MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009973	CCG	2	6	292900	292905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901713
6002	NC_009973	CAC	2	6	292992	292997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901713
6003	NC_009973	TGC	2	6	293036	293041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901713
6004	NC_009973	GCA	2	6	293058	293063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901713
6005	NC_009973	CAG	2	6	293126	293131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901713
6006	NC_009973	AGG	2	6	293148	293153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901713
6007	NC_009973	CAACA	2	10	293204	293213	60 %	0 %	0 %	40 %	159901713
6008	NC_009973	CCA	2	6	293303	293308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901713
6009	NC_009973	TTG	2	6	293336	293341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901713
6010	NC_009973	A	6	6	293424	293429	100 %	0 %	0 %	0 %	159901713
6011	NC_009973	ATC	2	6	293544	293549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901713
6012	NC_009973	ACG	2	6	293583	293588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_009973	AGC	2	6	293676	293681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901714
6014	NC_009973	CAAGG	2	10	293768	293777	40 %	0 %	40 %	20 %	159901714
6015	NC_009973	GCC	3	9	293814	293822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901714
6016	NC_009973	CAT	2	6	293860	293865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901714
6017	NC_009973	TCA	2	6	293875	293880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901714
6018	NC_009973	GTC	2	6	293906	293911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901714
6019	NC_009973	GGT	2	6	293946	293951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901714
6020	NC_009973	TACA	2	8	294068	294075	50 %	25 %	0 %	25 %	159901714
6021	NC_009973	TTC	2	6	294081	294086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901714
6022	NC_009973	GCA	2	6	294159	294164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901714
6023	NC_009973	CCTA	2	8	294245	294252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_009973	GCAA	2	8	294299	294306	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_009973	AAT	2	6	294328	294333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_009973	GCAC	2	8	294515	294522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_009973	TGC	2	6	294547	294552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_009973	CTG	2	6	294621	294626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901715
6029	NC_009973	TGC	2	6	294690	294695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901715
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6032	NC_009973	TGC	2	6	295008	295013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901715
6033	NC_009973	GTG	2	6	295036	295041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901715
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6040	NC_009973	GCTG	2	8	295521	295528	0 %	25 %	50 %	25 %	159901715
6041	NC_009973	CAA	2	6	295583	295588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901715
6042	NC_009973	CGAT	2	8	295605	295612	25 %	25 %	25 %	25 %	159901715
6043	NC_009973	TCA	2	6	295644	295649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_009973	AC	3	6	295654	295659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_009973	CAGGG	2	10	295668	295677	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6046	NC_009973	CAC	2	6	295731	295736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_009973	TAT	2	6	295825	295830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6050	NC_009973	CGG	2	6	295880	295885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_009973	TGC	2	6	295948	295953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_009973	TTC	2	6	295956	295961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_009973	GAC	2	6	296034	296039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6055	NC_009973	GAT	2	6	296152	296157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_009973	GCG	2	6	296185	296190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_009973	GTC	2	6	296216	296221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_009973	CCT	2	6	296271	296276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_009973	CAG	2	6	296287	296292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_009973	GAC	2	6	296331	296336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_009973	CG	3	6	296337	296342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_009973	TAC	2	6	296353	296358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_009973	CGGG	2	8	296400	296407	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_009973	GCA	2	6	296448	296453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6066	NC_009973	CG	3	6	296520	296525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_009973	TGGC	2	8	296553	296560	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6070	NC_009973	GCA	2	6	296610	296615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_009973	CTG	2	6	296633	296638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6073	NC_009973	GATG	2	8	296700	296707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_009973	ACTCT	2	10	296804	296813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6077	NC_009973	CATC	2	8	296978	296985	25 %	25 %	0 %	50 %	159901716
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6089	NC_009973	CTGC	2	8	297398	297405	0 %	25 %	25 %	50 %	159901716
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6106	NC_009973	CCAC	2	8	298207	298214	25 %	0 %	0 %	75 %	159901716
6107	NC_009973	TCA	2	6	298318	298323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901716
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6123	NC_009973	AT	4	8	299431	299438	50 %	50 %	0 %	0 %	159901717
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6125	NC_009973	TTG	2	6	299518	299523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901717
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6251	NC_009973	GAC	2	6	305168	305173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901719
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6493	NC_009973	TCA	2	6	315691	315696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901726
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6495	NC_009973	AGA	2	6	315733	315738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901726
6496	NC_009973	AGCGA	2	10	315752	315761	40 %	0 %	40 %	20 %	159901726
6497	NC_009973	AT	3	6	315793	315798	50 %	50 %	0 %	0 %	159901726
6498	NC_009973	GAT	2	6	315803	315808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901726
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6500	NC_009973	AGA	2	6	315870	315875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901726

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