MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009973	CAAC	2	8	169837	169844	50 %	0 %	0 %	50 %	159901634
3502	NC_009973	ATC	2	6	169872	169877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901634
3503	NC_009973	CGG	2	6	169879	169884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901634
3504	NC_009973	CTG	2	6	169896	169901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901634
3505	NC_009973	CTC	2	6	169908	169913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901634
3506	NC_009973	ACA	2	6	169916	169921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901634
3507	NC_009973	AAGC	2	8	169995	170002	50 %	0 %	25 %	25 %	159901634
3508	NC_009973	GCC	2	6	170038	170043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901634
3509	NC_009973	TCGT	2	8	170053	170060	0 %	50 %	25 %	25 %	159901634
3510	NC_009973	T	6	6	170196	170201	0 %	100 %	0 %	0 %	159901634
3511	NC_009973	TCA	2	6	170215	170220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901634
3512	NC_009973	GAT	2	6	170346	170351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901634
3513	NC_009973	GCC	2	6	170517	170522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901634
3514	NC_009973	GCA	2	6	170645	170650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901634
3515	NC_009973	GGA	2	6	170673	170678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901634
3516	NC_009973	AGC	2	6	170752	170757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901634
3517	NC_009973	GT	3	6	170758	170763	0 %	50 %	50 %	0 %	159901634
3518	NC_009973	CA	3	6	170798	170803	50 %	0 %	0 %	50 %	159901634
3519	NC_009973	GCA	2	6	170813	170818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901634
3520	NC_009973	TGGCA	2	10	170829	170838	20 %	20 %	40 %	20 %	159901634
3521	NC_009973	CCA	2	6	170861	170866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901634
3522	NC_009973	CGC	2	6	170881	170886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901634
3523	NC_009973	TG	3	6	170914	170919	0 %	50 %	50 %	0 %	159901634
3524	NC_009973	TGG	2	6	170944	170949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901634
3525	NC_009973	ATG	2	6	170991	170996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901634
3526	NC_009973	CA	3	6	171029	171034	50 %	0 %	0 %	50 %	159901634
3527	NC_009973	GGT	2	6	171047	171052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901634
3528	NC_009973	TGAT	2	8	171102	171109	25 %	50 %	25 %	0 %	159901634
3529	NC_009973	TCT	2	6	171205	171210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901634
3530	NC_009973	CAT	2	6	171255	171260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901634
3531	NC_009973	TGA	2	6	171297	171302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901634
3532	NC_009973	CTT	2	6	171380	171385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901634
3533	NC_009973	TGG	2	6	171387	171392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901634
3534	NC_009973	ACA	2	6	171427	171432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901634
3535	NC_009973	CTT	2	6	171498	171503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_009973	CGTG	2	8	171505	171512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_009973	GAT	2	6	171539	171544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_009973	CTG	2	6	171560	171565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_009973	CGA	2	6	171586	171591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_009973	A	6	6	171687	171692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_009973	CTT	2	6	171753	171758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_009973	GTGA	2	8	171760	171767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_009973	TCA	2	6	171790	171795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_009973	CAC	2	6	171888	171893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901635
3545	NC_009973	ATG	2	6	171925	171930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901635
3546	NC_009973	TTG	2	6	172087	172092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901635
3547	NC_009973	CTA	2	6	172094	172099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901635
3548	NC_009973	GAG	2	6	172122	172127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901635
3549	NC_009973	TGC	2	6	172144	172149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901635
3550	NC_009973	ATG	2	6	172153	172158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901635
3551	NC_009973	TC	3	6	172178	172183	0 %	50 %	0 %	50 %	159901635
3552	NC_009973	CCT	2	6	172229	172234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901635
3553	NC_009973	TTG	2	6	172247	172252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901635
3554	NC_009973	CGC	2	6	172331	172336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901635
3555	NC_009973	CAG	2	6	172341	172346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901635
3556	NC_009973	TGTCC	2	10	172361	172370	0 %	40 %	20 %	40 %	159901635
3557	NC_009973	AAC	2	6	172384	172389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901635
3558	NC_009973	ACC	2	6	172428	172433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901635
3559	NC_009973	GGCA	2	8	172457	172464	25 %	0 %	50 %	25 %	159901635
3560	NC_009973	GTC	2	6	172516	172521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901635
3561	NC_009973	GCA	2	6	172526	172531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901635
3562	NC_009973	GCA	2	6	172533	172538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901635
3563	NC_009973	TTC	2	6	172566	172571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901635
3564	NC_009973	GGC	2	6	172574	172579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901635
3565	NC_009973	GTG	3	9	172609	172617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901635
3566	NC_009973	CAG	2	6	172650	172655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901635
3567	NC_009973	CGC	2	6	172664	172669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901635
3568	NC_009973	GCC	2	6	172674	172679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901635
3569	NC_009973	CCA	2	6	172686	172691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901635
3570	NC_009973	CGT	2	6	172736	172741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901635
3571	NC_009973	CCA	2	6	172795	172800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901635
3572	NC_009973	GATCG	2	10	172845	172854	20 %	20 %	40 %	20 %	159901635
3573	NC_009973	ATG	2	6	172873	172878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901635
3574	NC_009973	CAT	2	6	172940	172945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901635
3575	NC_009973	AGC	2	6	172964	172969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901635
3576	NC_009973	ATG	2	6	173007	173012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901635
3577	NC_009973	ATC	2	6	173037	173042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901635
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3579	NC_009973	CCAG	2	8	173215	173222	25 %	0 %	25 %	50 %	159901635
3580	NC_009973	CA	3	6	173254	173259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_009973	CAG	2	6	173297	173302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_009973	ACACC	2	10	173339	173348	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3583	NC_009973	GAT	2	6	173375	173380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901636
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3585	NC_009973	CG	3	6	173441	173446	0 %	0 %	50 %	50 %	159901636
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3588	NC_009973	G	6	6	173647	173652	0 %	0 %	100 %	0 %	159901636
3589	NC_009973	TCGC	2	8	173678	173685	0 %	25 %	25 %	50 %	159901636
3590	NC_009973	CGC	2	6	173699	173704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901636
3591	NC_009973	CAA	2	6	173867	173872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901636
3592	NC_009973	CTG	2	6	173888	173893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901636
3593	NC_009973	TTG	2	6	173913	173918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901636
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3595	NC_009973	GGC	2	6	173975	173980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901636
3596	NC_009973	AATCA	2	10	173989	173998	60 %	20 %	0 %	20 %	159901636
3597	NC_009973	AGC	2	6	174017	174022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901636
3598	NC_009973	CG	3	6	174119	174124	0 %	0 %	50 %	50 %	159901636
3599	NC_009973	GTG	2	6	174125	174130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901636
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3601	NC_009973	GATC	2	8	174301	174308	25 %	25 %	25 %	25 %	159901636
3602	NC_009973	GCC	2	6	174328	174333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901636
3603	NC_009973	ACC	2	6	174418	174423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901636
3604	NC_009973	CAGTC	2	10	174459	174468	20 %	20 %	20 %	40 %	159901636
3605	NC_009973	TTGT	2	8	174524	174531	0 %	75 %	25 %	0 %	159901636
3606	NC_009973	GCG	2	6	174539	174544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901636
3607	NC_009973	GATAC	2	10	174545	174554	40 %	20 %	20 %	20 %	159901636
3608	NC_009973	CAAT	2	8	174556	174563	50 %	25 %	0 %	25 %	159901636
3609	NC_009973	GTC	2	6	174701	174706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901636
3610	NC_009973	CAT	2	6	174833	174838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901636
3611	NC_009973	CTG	2	6	174839	174844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901636
3612	NC_009973	ACAT	2	8	174894	174901	50 %	25 %	0 %	25 %	159901636
3613	NC_009973	ATC	2	6	174951	174956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901636
3614	NC_009973	GAA	2	6	175166	175171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901636
3615	NC_009973	AC	3	6	175286	175291	50 %	0 %	0 %	50 %	159901636
3616	NC_009973	TTC	2	6	175356	175361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901636
3617	NC_009973	ACA	3	9	175375	175383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901636
3618	NC_009973	CAT	2	6	175474	175479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901636
3619	NC_009973	TGCT	2	8	175599	175606	0 %	50 %	25 %	25 %	159901636
3620	NC_009973	GCA	2	6	175703	175708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901636
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3622	NC_009973	GAC	2	6	175773	175778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901636
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3997	NC_009973	ACCTTT	2	12	193382	193393	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_009973	T	7	7	193418	193424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_009973	T	6	6	193441	193446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_009973	GTC	2	6	193539	193544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901652

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