MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009973	CATG	2	8	218491	218498	25 %	25 %	25 %	25 %	159901660
4502	NC_009973	TGC	2	6	218517	218522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
4503	NC_009973	ACT	2	6	218531	218536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901660
4504	NC_009973	TGGTA	2	10	218622	218631	20 %	40 %	40 %	0 %	159901660
4505	NC_009973	GCA	2	6	218701	218706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901660
4506	NC_009973	GAA	2	6	218722	218727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901660
4507	NC_009973	TGA	2	6	218847	218852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901660
4508	NC_009973	A	8	8	218883	218890	100 %	0 %	0 %	0 %	159901660
4509	NC_009973	CTA	2	6	218895	218900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901660
4510	NC_009973	ATT	3	9	218926	218934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901660
4511	NC_009973	GTT	2	6	218937	218942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901660
4512	NC_009973	ATT	2	6	218962	218967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901660
4513	NC_009973	ATC	2	6	219041	219046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901660
4514	NC_009973	AC	4	8	219049	219056	50 %	0 %	0 %	50 %	159901660
4515	NC_009973	CTT	2	6	219100	219105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901660
4516	NC_009973	GAC	2	6	219119	219124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901660
4517	NC_009973	CCTG	2	8	219188	219195	0 %	25 %	25 %	50 %	159901660
4518	NC_009973	TCG	2	6	219199	219204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901660
4519	NC_009973	AAGA	2	8	219211	219218	75 %	0 %	25 %	0 %	159901660
4520	NC_009973	ATT	2	6	219232	219237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901660
4521	NC_009973	ATC	2	6	219260	219265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901660
4522	NC_009973	TTC	2	6	219305	219310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901660
4523	NC_009973	TTC	2	6	219380	219385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901660
4524	NC_009973	ACAA	2	8	219394	219401	75 %	0 %	0 %	25 %	159901660
4525	NC_009973	TGC	2	6	219417	219422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_009973	CAA	2	6	219449	219454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_009973	AAG	2	6	219472	219477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901661
4528	NC_009973	CATGC	2	10	219480	219489	20 %	20 %	20 %	40 %	159901661
4529	NC_009973	TAA	2	6	219513	219518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901661
4530	NC_009973	CCG	2	6	219559	219564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901661
4531	NC_009973	AG	3	6	219610	219615	50 %	0 %	50 %	0 %	159901661
4532	NC_009973	CAT	2	6	219637	219642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901661
4533	NC_009973	CAA	2	6	219777	219782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901661
4534	NC_009973	ATG	2	6	219833	219838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901661
4535	NC_009973	GA	3	6	219952	219957	50 %	0 %	50 %	0 %	159901661
4536	NC_009973	GCGA	2	8	219962	219969	25 %	0 %	50 %	25 %	159901661
4537	NC_009973	CTC	2	6	220002	220007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901661
4538	NC_009973	ACG	2	6	220066	220071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901661
4539	NC_009973	CAA	2	6	220129	220134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901661
4540	NC_009973	TGA	2	6	220241	220246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901661
4541	NC_009973	ACG	2	6	220248	220253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901661
4542	NC_009973	A	6	6	220306	220311	100 %	0 %	0 %	0 %	159901661
4543	NC_009973	CAA	2	6	220338	220343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901661
4544	NC_009973	AATT	2	8	220408	220415	50 %	50 %	0 %	0 %	159901661
4545	NC_009973	ATAA	2	8	220510	220517	75 %	25 %	0 %	0 %	159901661
4546	NC_009973	AGA	2	6	220534	220539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901661
4547	NC_009973	GTT	2	6	220543	220548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901661
4548	NC_009973	A	6	6	220627	220632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_009973	CAT	2	6	220644	220649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_009973	GCA	2	6	220705	220710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_009973	TAA	2	6	220761	220766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_009973	ATG	2	6	220814	220819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_009973	TGC	2	6	220847	220852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_009973	GCA	2	6	220867	220872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_009973	GCG	2	6	220917	220922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901662
4556	NC_009973	GAA	2	6	220923	220928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901662
4557	NC_009973	TGG	2	6	220932	220937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901662
4558	NC_009973	GT	3	6	220944	220949	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4559	NC_009973	GT	3	6	220956	220961	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4560	NC_009973	GTTG	2	8	220972	220979	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4561	NC_009973	GTTG	2	8	221014	221021	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4562	NC_009973	TCG	2	6	221040	221045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901662
4563	NC_009973	GTTG	2	8	221062	221069	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4564	NC_009973	TCG	2	6	221088	221093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901662
4565	NC_009973	GTTG	2	8	221110	221117	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4566	NC_009973	GTTG	2	8	221152	221159	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4567	NC_009973	TCG	2	6	221178	221183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901662
4568	NC_009973	GTTG	2	8	221200	221207	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4569	NC_009973	GT	3	6	221208	221213	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4570	NC_009973	GTTG	2	8	221242	221249	0 %	50 %	50 %	0 %	159901662
4571	NC_009973	CGTTGG	2	12	221263	221274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159901662
4572	NC_009973	A	6	6	221323	221328	100 %	0 %	0 %	0 %	159901662
4573	NC_009973	TTC	2	6	221365	221370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901662
4574	NC_009973	CTGC	2	8	221388	221395	0 %	25 %	25 %	50 %	159901662
4575	NC_009973	GAT	2	6	221482	221487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901662
4576	NC_009973	G	6	6	221504	221509	0 %	0 %	100 %	0 %	159901662
4577	NC_009973	AGGA	2	8	221615	221622	50 %	0 %	50 %	0 %	159901662
4578	NC_009973	CG	3	6	221724	221729	0 %	0 %	50 %	50 %	159901662
4579	NC_009973	GGACT	2	10	221785	221794	20 %	20 %	40 %	20 %	159901662
4580	NC_009973	TCCG	2	8	221803	221810	0 %	25 %	25 %	50 %	159901662
4581	NC_009973	GACC	2	8	221830	221837	25 %	0 %	25 %	50 %	159901662
4582	NC_009973	GC	3	6	221862	221867	0 %	0 %	50 %	50 %	159901662
4583	NC_009973	GCG	2	6	221886	221891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901662
4584	NC_009973	TAGA	2	8	221911	221918	50 %	25 %	25 %	0 %	159901662
4585	NC_009973	CCA	2	6	221943	221948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901662
4586	NC_009973	CCCACC	2	12	221960	221971	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	159901662
4587	NC_009973	GAC	2	6	222008	222013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901662
4588	NC_009973	CCT	2	6	222037	222042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_009973	GCA	2	6	222050	222055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_009973	TGA	2	6	222071	222076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_009973	GCC	2	6	222120	222125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_009973	ACA	2	6	222186	222191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_009973	TGT	2	6	222394	222399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_009973	ATG	2	6	222623	222628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901663
4595	NC_009973	CCA	2	6	222672	222677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901663
4596	NC_009973	CGC	2	6	222704	222709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901663
4597	NC_009973	CGC	2	6	222764	222769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901663
4598	NC_009973	TCA	2	6	222849	222854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901663
4599	NC_009973	AGA	2	6	222999	223004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901663
4600	NC_009973	GAGCCG	2	12	223043	223054	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159901663
4601	NC_009973	ATC	2	6	223089	223094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901663
4602	NC_009973	G	6	6	223114	223119	0 %	0 %	100 %	0 %	159901663
4603	NC_009973	GCG	2	6	223161	223166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901663
4604	NC_009973	CG	3	6	223199	223204	0 %	0 %	50 %	50 %	159901663
4605	NC_009973	TGCAGG	2	12	223265	223276	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4606	NC_009973	CAT	2	6	223333	223338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_009973	CCA	2	6	223378	223383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_009973	GA	3	6	223439	223444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_009973	AT	3	6	223470	223475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_009973	GTG	2	6	223480	223485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_009973	TGT	2	6	223510	223515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_009973	TCG	2	6	223558	223563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_009973	CTC	2	6	223621	223626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_009973	TGG	2	6	223649	223654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_009973	TGC	2	6	223783	223788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_009973	TCA	2	6	223937	223942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_009973	CT	3	6	223964	223969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_009973	ATC	2	6	223975	223980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_009973	GCTT	2	8	224063	224070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_009973	CGC	2	6	224097	224102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901664
4621	NC_009973	TC	3	6	224138	224143	0 %	50 %	0 %	50 %	159901664
4622	NC_009973	CGT	2	6	224151	224156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901664
4623	NC_009973	TGC	2	6	224187	224192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901664
4624	NC_009973	CG	3	6	224199	224204	0 %	0 %	50 %	50 %	159901664
4625	NC_009973	TCCA	2	8	224212	224219	25 %	25 %	0 %	50 %	159901664
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4995	NC_009973	TAA	3	9	241621	241629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901676
4996	NC_009973	ATCG	2	8	241684	241691	25 %	25 %	25 %	25 %	159901676
4997	NC_009973	ATA	2	6	241820	241825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901676
4998	NC_009973	ATC	2	6	241846	241851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901676
4999	NC_009973	GCA	2	6	241922	241927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901676
5000	NC_009973	AAT	2	6	241942	241947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159901676

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