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009974	ATCC	2	8	22289	22296	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_009974	CGA	2	6	22301	22306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_009974	GCA	2	6	22307	22312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_009974	TGG	2	6	22340	22345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009974	TGG	2	6	22412	22417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901762
506	NC_009974	CGGCG	2	10	22423	22432	0 %	0 %	60 %	40 %	159901762
507	NC_009974	GTC	2	6	22461	22466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901762
508	NC_009974	TCG	2	6	22562	22567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901762
509	NC_009974	GGT	2	6	22583	22588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901762
510	NC_009974	TGC	2	6	22612	22617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901762
511	NC_009974	GCCAA	2	10	22648	22657	40 %	0 %	20 %	40 %	159901762
512	NC_009974	GCG	2	6	22677	22682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901762
513	NC_009974	AGC	2	6	22747	22752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901762
514	NC_009974	CTC	2	6	22917	22922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901762
515	NC_009974	GTC	2	6	22957	22962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901762
516	NC_009974	CTG	2	6	23004	23009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901762
517	NC_009974	AC	3	6	23025	23030	50 %	0 %	0 %	50 %	159901762
518	NC_009974	AC	3	6	23054	23059	50 %	0 %	0 %	50 %	159901762
519	NC_009974	CAT	2	6	23108	23113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901762
520	NC_009974	GTG	2	6	23134	23139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901762
521	NC_009974	GCC	2	6	23214	23219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901762
522	NC_009974	GCA	2	6	23281	23286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901762
523	NC_009974	GCAT	2	8	23419	23426	25 %	25 %	25 %	25 %	159901762
524	NC_009974	CAA	2	6	23439	23444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901762
525	NC_009974	GCG	2	6	23460	23465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901762
526	NC_009974	GCT	2	6	23471	23476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901762
527	NC_009974	CGGCG	2	10	23506	23515	0 %	0 %	60 %	40 %	159901762
528	NC_009974	CCT	2	6	23546	23551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901762
529	NC_009974	T	6	6	23616	23621	0 %	100 %	0 %	0 %	159901762
530	NC_009974	TGGCG	2	10	23651	23660	0 %	20 %	60 %	20 %	159901762
531	NC_009974	CCG	2	6	23700	23705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901762
532	NC_009974	GTG	2	6	23707	23712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901762
533	NC_009974	GCC	2	6	23765	23770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901762
534	NC_009974	GCG	2	6	23816	23821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901762
535	NC_009974	TTC	2	6	23859	23864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901762
536	NC_009974	GAT	2	6	23942	23947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901762
537	NC_009974	TGA	2	6	23951	23956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901762
538	NC_009974	CGG	2	6	23969	23974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901762
539	NC_009974	GTT	2	6	24071	24076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901762
540	NC_009974	TCCTA	2	10	24145	24154	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
541	NC_009974	A	6	6	24202	24207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009974	CCA	2	6	24230	24235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_009974	A	6	6	24282	24287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009974	GCAG	2	8	24301	24308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_009974	ACC	2	6	24371	24376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_009974	TCG	2	6	24436	24441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_009974	CAG	2	6	24450	24455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009974	CCA	2	6	24464	24469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_009974	AACG	2	8	24502	24509	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_009974	CT	3	6	24526	24531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_009974	CGG	2	6	24552	24557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901763
552	NC_009974	CAGC	2	8	24591	24598	25 %	0 %	25 %	50 %	159901763
553	NC_009974	CAGG	2	8	24710	24717	25 %	0 %	50 %	25 %	159901763
554	NC_009974	CCT	2	6	24735	24740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901763
555	NC_009974	GGTGG	2	10	24761	24770	0 %	20 %	80 %	0 %	159901763
556	NC_009974	CG	3	6	24805	24810	0 %	0 %	50 %	50 %	159901763
557	NC_009974	ATC	2	6	24856	24861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901763
558	NC_009974	TCG	2	6	24870	24875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901763
559	NC_009974	GCG	2	6	24876	24881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901763
560	NC_009974	CTC	2	6	24882	24887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901763
561	NC_009974	TTG	2	6	24890	24895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901763
562	NC_009974	GCCA	2	8	24906	24913	25 %	0 %	25 %	50 %	159901763
563	NC_009974	GCG	4	12	25108	25119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901763
564	NC_009974	TCG	2	6	25154	25159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901763
565	NC_009974	CCA	2	6	25205	25210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901763
566	NC_009974	ACC	2	6	25295	25300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901763
567	NC_009974	CTTT	2	8	25304	25311	0 %	75 %	0 %	25 %	159901763
568	NC_009974	CCG	2	6	25317	25322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901763
569	NC_009974	CCTG	2	8	25349	25356	0 %	25 %	25 %	50 %	159901763
570	NC_009974	A	8	8	25417	25424	100 %	0 %	0 %	0 %	159901763
571	NC_009974	GCT	2	6	25443	25448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901763
572	NC_009974	GTC	2	6	25535	25540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901763
573	NC_009974	GCG	2	6	25611	25616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901763
574	NC_009974	GCAC	2	8	25664	25671	25 %	0 %	25 %	50 %	159901763
575	NC_009974	AAT	2	6	25711	25716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901763
576	NC_009974	GTC	2	6	25729	25734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901763
577	NC_009974	CACCG	2	10	25751	25760	20 %	0 %	20 %	60 %	159901763
578	NC_009974	CGC	2	6	25769	25774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901763
579	NC_009974	CCA	3	9	25883	25891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901763
580	NC_009974	CGAT	2	8	25898	25905	25 %	25 %	25 %	25 %	159901763
581	NC_009974	GGC	2	6	25906	25911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901763
582	NC_009974	GGT	2	6	25981	25986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901763
583	NC_009974	AGGA	2	8	26064	26071	50 %	0 %	50 %	0 %	159901763
584	NC_009974	GCG	2	6	26109	26114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901763
585	NC_009974	TGGG	2	8	26140	26147	0 %	25 %	75 %	0 %	159901763
586	NC_009974	GGT	2	6	26219	26224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009974	TTCT	2	8	26297	26304	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_009974	T	7	7	26304	26310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009974	T	7	7	26317	26323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009974	ACG	2	6	26351	26356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_009974	GGT	2	6	26364	26369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009974	AC	3	6	26418	26423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_009974	TAC	2	6	26439	26444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_009974	GCAA	2	8	26461	26468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_009974	ATC	2	6	26634	26639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_009974	ATTG	2	8	26640	26647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009974	TCA	2	6	26668	26673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_009974	GCC	2	6	26778	26783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_009974	CT	4	8	26804	26811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_009974	TGT	2	6	26812	26817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009974	ACT	2	6	26831	26836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_009974	AAG	2	6	26861	26866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009974	ATA	2	6	26958	26963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009974	AT	4	8	27000	27007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009974	TAC	2	6	27038	27043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_009974	ATG	2	6	27053	27058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009974	GAT	2	6	27069	27074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009974	CCG	2	6	27170	27175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_009974	AGT	2	6	27250	27255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009974	T	6	6	27371	27376	0 %	100 %	0 %	0 %	159901764
611	NC_009974	CTTT	2	8	27390	27397	0 %	75 %	0 %	25 %	159901764
612	NC_009974	GCA	2	6	27410	27415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901764
613	NC_009974	A	6	6	27418	27423	100 %	0 %	0 %	0 %	159901764
614	NC_009974	GAT	2	6	27566	27571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901764
615	NC_009974	AGA	2	6	27577	27582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901764
616	NC_009974	GAA	2	6	27672	27677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009974	ATA	2	6	27687	27692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009974	TTA	2	6	27730	27735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009974	CTAT	2	8	27766	27773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_009974	TCC	2	6	27791	27796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_009974	GT	3	6	27882	27887	0 %	50 %	50 %	0 %	159901765
622	NC_009974	TTA	2	6	27952	27957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901765
623	NC_009974	GT	3	6	28057	28062	0 %	50 %	50 %	0 %	159901765
624	NC_009974	CCCT	2	8	28096	28103	0 %	25 %	0 %	75 %	159901765
625	NC_009974	TGA	2	6	28143	28148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901766
626	NC_009974	TTC	2	6	28194	28199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901766
627	NC_009974	GCG	2	6	28231	28236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901766
628	NC_009974	TTA	2	6	28272	28277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901766
629	NC_009974	TTG	2	6	28304	28309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901766
630	NC_009974	TGG	2	6	28346	28351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901766
631	NC_009974	ATTGG	2	10	28356	28365	20 %	40 %	40 %	0 %	159901766
632	NC_009974	T	6	6	28392	28397	0 %	100 %	0 %	0 %	159901766
633	NC_009974	CAA	2	6	28423	28428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901766
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751	NC_009974	ACC	2	6	36544	36549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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757	NC_009974	CAA	2	6	36755	36760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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