MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009973	TGCC	2	8	242032	242039	0 %	25 %	25 %	50 %	159901676
5003	NC_009973	ATT	2	6	242194	242199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901676
5004	NC_009973	AAT	2	6	242232	242237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901676
5005	NC_009973	TAAT	2	8	242298	242305	50 %	50 %	0 %	0 %	159901676
5006	NC_009973	TAC	2	6	242361	242366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
5007	NC_009973	CTT	2	6	242412	242417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901676
5008	NC_009973	GGAT	2	8	242418	242425	25 %	25 %	50 %	0 %	159901676
5009	NC_009973	CAT	2	6	242458	242463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
5010	NC_009973	ATG	2	6	242531	242536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901676
5011	NC_009973	TG	3	6	242535	242540	0 %	50 %	50 %	0 %	159901676
5012	NC_009973	TGAT	2	8	242543	242550	25 %	50 %	25 %	0 %	159901676
5013	NC_009973	TCA	2	6	242693	242698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
5014	NC_009973	ATC	2	6	242707	242712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
5015	NC_009973	TATT	2	8	242720	242727	25 %	75 %	0 %	0 %	159901676
5016	NC_009973	GCG	2	6	242780	242785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901676
5017	NC_009973	TCA	2	6	242825	242830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
5018	NC_009973	A	6	6	242850	242855	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
5019	NC_009973	ATT	2	6	242887	242892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901676
5020	NC_009973	GCT	3	9	242900	242908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901676
5021	NC_009973	AT	3	6	242915	242920	50 %	50 %	0 %	0 %	159901676
5022	NC_009973	TG	3	6	242957	242962	0 %	50 %	50 %	0 %	159901676
5023	NC_009973	A	6	6	242980	242985	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
5024	NC_009973	T	7	7	242989	242995	0 %	100 %	0 %	0 %	159901676
5025	NC_009973	TAC	2	6	243012	243017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
5026	NC_009973	A	6	6	243079	243084	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
5027	NC_009973	ATT	2	6	243151	243156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901676
5028	NC_009973	TCTT	2	8	243239	243246	0 %	75 %	0 %	25 %	159901676
5029	NC_009973	CAC	2	6	243303	243308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901676
5030	NC_009973	AGC	2	6	243310	243315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901676
5031	NC_009973	CGAT	2	8	243356	243363	25 %	25 %	25 %	25 %	159901676
5032	NC_009973	TTGC	2	8	243486	243493	0 %	50 %	25 %	25 %	159901676
5033	NC_009973	AGT	2	6	243517	243522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901676
5034	NC_009973	TAA	2	6	243525	243530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901676
5035	NC_009973	GTA	2	6	243542	243547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901676
5036	NC_009973	TGT	2	6	243560	243565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901676
5037	NC_009973	TAG	2	6	243618	243623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901676
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5040	NC_009973	ATT	2	6	243701	243706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901676
5041	NC_009973	TCA	2	6	243716	243721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
5042	NC_009973	CGTG	2	8	243798	243805	0 %	25 %	50 %	25 %	159901676
5043	NC_009973	TCG	2	6	243920	243925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901676
5044	NC_009973	GTG	2	6	244090	244095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901676
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5048	NC_009973	TGC	2	6	244187	244192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901676
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5054	NC_009973	CAATA	2	10	244683	244692	60 %	20 %	0 %	20 %	159901676
5055	NC_009973	CACGAT	2	12	244744	244755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159901676
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5059	NC_009973	AGAT	2	8	244835	244842	50 %	25 %	25 %	0 %	159901676
5060	NC_009973	GA	3	6	244865	244870	50 %	0 %	50 %	0 %	159901676
5061	NC_009973	A	6	6	244885	244890	100 %	0 %	0 %	0 %	159901676
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5070	NC_009973	GCG	2	6	245488	245493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901676
5071	NC_009973	CAG	2	6	245555	245560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901676
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5123	NC_009973	CTG	2	6	247766	247771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901679
5124	NC_009973	GTT	2	6	247781	247786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901679
5125	NC_009973	ATT	2	6	247829	247834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901679
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5127	NC_009973	TGC	2	6	247884	247889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901679
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5129	NC_009973	TGT	2	6	247979	247984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5131	NC_009973	AGT	2	6	248014	248019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_009973	CGT	2	6	248023	248028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_009973	TGATA	2	10	248041	248050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_009973	TTC	2	6	248109	248114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901680
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5233	NC_009973	A	6	6	253705	253710	100 %	0 %	0 %	0 %	159901681
5234	NC_009973	CAG	2	6	253762	253767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901681
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5239	NC_009973	CAGCG	2	10	253961	253970	20 %	0 %	40 %	40 %	159901681
5240	NC_009973	GTT	2	6	253971	253976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901681
5241	NC_009973	CTG	2	6	253985	253990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901681
5242	NC_009973	GCC	3	9	254082	254090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901682
5243	NC_009973	CGC	2	6	254144	254149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901682
5244	NC_009973	CAA	2	6	254167	254172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901682
5245	NC_009973	T	6	6	254245	254250	0 %	100 %	0 %	0 %	159901682
5246	NC_009973	GGAATC	2	12	254304	254315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159901682
5247	NC_009973	GTGACC	2	12	254316	254327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159901682
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5252	NC_009973	GCAA	2	8	254565	254572	50 %	0 %	25 %	25 %	159901682
5253	NC_009973	GGC	2	6	254660	254665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901682
5254	NC_009973	CAGATC	2	12	254699	254710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159901682
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5256	NC_009973	GAT	2	6	254808	254813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5258	NC_009973	TGGCG	2	10	254986	254995	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5259	NC_009973	TGA	2	6	255021	255026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5261	NC_009973	GTTG	2	8	255109	255116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_009973	TAG	2	6	255146	255151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_009973	GAA	2	6	255175	255180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_009973	CCAA	2	8	255288	255295	50 %	0 %	0 %	50 %	159901683
5266	NC_009973	GGAA	2	8	255335	255342	50 %	0 %	50 %	0 %	159901683
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5344	NC_009973	AGG	2	6	259658	259663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5366	NC_009973	AGC	2	6	261396	261401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901689
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5370	NC_009973	TCG	2	6	261558	261563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5371	NC_009973	CAG	3	9	261585	261593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5494	NC_009973	AAT	2	6	268309	268314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901694
5495	NC_009973	CTG	2	6	268343	268348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901694
5496	NC_009973	GCG	2	6	268372	268377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901694
5497	NC_009973	TGG	2	6	268473	268478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901694
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