MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 34591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008818	CTC	2	6	552205	552210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027467
11502	NC_008818	GGA	2	6	552212	552217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027467
11503	NC_008818	TAG	2	6	552259	552264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027467
11504	NC_008818	TCT	2	6	552265	552270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027467
11505	NC_008818	TCC	2	6	552298	552303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027467
11506	NC_008818	TACC	2	8	552377	552384	25 %	25 %	0 %	50 %	124027467
11507	NC_008818	ATA	2	6	552446	552451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_008818	TAA	2	6	552454	552459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_008818	TAG	2	6	552469	552474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027468
11510	NC_008818	TGG	2	6	552537	552542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124027468
11511	NC_008818	GT	3	6	552566	552571	0 %	50 %	50 %	0 %	124027468
11512	NC_008818	CAA	2	6	552602	552607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027468
11513	NC_008818	GT	3	6	552633	552638	0 %	50 %	50 %	0 %	124027468
11514	NC_008818	GCT	2	6	552645	552650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027468
11515	NC_008818	TAC	2	6	552657	552662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027468
11516	NC_008818	CT	3	6	552670	552675	0 %	50 %	0 %	50 %	124027468
11517	NC_008818	TTC	2	6	552799	552804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027468
11518	NC_008818	TTTAGC	2	12	552868	552879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	124027468
11519	NC_008818	TCC	2	6	552898	552903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027468
11520	NC_008818	CGA	2	6	552905	552910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027468
11521	NC_008818	CCA	2	6	552955	552960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027468
11522	NC_008818	GAA	2	6	553035	553040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027468
11523	NC_008818	TCT	2	6	553046	553051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027468
11524	NC_008818	GACG	2	8	553058	553065	25 %	0 %	50 %	25 %	124027468
11525	NC_008818	ACG	2	6	553210	553215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027468
11526	NC_008818	CAA	2	6	553220	553225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027468
11527	NC_008818	TGC	2	6	553253	553258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027468
11528	NC_008818	ACC	2	6	553267	553272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027468
11529	NC_008818	CTAGGC	2	12	553358	553369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124027468
11530	NC_008818	GCGCC	2	10	553371	553380	0 %	0 %	40 %	60 %	124027468
11531	NC_008818	GCC	2	6	553437	553442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027468
11532	NC_008818	TC	3	6	553502	553507	0 %	50 %	0 %	50 %	124027468
11533	NC_008818	CGA	2	6	553520	553525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027468
11534	NC_008818	CCA	2	6	553526	553531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027468
11535	NC_008818	AGC	2	6	553603	553608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_008818	CTC	2	6	553664	553669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027469
11537	NC_008818	CAG	2	6	553671	553676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027469
11538	NC_008818	GCG	2	6	553684	553689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027469
11539	NC_008818	AGGCC	2	10	553718	553727	20 %	0 %	40 %	40 %	124027469
11540	NC_008818	CT	3	6	553750	553755	0 %	50 %	0 %	50 %	124027469
11541	NC_008818	GC	3	6	553847	553852	0 %	0 %	50 %	50 %	124027469
11542	NC_008818	TC	3	6	553941	553946	0 %	50 %	0 %	50 %	124027469
11543	NC_008818	GAC	2	6	553998	554003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027469
11544	NC_008818	CAA	2	6	554006	554011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027469
11545	NC_008818	TGGC	2	8	554024	554031	0 %	25 %	50 %	25 %	124027469
11546	NC_008818	AGT	2	6	554053	554058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027469
11547	NC_008818	ATG	2	6	554131	554136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027469
11548	NC_008818	GGT	2	6	554165	554170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_008818	AT	3	6	554205	554210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_008818	TC	3	6	554446	554451	0 %	50 %	0 %	50 %	124027470
11551	NC_008818	CAA	2	6	554500	554505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027470
11552	NC_008818	GACA	2	8	554616	554623	50 %	0 %	25 %	25 %	124027470
11553	NC_008818	CAG	2	6	554657	554662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027470
11554	NC_008818	TCC	2	6	554730	554735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027470
11555	NC_008818	AGG	2	6	554880	554885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027470
11556	NC_008818	GCT	2	6	554932	554937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027470
11557	NC_008818	TCT	2	6	554959	554964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027470
11558	NC_008818	GGC	2	6	555067	555072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027470
11559	NC_008818	ATAC	2	8	555074	555081	50 %	25 %	0 %	25 %	124027470
11560	NC_008818	CGG	2	6	555110	555115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027470
11561	NC_008818	CCT	2	6	555194	555199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027470
11562	NC_008818	CTAG	2	8	555220	555227	25 %	25 %	25 %	25 %	124027471
11563	NC_008818	CGG	2	6	555240	555245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027471
11564	NC_008818	CGC	2	6	555305	555310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124027471
11565	NC_008818	CCA	2	6	555331	555336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027471
11566	NC_008818	CT	3	6	555403	555408	0 %	50 %	0 %	50 %	124027471
11567	NC_008818	GACC	2	8	555413	555420	25 %	0 %	25 %	50 %	124027471
11568	NC_008818	ACC	2	6	555435	555440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027471
11569	NC_008818	GAA	2	6	555678	555683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027471
11570	NC_008818	CTGC	2	8	555691	555698	0 %	25 %	25 %	50 %	124027471
11571	NC_008818	GCTC	2	8	555782	555789	0 %	25 %	25 %	50 %	124027471
11572	NC_008818	GTG	2	6	555914	555919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_008818	TCG	2	6	555991	555996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027472
11574	NC_008818	GGCA	2	8	556057	556064	25 %	0 %	50 %	25 %	124027472
11575	NC_008818	CGA	2	6	556105	556110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027472
11576	NC_008818	GGA	2	6	556228	556233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027472
11577	NC_008818	AGC	2	6	556253	556258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027472
11578	NC_008818	ACAT	2	8	556263	556270	50 %	25 %	0 %	25 %	124027472
11579	NC_008818	CTT	2	6	556390	556395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027472
11580	NC_008818	AGA	2	6	556422	556427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027472
11581	NC_008818	GAA	2	6	556535	556540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027472
11582	NC_008818	ACT	2	6	556570	556575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027472
11583	NC_008818	AAG	2	6	556580	556585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124027472
11584	NC_008818	TAA	2	6	556626	556631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027472
11585	NC_008818	TGA	2	6	556633	556638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027472
11586	NC_008818	AAC	2	6	556677	556682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027472
11587	NC_008818	TAT	2	6	556710	556715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_008818	CT	3	6	556751	556756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11589	NC_008818	AGT	2	6	556769	556774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_008818	AGG	2	6	556829	556834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027473
11591	NC_008818	CTA	2	6	556916	556921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027473
11592	NC_008818	ATGT	2	8	556931	556938	25 %	50 %	25 %	0 %	124027473
11593	NC_008818	TGC	2	6	557092	557097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027473
11594	NC_008818	CAA	2	6	557133	557138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027473
11595	NC_008818	CAG	2	6	557157	557162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027473
11596	NC_008818	AAT	2	6	557182	557187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027473
11597	NC_008818	GAT	2	6	557290	557295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027473
11598	NC_008818	AAGCTA	2	12	557303	557314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	124027473
11599	NC_008818	GTA	2	6	557318	557323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124027473
11600	NC_008818	GGC	2	6	557336	557341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124027473
11601	NC_008818	AAT	2	6	557347	557352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124027473
11602	NC_008818	GCA	2	6	557393	557398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027473
11603	NC_008818	AG	3	6	557444	557449	50 %	0 %	50 %	0 %	124027473
11604	NC_008818	GCA	2	6	557450	557455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027473
11605	NC_008818	CAT	2	6	557613	557618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027473
11606	NC_008818	TTG	2	6	557703	557708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124027473
11607	NC_008818	GAG	2	6	557759	557764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124027473
11608	NC_008818	GAC	2	6	557787	557792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027473
11609	NC_008818	GTC	2	6	557793	557798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124027473
11610	NC_008818	CGA	2	6	557879	557884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027473
11611	NC_008818	CAA	3	9	557894	557902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027473
11612	NC_008818	TCA	2	6	557930	557935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027473
11613	NC_008818	CTT	2	6	557945	557950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124027474
11614	NC_008818	CCA	2	6	557951	557956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124027474
11615	NC_008818	AGCC	2	8	558050	558057	25 %	0 %	25 %	50 %	124027474
11616	NC_008818	AGC	2	6	558149	558154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027474
11617	NC_008818	CAA	2	6	558158	558163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124027474
11618	NC_008818	GCA	2	6	558185	558190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124027474
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11993	NC_008818	CTC	2	6	576212	576217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027489
11994	NC_008818	CCT	2	6	576218	576223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124027489
11995	NC_008818	GAGG	2	8	576288	576295	25 %	0 %	75 %	0 %	124027489
11996	NC_008818	CTA	2	6	576301	576306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124027489
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