MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009973	TGGT	2	8	127339	127346	0 %	50 %	50 %	0 %	159901609
2502	NC_009973	GGC	2	6	127398	127403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901609
2503	NC_009973	GGA	2	6	127446	127451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901609
2504	NC_009973	GAT	2	6	127533	127538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901609
2505	NC_009973	TGG	3	9	127568	127576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901609
2506	NC_009973	GTG	2	6	127660	127665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901609
2507	NC_009973	ACG	2	6	127692	127697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901609
2508	NC_009973	TCG	2	6	127737	127742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901609
2509	NC_009973	CTG	2	6	127771	127776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901609
2510	NC_009973	GCC	2	6	127788	127793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901609
2511	NC_009973	GCC	2	6	127809	127814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901609
2512	NC_009973	GCA	3	9	127924	127932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901609
2513	NC_009973	G	6	6	127994	127999	0 %	0 %	100 %	0 %	159901609
2514	NC_009973	TCG	2	6	128013	128018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901609
2515	NC_009973	GCG	2	6	128043	128048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901609
2516	NC_009973	CCT	2	6	128063	128068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901609
2517	NC_009973	TTTGG	2	10	128169	128178	0 %	60 %	40 %	0 %	159901609
2518	NC_009973	GCT	2	6	128345	128350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901609
2519	NC_009973	TGG	2	6	128354	128359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901609
2520	NC_009973	CTG	3	9	128370	128378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901609
2521	NC_009973	TGGC	2	8	128384	128391	0 %	25 %	50 %	25 %	159901609
2522	NC_009973	GCC	2	6	128398	128403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901609
2523	NC_009973	ATC	2	6	128429	128434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901609
2524	NC_009973	TCG	2	6	128448	128453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_009973	ACA	2	6	128507	128512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_009973	TC	4	8	128574	128581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_009973	TCC	2	6	128659	128664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_009973	ACC	2	6	128678	128683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_009973	TCT	2	6	128722	128727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_009973	ATGG	2	8	128732	128739	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_009973	ACA	2	6	128824	128829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_009973	CAT	2	6	128866	128871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_009973	TCA	2	6	128931	128936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901610
2534	NC_009973	GCCC	2	8	128957	128964	0 %	0 %	25 %	75 %	159901610
2535	NC_009973	TGT	2	6	129008	129013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901610
2536	NC_009973	CCT	2	6	129114	129119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901610
2537	NC_009973	CCTA	2	8	129121	129128	25 %	25 %	0 %	50 %	159901610
2538	NC_009973	ATA	2	6	129257	129262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901610
2539	NC_009973	CAA	2	6	129319	129324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901610
2540	NC_009973	TGC	2	6	129426	129431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901610
2541	NC_009973	GGC	2	6	129480	129485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901610
2542	NC_009973	TGA	2	6	129549	129554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901610
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2544	NC_009973	GGC	2	6	129681	129686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901610
2545	NC_009973	GGA	2	6	129819	129824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901610
2546	NC_009973	ATA	2	6	129860	129865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901610
2547	NC_009973	GGC	2	6	129882	129887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901610
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2551	NC_009973	CAA	2	6	130123	130128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901610
2552	NC_009973	ATC	2	6	130240	130245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901610
2553	NC_009973	ATA	2	6	130262	130267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901610
2554	NC_009973	GCC	2	6	130285	130290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901610
2555	NC_009973	AGTC	2	8	130321	130328	25 %	25 %	25 %	25 %	159901610
2556	NC_009973	ATGA	2	8	130387	130394	50 %	25 %	25 %	0 %	159901610
2557	NC_009973	TCA	2	6	130400	130405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901610
2558	NC_009973	AAT	2	6	130462	130467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901610
2559	NC_009973	TTCC	2	8	130514	130521	0 %	50 %	0 %	50 %	159901610
2560	NC_009973	ACC	2	6	130543	130548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901610
2561	NC_009973	GTG	2	6	130566	130571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_009973	TGA	2	6	130613	130618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_009973	CTT	2	6	130688	130693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_009973	CTG	2	6	130789	130794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_009973	GCCA	2	8	130796	130803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2566	NC_009973	GCA	2	6	130841	130846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_009973	G	6	6	130859	130864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_009973	ACG	2	6	130896	130901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_009973	GGAG	2	8	130936	130943	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_009973	ACG	2	6	130960	130965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_009973	GAT	2	6	130997	131002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_009973	GATC	2	8	131032	131039	25 %	25 %	25 %	25 %	159901611
2573	NC_009973	TGA	2	6	131076	131081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901611
2574	NC_009973	GCT	2	6	131096	131101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901611
2575	NC_009973	GCCTGC	2	12	131102	131113	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159901611
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2578	NC_009973	ACG	2	6	131414	131419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901611
2579	NC_009973	TCC	2	6	131456	131461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_009973	CAT	2	6	131473	131478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_009973	ATC	2	6	131511	131516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_009973	CCAA	2	8	131543	131550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_009973	ACC	2	6	131688	131693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_009973	ACC	2	6	131734	131739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2585	NC_009973	GCA	2	6	131813	131818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_009973	TGG	2	6	131819	131824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_009973	CAT	2	6	131858	131863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_009973	TCGCCA	2	12	131922	131933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2589	NC_009973	TGG	2	6	132040	132045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901612
2590	NC_009973	GCTC	2	8	132079	132086	0 %	25 %	25 %	50 %	159901612
2591	NC_009973	CGT	2	6	132153	132158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901612
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2593	NC_009973	GCT	2	6	132266	132271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901612
2594	NC_009973	GCG	3	9	132305	132313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901612
2595	NC_009973	TCG	2	6	132343	132348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901612
2596	NC_009973	CA	3	6	132351	132356	50 %	0 %	0 %	50 %	159901612
2597	NC_009973	CTG	2	6	132387	132392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901612
2598	NC_009973	TGC	2	6	132430	132435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901612
2599	NC_009973	CGGGG	2	10	132475	132484	0 %	0 %	80 %	20 %	159901612
2600	NC_009973	GCG	2	6	132494	132499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901612
2601	NC_009973	CG	3	6	132517	132522	0 %	0 %	50 %	50 %	159901612
2602	NC_009973	CCG	2	6	132539	132544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901612
2603	NC_009973	GCC	2	6	132562	132567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901612
2604	NC_009973	CAC	2	6	132579	132584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901612
2605	NC_009973	GCT	3	9	132599	132607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901612
2606	NC_009973	CCA	2	6	132638	132643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901612
2607	NC_009973	CGC	2	6	132675	132680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901612
2608	NC_009973	CCA	2	6	132689	132694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901612
2609	NC_009973	TGG	2	6	132708	132713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901612
2610	NC_009973	GGC	2	6	132717	132722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901612
2611	NC_009973	CTG	2	6	132768	132773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901612
2612	NC_009973	GCCA	2	8	132806	132813	25 %	0 %	25 %	50 %	159901612
2613	NC_009973	CAC	2	6	132844	132849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901612
2614	NC_009973	GCA	2	6	132881	132886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901612
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2617	NC_009973	GCC	2	6	133010	133015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901612
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2619	NC_009973	AGC	2	6	133060	133065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901612
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2621	NC_009973	CGG	2	6	133173	133178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901612
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2991	NC_009973	GCA	3	9	147617	147625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901619
2992	NC_009973	CGT	2	6	147639	147644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901619
2993	NC_009973	CAA	2	6	147654	147659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901619
2994	NC_009973	CGA	2	6	147662	147667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901619
2995	NC_009973	CGC	2	6	147718	147723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901619
2996	NC_009973	TCC	2	6	147778	147783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901619
2997	NC_009973	CAA	2	6	147821	147826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901619
2998	NC_009973	AGGC	2	8	148034	148041	25 %	0 %	50 %	25 %	159901619
2999	NC_009973	AGC	2	6	148057	148062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901619
3000	NC_009973	GGC	2	6	148111	148116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901619

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