MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 126959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009972	ATC	2	6	25242	25247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896554
502	NC_009972	TTA	2	6	25280	25285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896554
503	NC_009972	GCG	2	6	25380	25385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896554
504	NC_009972	CAC	3	9	25458	25466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896554
505	NC_009972	CTT	2	6	25544	25549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896554
506	NC_009972	GCATT	2	10	25561	25570	20 %	40 %	20 %	20 %	159896554
507	NC_009972	CCA	2	6	25593	25598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896554
508	NC_009972	CCA	2	6	25697	25702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896554
509	NC_009972	CCGC	2	8	25712	25719	0 %	0 %	25 %	75 %	159896554
510	NC_009972	CAT	2	6	25770	25775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896554
511	NC_009972	CTA	2	6	25785	25790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_009972	GCT	2	6	25794	25799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_009972	GTG	2	6	25953	25958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009972	CTT	2	6	26009	26014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009972	A	6	6	26017	26022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009972	TAG	2	6	26033	26038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009972	CAGCG	2	10	26050	26059	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
518	NC_009972	CTC	2	6	26103	26108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_009972	TGTGG	2	10	26143	26152	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009972	GCA	2	6	26171	26176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896555
521	NC_009972	GTA	2	6	26218	26223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896555
522	NC_009972	TCGATC	2	12	26232	26243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159896555
523	NC_009972	GTT	2	6	26283	26288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896555
524	NC_009972	CTG	2	6	26311	26316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896555
525	NC_009972	CGT	2	6	26364	26369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896555
526	NC_009972	CAG	2	6	26371	26376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896555
527	NC_009972	TGGC	2	8	26506	26513	0 %	25 %	50 %	25 %	159896555
528	NC_009972	AACGA	2	10	26598	26607	60 %	0 %	20 %	20 %	159896555
529	NC_009972	CCA	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896555
530	NC_009972	GGC	2	6	26681	26686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896555
531	NC_009972	TGC	2	6	26755	26760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896555
532	NC_009972	TA	3	6	26806	26811	50 %	50 %	0 %	0 %	159896555
533	NC_009972	CGCAAA	2	12	26883	26894	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	159896555
534	NC_009972	ATT	3	9	27106	27114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896555
535	NC_009972	ATG	2	6	27151	27156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896555
536	NC_009972	TGC	2	6	27179	27184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896555
537	NC_009972	AGCC	2	8	27191	27198	25 %	0 %	25 %	50 %	159896555
538	NC_009972	ACC	2	6	27237	27242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896555
539	NC_009972	CAA	2	6	27294	27299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896555
540	NC_009972	TTC	2	6	27459	27464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896555
541	NC_009972	CTTGG	2	10	27512	27521	0 %	40 %	40 %	20 %	159896555
542	NC_009972	GTACG	2	10	27559	27568	20 %	20 %	40 %	20 %	159896555
543	NC_009972	ACG	2	6	27595	27600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896555
544	NC_009972	AATC	2	8	27655	27662	50 %	25 %	0 %	25 %	159896555
545	NC_009972	GAA	2	6	27674	27679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896555
546	NC_009972	GTT	2	6	27698	27703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896555
547	NC_009972	AGC	2	6	27706	27711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896555
548	NC_009972	AAG	2	6	27814	27819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159896555
549	NC_009972	AGC	2	6	27842	27847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896555
550	NC_009972	GCA	2	6	27916	27921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896555
551	NC_009972	ATT	2	6	28081	28086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896555
552	NC_009972	CGA	2	6	28090	28095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896555
553	NC_009972	TTG	2	6	28176	28181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896555
554	NC_009972	A	7	7	28344	28350	100 %	0 %	0 %	0 %	159896555
555	NC_009972	CTTGG	2	10	28352	28361	0 %	40 %	40 %	20 %	159896555
556	NC_009972	TTGT	2	8	28428	28435	0 %	75 %	25 %	0 %	159896555
557	NC_009972	GCT	2	6	28437	28442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896555
558	NC_009972	GAC	2	6	28444	28449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896555
559	NC_009972	CCG	2	6	28460	28465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896555
560	NC_009972	GCC	2	6	28543	28548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896555
561	NC_009972	GAA	2	6	28568	28573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009972	GCG	2	6	28646	28651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_009972	CTCGC	2	10	28680	28689	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
564	NC_009972	GAT	2	6	28736	28741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009972	CAAA	2	8	28745	28752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_009972	TCG	2	6	28780	28785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_009972	GAA	2	6	28825	28830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009972	GGA	2	6	28839	28844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009972	AGC	2	6	28847	28852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009972	T	6	6	28917	28922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009972	TGA	2	6	28955	28960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896556
572	NC_009972	AAC	2	6	28972	28977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896556
573	NC_009972	GTG	2	6	29011	29016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896556
574	NC_009972	GGC	2	6	29152	29157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896556
575	NC_009972	CTA	2	6	29177	29182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896556
576	NC_009972	CGA	2	6	29186	29191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896556
577	NC_009972	TAT	2	6	29205	29210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159896556
578	NC_009972	AT	3	6	29222	29227	50 %	50 %	0 %	0 %	159896556
579	NC_009972	TC	3	6	29240	29245	0 %	50 %	0 %	50 %	159896556
580	NC_009972	TGG	2	6	29389	29394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896556
581	NC_009972	TTGGC	2	10	29425	29434	0 %	40 %	40 %	20 %	159896556
582	NC_009972	AGCA	2	8	29497	29504	50 %	0 %	25 %	25 %	159896556
583	NC_009972	TGT	2	6	29557	29562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896556
584	NC_009972	TTG	2	6	29568	29573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896556
585	NC_009972	GAT	2	6	29592	29597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896556
586	NC_009972	GCC	3	9	29636	29644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
587	NC_009972	AAT	2	6	29673	29678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159896556
588	NC_009972	CAG	3	9	29683	29691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896556
589	NC_009972	TCA	2	6	29789	29794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159896556
590	NC_009972	GCCAAT	2	12	29802	29813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159896556
591	NC_009972	ACC	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896556
592	NC_009972	GTG	2	6	29935	29940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159896556
593	NC_009972	TGT	2	6	30127	30132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159896556
594	NC_009972	TGC	2	6	30248	30253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896556
595	NC_009972	CAA	2	6	30317	30322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896556
596	NC_009972	TGGCT	2	10	30350	30359	0 %	40 %	40 %	20 %	159896556
597	NC_009972	CAC	2	6	30400	30405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896556
598	NC_009972	TTC	2	6	30431	30436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896556
599	NC_009972	GAC	2	6	30516	30521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896556
600	NC_009972	AGC	2	6	30689	30694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896556
601	NC_009972	ACTGGC	2	12	30711	30722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159896556
602	NC_009972	CGC	2	6	30802	30807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
603	NC_009972	GCCA	2	8	30861	30868	25 %	0 %	25 %	50 %	159896556
604	NC_009972	CGC	2	6	30907	30912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
605	NC_009972	TCT	2	6	30942	30947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159896556
606	NC_009972	CGG	2	6	30960	30965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896556
607	NC_009972	GCC	2	6	30977	30982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
608	NC_009972	GCC	2	6	30990	30995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
609	NC_009972	CCATGC	2	12	31030	31041	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159896556
610	NC_009972	CCG	2	6	31045	31050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896556
611	NC_009972	CAA	2	6	31098	31103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896556
612	NC_009972	CTG	2	6	31113	31118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159896556
613	NC_009972	TGA	2	6	31174	31179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159896556
614	NC_009972	CTA	2	6	31214	31219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_009972	TAG	2	6	31237	31242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009972	GCG	2	6	31350	31355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896557
617	NC_009972	AAC	2	6	31406	31411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896557
618	NC_009972	ACC	2	6	31426	31431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159896557
619	NC_009972	CAG	2	6	31479	31484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159896557
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621	NC_009972	GCC	2	6	31555	31560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896557
622	NC_009972	GCG	2	6	31660	31665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159896557
623	NC_009972	T	6	6	31731	31736	0 %	100 %	0 %	0 %	159896557
624	NC_009972	CAA	2	6	31738	31743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159896557
625	NC_009972	CCG	2	6	31770	31775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159896557
626	NC_009972	C	6	6	31781	31786	0 %	0 %	0 %	100 %	159896557
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