MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009973	GCT	2	6	50164	50169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901548
1002	NC_009973	CGC	2	6	50185	50190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901548
1003	NC_009973	CAA	3	9	50413	50421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901548
1004	NC_009973	ATC	2	6	50501	50506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901548
1005	NC_009973	ACG	2	6	50577	50582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901548
1006	NC_009973	GGC	2	6	50723	50728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901548
1007	NC_009973	CTA	2	6	50764	50769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901548
1008	NC_009973	CTA	2	6	50788	50793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901548
1009	NC_009973	GAT	2	6	50806	50811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901548
1010	NC_009973	CGA	2	6	50818	50823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901548
1011	NC_009973	GGC	2	6	50831	50836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901548
1012	NC_009973	CGC	2	6	50847	50852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901548
1013	NC_009973	AAG	2	6	50885	50890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901548
1014	NC_009973	GGC	2	6	50918	50923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901548
1015	NC_009973	GGACA	2	10	50928	50937	40 %	0 %	40 %	20 %	159901548
1016	NC_009973	CAA	2	6	50962	50967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901548
1017	NC_009973	CAA	2	6	51040	51045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901548
1018	NC_009973	CCAACG	2	12	51054	51065	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	159901548
1019	NC_009973	CGC	2	6	51312	51317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901548
1020	NC_009973	TGC	2	6	51321	51326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901548
1021	NC_009973	CCG	2	6	51338	51343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901548
1022	NC_009973	GTC	2	6	51386	51391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901548
1023	NC_009973	GTCA	2	8	51534	51541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_009973	TCC	2	6	51562	51567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_009973	CAT	2	6	51616	51621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009973	TGG	2	6	51698	51703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009973	TGGC	2	8	51714	51721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_009973	ATCC	2	8	51759	51766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_009973	CAG	2	6	51820	51825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009973	GCC	2	6	51836	51841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_009973	CGC	2	6	51883	51888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_009973	GAC	2	6	51905	51910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_009973	CTGC	2	8	51975	51982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_009973	ATG	2	6	51995	52000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009973	TTGGAT	2	12	52042	52053	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009973	CGT	2	6	52062	52067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009973	TGA	2	6	52104	52109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009973	AGC	2	6	52142	52147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_009973	TGC	2	6	52154	52159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009973	CAG	2	6	52176	52181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_009973	CTA	2	6	52195	52200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_009973	TG	3	6	52281	52286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009973	ATC	2	6	52364	52369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_009973	GCG	2	6	52420	52425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009973	CTGCA	2	10	52556	52565	20 %	20 %	20 %	40 %	159901549
1046	NC_009973	ACC	2	6	52577	52582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901549
1047	NC_009973	CCA	2	6	52591	52596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901549
1048	NC_009973	GCC	2	6	52725	52730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901549
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1050	NC_009973	ACCG	2	8	52836	52843	25 %	0 %	25 %	50 %	159901549
1051	NC_009973	CTGG	2	8	52868	52875	0 %	25 %	50 %	25 %	159901549
1052	NC_009973	ATG	2	6	52902	52907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901549
1053	NC_009973	GCT	2	6	53109	53114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_009973	TGG	2	6	53136	53141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009973	AAG	2	6	53148	53153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009973	ATAG	2	8	53212	53219	50 %	25 %	25 %	0 %	159901550
1057	NC_009973	TCG	2	6	53226	53231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901550
1058	NC_009973	GCG	2	6	53254	53259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901550
1059	NC_009973	TTG	2	6	53280	53285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901550
1060	NC_009973	GGC	2	6	53369	53374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901550
1061	NC_009973	GGC	3	9	53414	53422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901550
1062	NC_009973	CCG	2	6	53452	53457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901550
1063	NC_009973	GTG	2	6	53478	53483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901551
1064	NC_009973	T	7	7	53519	53525	0 %	100 %	0 %	0 %	159901551
1065	NC_009973	GAT	2	6	53533	53538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901551
1066	NC_009973	CGG	2	6	53582	53587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901551
1067	NC_009973	GTC	2	6	53682	53687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901551
1068	NC_009973	GAG	2	6	53705	53710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901551
1069	NC_009973	T	6	6	53860	53865	0 %	100 %	0 %	0 %	159901551
1070	NC_009973	AGA	2	6	54025	54030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009973	GGC	2	6	54050	54055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_009973	CACC	2	8	54092	54099	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1073	NC_009973	CTC	2	6	54167	54172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_009973	CG	3	6	54190	54195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_009973	TCC	2	6	54207	54212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_009973	T	6	6	54248	54253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009973	TGG	2	6	54299	54304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901552
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1080	NC_009973	CAC	2	6	54431	54436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901552
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1082	NC_009973	ACC	2	6	54453	54458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901552
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1085	NC_009973	CAC	2	6	54580	54585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901552
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1088	NC_009973	GC	3	6	54957	54962	0 %	0 %	50 %	50 %	159901553
1089	NC_009973	CTT	2	6	55036	55041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901553
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1094	NC_009973	GTG	2	6	55262	55267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901553
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1097	NC_009973	AG	3	6	55355	55360	50 %	0 %	50 %	0 %	159901553
1098	NC_009973	TCAT	2	8	55371	55378	25 %	50 %	0 %	25 %	159901553
1099	NC_009973	ATT	2	6	55398	55403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901553
1100	NC_009973	CGG	2	6	55419	55424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901553
1101	NC_009973	GAC	2	6	55439	55444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901553
1102	NC_009973	CCGC	2	8	55555	55562	0 %	0 %	25 %	75 %	159901553
1103	NC_009973	TTC	2	6	55595	55600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901553
1104	NC_009973	CGA	2	6	55663	55668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901553
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1106	NC_009973	GCG	2	6	55795	55800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009973	CGC	2	6	55805	55810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_009973	GCG	2	6	55832	55837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009973	CCAT	2	8	55916	55923	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_009973	CAT	2	6	55946	55951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_009973	GCG	2	6	56020	56025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009973	GCT	2	6	56049	56054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_009973	GGC	2	6	56067	56072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009973	CCA	2	6	56082	56087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_009973	ACC	2	6	56107	56112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_009973	CCA	2	6	56153	56158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_009973	ATCG	2	8	56185	56192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_009973	GCT	2	6	56238	56243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009973	T	6	6	56298	56303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009973	GCG	2	6	56349	56354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_009973	TG	3	6	56356	56361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1124	NC_009973	GCG	2	6	56451	56456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_009973	TG	3	6	56458	56463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009973	ACG	2	6	56494	56499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1128	NC_009973	GCC	2	6	56532	56537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_009973	G	6	6	56575	56580	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_009973	TCG	2	6	56701	56706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_009973	TGC	2	6	56720	56725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_009973	GCT	2	6	56742	56747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_009973	TGG	2	6	56809	56814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901554
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1253	NC_009973	CGG	2	6	63500	63505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_009973	T	6	6	63510	63515	0 %	100 %	0 %	0 %	159901558
1255	NC_009973	CCCG	2	8	63519	63526	0 %	0 %	25 %	75 %	159901558
1256	NC_009973	GCG	2	6	63549	63554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901558
1257	NC_009973	GCGCA	2	10	63604	63613	20 %	0 %	40 %	40 %	159901558
1258	NC_009973	ACA	2	6	63619	63624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901558
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